Protein–RNA interactions for Protein: P39543

SOP4, Protein SOP4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4P39543 NSR1YGR159C 1245 nt18.6■□□□□ 0.57
SOP4P39543 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.31■□□□□ 0.52
SOP4P39543 NOP1YDL014W 984 nt17.54■□□□□ 0.4
SOP4P39543 MDJ1YFL016C 1536 nt17.09■□□□□ 0.33
SOP4P39543 YKL036CYKL036C 393 nt15.72■□□□□ 0.11
SOP4P39543 YJL027CYJL027C 417 nt15.69■□□□□ 0.1
SOP4P39543 SRX1YKL086W 384 nt15.33■□□□□ 0.04
SOP4P39543 Q0297Q0297 156 nt15.18■□□□□ 0.02
SOP4P39543 DBP2YNL112W 1641 nt14.88□□□□□ -0.03
SOP4P39543 YBR190WYBR190W 312 nt14.65□□□□□ -0.06
SOP4P39543 YCR051WYCR051W 669 nt14.55□□□□□ -0.08
SOP4P39543 RTC3YHR087W 336 nt14.34□□□□□ -0.11
SOP4P39543 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.19□□□□□ -0.14
SOP4P39543 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.19□□□□□ -0.14
SOP4P39543 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.19□□□□□ -0.14
SOP4P39543 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.19□□□□□ -0.14
SOP4P39543 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.19□□□□□ -0.14
SOP4P39543 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.19□□□□□ -0.14
SOP4P39543 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.19□□□□□ -0.14
SOP4P39543 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.19□□□□□ -0.14
SOP4P39543 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.19□□□□□ -0.14
SOP4P39543 CCC1YLR220W 969 nt14.08□□□□□ -0.16
SOP4P39543 SSA3YBL075C 1950 nt14.07□□□□□ -0.16
SOP4P39543 SCS3YGL126W 1143 nt14.05□□□□□ -0.16
SOP4P39543 RVS167YDR388W 1449 nt13.83□□□□□ -0.2
SOP4P39543 PUT4YOR348C 1884 nt13.72□□□□□ -0.21
SOP4P39543 SCJ1YMR214W 1134 nt13.71□□□□□ -0.21
SOP4P39543 RPP1BYDL130W 321 nt13.64□□□□□ -0.23
SOP4P39543 YOL085CYOL085C 342 nt13.64□□□□□ -0.23
SOP4P39543 PKP1YIL042C 1185 nt13.55□□□□□ -0.24
SOP4P39543 ARE1YCR048W 1833 nt13.31□□□□□ -0.28
SOP4P39543 POA1YBR022W 534 nt13.28□□□□□ -0.28
SOP4P39543 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.26□□□□□ -0.29
SOP4P39543 SHR5YOL110W 714 nt13.24□□□□□ -0.29
SOP4P39543 URN1YPR152C 1398 nt13.22□□□□□ -0.29
SOP4P39543 SAH1YER043C 1350 nt13.2□□□□□ -0.3
SOP4P39543 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.17□□□□□ -0.3
SOP4P39543 PET122YER153C 765 nt13.12□□□□□ -0.31
SOP4P39543 OPI9YLR338W 858 nt13.12□□□□□ -0.31
SOP4P39543 DEP1YAL013W 1218 nt13.1□□□□□ -0.31
SOP4P39543 BSC6YOL137W 1494 nt13.08□□□□□ -0.32
SOP4P39543 RPN10YHR200W 807 nt12.86□□□□□ -0.35
SOP4P39543 BUD23YCR047C 828 nt12.84□□□□□ -0.35
SOP4P39543 YDJ1YNL064C 1230 nt12.8□□□□□ -0.36
SOP4P39543 SCR1SCR1 522 nt12.8□□□□□ -0.36
SOP4P39543 SPT5YML010W 3192 nt12.8□□□□□ -0.36
SOP4P39543 YNL208WYNL208W 600 nt12.77□□□□□ -0.37
