Protein–RNA interactions for Protein: P39965

AIM10, Probable proline--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AIM10P39965 NSR1YGR159C 1245 nt18.38■□□□□ 0.53
AIM10P39965 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.11■□□□□ 0.49
AIM10P39965 NOP1YDL014W 984 nt17.44■□□□□ 0.38
AIM10P39965 MDJ1YFL016C 1536 nt16.7■□□□□ 0.26
AIM10P39965 YKL036CYKL036C 393 nt15.73■□□□□ 0.11
AIM10P39965 YJL027CYJL027C 417 nt15.35■□□□□ 0.05
AIM10P39965 SRX1YKL086W 384 nt15.26■□□□□ 0.03
AIM10P39965 Q0297Q0297 156 nt15.17■□□□□ 0.02
AIM10P39965 DBP2YNL112W 1641 nt14.63□□□□□ -0.07
AIM10P39965 YCR051WYCR051W 669 nt14.43□□□□□ -0.1
AIM10P39965 YBR190WYBR190W 312 nt14.34□□□□□ -0.11
AIM10P39965 SCS3YGL126W 1143 nt14.11□□□□□ -0.15
AIM10P39965 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.04□□□□□ -0.16
AIM10P39965 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.04□□□□□ -0.16
AIM10P39965 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.04□□□□□ -0.16
AIM10P39965 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.04□□□□□ -0.16
AIM10P39965 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.04□□□□□ -0.16
AIM10P39965 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.04□□□□□ -0.16
AIM10P39965 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.04□□□□□ -0.16
AIM10P39965 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.04□□□□□ -0.16
AIM10P39965 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.04□□□□□ -0.16
AIM10P39965 RTC3YHR087W 336 nt13.97□□□□□ -0.17
AIM10P39965 CCC1YLR220W 969 nt13.88□□□□□ -0.19
AIM10P39965 YOL085CYOL085C 342 nt13.66□□□□□ -0.22
AIM10P39965 RPP1BYDL130W 321 nt13.6□□□□□ -0.23
AIM10P39965 RVS167YDR388W 1449 nt13.59□□□□□ -0.23
AIM10P39965 PKP1YIL042C 1185 nt13.5□□□□□ -0.25
AIM10P39965 SCJ1YMR214W 1134 nt13.5□□□□□ -0.25
AIM10P39965 SSA3YBL075C 1950 nt13.43□□□□□ -0.26
AIM10P39965 PUT4YOR348C 1884 nt13.34□□□□□ -0.27
AIM10P39965 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.15□□□□□ -0.3
AIM10P39965 SHR5YOL110W 714 nt13.06□□□□□ -0.32
AIM10P39965 PET122YER153C 765 nt13.05□□□□□ -0.32
AIM10P39965 ARE1YCR048W 1833 nt12.97□□□□□ -0.33
AIM10P39965 URN1YPR152C 1398 nt12.95□□□□□ -0.34
AIM10P39965 POA1YBR022W 534 nt12.89□□□□□ -0.35
AIM10P39965 SAH1YER043C 1350 nt12.88□□□□□ -0.35
AIM10P39965 OPI9YLR338W 858 nt12.85□□□□□ -0.35
AIM10P39965 DEP1YAL013W 1218 nt12.84□□□□□ -0.35
AIM10P39965 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.8□□□□□ -0.36
AIM10P39965 SCR1SCR1 522 nt12.75□□□□□ -0.37
AIM10P39965 YDJ1YNL064C 1230 nt12.73□□□□□ -0.37
AIM10P39965 BSC6YOL137W 1494 nt12.68□□□□□ -0.38
AIM10P39965 RRN5YLR141W 1092 nt12.64□□□□□ -0.39
AIM10P39965 RPN10YHR200W 807 nt12.63□□□□□ -0.39
AIM10P39965 YNL208WYNL208W 600 nt12.58□□□□□ -0.4
AIM10P39965 ATS1YAL020C 1002 nt12.52□□□□□ -0.41
AIM10P39965 GAR1YHR089C 618 nt12.49□□□□□ -0.41
AIM10P39965 BUD23YCR047C 828 nt12.46□□□□□ -0.41
AIM10P39965 PUN1YLR414C 792 nt12.46□□□□□ -0.41
AIM10P39965 SPT5YML010W 3192 nt12.42□□□□□ -0.42
AIM10P39965 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.38□□□□□ -0.43
AIM10P39965 PTC2YER089C 1395 nt12.38□□□□□ -0.43
AIM10P39965 YJR018WYJR018W 363 nt12.33□□□□□ -0.44
AIM10P39965 NAB2YGL122C 1578 nt12.27□□□□□ -0.44
AIM10P39965 RSB1YOR049C 1065 nt12.23□□□□□ -0.45
AIM10P39965 SSA1YAL005C 1929 nt12.16□□□□□ -0.46
AIM10P39965 SSA4YER103W 1929 nt12.15□□□□□ -0.46
AIM10P39965 YJR120WYJR120W 351 nt12.11□□□□□ -0.47
AIM10P39965 TIR1YER011W 765 nt12.09□□□□□ -0.47
AIM10P39965 FIS1YIL065C 468 nt12.08□□□□□ -0.48
AIM10P39965 DAL1YIR027C 1383 nt12.03□□□□□ -0.48
AIM10P39965 FPR4YLR449W 1179 nt11.98□□□□□ -0.49
AIM10P39965 MEP2YNL142W 1500 nt11.96□□□□□ -0.5
AIM10P39965 INM2YDR287W 879 nt11.94□□□□□ -0.5
AIM10P39965 RPP2BYDR382W 333 nt11.94□□□□□ -0.5
AIM10P39965 PHO4YFR034C 939 nt11.93□□□□□ -0.5
AIM10P39965 FPS1YLL043W 2010 nt11.87□□□□□ -0.51
AIM10P39965 YPS1YLR120C 1710 nt11.85□□□□□ -0.51
AIM10P39965 SRB2YHR041C 633 nt11.81□□□□□ -0.52
AIM10P39965 DCW1YKL046C 1350 nt11.78□□□□□ -0.52
AIM10P39965 YBL100CYBL100C 315 nt11.75□□□□□ -0.53
AIM10P39965 BDF1YLR399C 2061 nt11.72□□□□□ -0.53
AIM10P39965 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.72□□□□□ -0.53
AIM10P39965 YDR095CYDR095C 411 nt11.71□□□□□ -0.53
AIM10P39965 Q0182Q0182 405 nt11.7□□□□□ -0.54
AIM10P39965 PST2YDR032C 597 nt11.68□□□□□ -0.54
AIM10P39965 BDH2YAL061W 1254 nt11.66□□□□□ -0.54
AIM10P39965 FUN26YAL022C 1554 nt11.62□□□□□ -0.55
AIM10P39965 EMI2YDR516C 1503 nt11.6□□□□□ -0.55
AIM10P39965 NVJ2YPR091C 2313 nt11.58□□□□□ -0.56