SOP4P39543 PUN1YLR414C 792 nt12.72□□□□□ -0.37
SOP4P39543 RRN5YLR141W 1092 nt12.69□□□□□ -0.38
SOP4P39543 PTC2YER089C 1395 nt12.69□□□□□ -0.38
SOP4P39543 GAR1YHR089C 618 nt12.65□□□□□ -0.38
SOP4P39543 SSA4YER103W 1929 nt12.64□□□□□ -0.39
SOP4P39543 YJR018WYJR018W 363 nt12.57□□□□□ -0.4
SOP4P39543 NAB2YGL122C 1578 nt12.56□□□□□ -0.4
SOP4P39543 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.42□□□□□ -0.42
SOP4P39543 ATS1YAL020C 1002 nt12.4□□□□□ -0.42
SOP4P39543 FIS1YIL065C 468 nt12.36□□□□□ -0.43
SOP4P39543 MEP2YNL142W 1500 nt12.32□□□□□ -0.44
SOP4P39543 FPR4YLR449W 1179 nt12.31□□□□□ -0.44
SOP4P39543 DAL1YIR027C 1383 nt12.3□□□□□ -0.44
SOP4P39543 YJR120WYJR120W 351 nt12.29□□□□□ -0.44
SOP4P39543 RSB1YOR049C 1065 nt12.28□□□□□ -0.44
SOP4P39543 TIR1YER011W 765 nt12.22□□□□□ -0.45
SOP4P39543 PHO4YFR034C 939 nt12.21□□□□□ -0.45
SOP4P39543 SSA1YAL005C 1929 nt12.2□□□□□ -0.46
SOP4P39543 BDF1YLR399C 2061 nt12.17□□□□□ -0.46
SOP4P39543 INM2YDR287W 879 nt12.16□□□□□ -0.46
SOP4P39543 RPP2BYDR382W 333 nt12.16□□□□□ -0.46
SOP4P39543 DCW1YKL046C 1350 nt12.15□□□□□ -0.46
SOP4P39543 YPS1YLR120C 1710 nt12.14□□□□□ -0.47
SOP4P39543 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.06□□□□□ -0.48
SOP4P39543 TAT1YBR069C 1860 nt12□□□□□ -0.49
SOP4P39543 YBL100CYBL100C 315 nt11.99□□□□□ -0.49
SOP4P39543 YDR095CYDR095C 411 nt11.98□□□□□ -0.49
SOP4P39543 EMI2YDR516C 1503 nt11.96□□□□□ -0.5
SOP4P39543 SRB2YHR041C 633 nt11.94□□□□□ -0.5
SOP4P39543 YBR220CYBR220C 1683 nt11.89□□□□□ -0.51
SOP4P39543 YMR090WYMR090W 684 nt11.88□□□□□ -0.51
SOP4P39543 FUN26YAL022C 1554 nt11.83□□□□□ -0.52
SOP4P39543 BDH2YAL061W 1254 nt11.82□□□□□ -0.52
SOP4P39543 YDL221WYDL221W 552 nt11.81□□□□□ -0.52
SOP4P39543 CAC2YML102W 1407 nt11.8□□□□□ -0.52
SOP4P39543 PTP1YDL230W 1008 nt11.78□□□□□ -0.52
SOP4P39543 ALF1YNL148C 765 nt11.77□□□□□ -0.53
SOP4P39543 RPP2AYOL039W 321 nt11.76□□□□□ -0.53
SOP4P39543 SDH1YKL148C 1923 nt11.76□□□□□ -0.53
SOP4P39543 TRM9YML014W 840 nt11.7□□□□□ -0.54
SOP4P39543 WWM1YFL010C 636 nt11.63□□□□□ -0.55
SOP4P39543 SCC4YER147C 1875 nt11.62□□□□□ -0.55
SOP4P39543 IRC15YPL017C 1500 nt11.61□□□□□ -0.55
SOP4P39543 CCT6YDR188W 1641 nt11.59□□□□□ -0.55
SOP4P39543 PAC11YDR488C 1602 nt11.58□□□□□ -0.56
SOP4P39543 SIS1YNL007C 1059 nt11.58□□□□□ -0.56
SOP4P39543 PST2YDR032C 597 nt11.57□□□□□ -0.56
SOP4P39543 LSM3YLR438C-A 270 nt11.55□□□□□ -0.56
SOP4P39543 PCH2YBR186W 1695 nt11.55□□□□□ -0.56
SOP4P39543 GIS3YLR094C 1509 nt11.55□□□□□ -0.56
SOP4P39543 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.52□□□□□ -0.57
SOP4P39543 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.52□□□□□ -0.57
SOP4P39543 GUT2YIL155C 1950 nt11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.7 ms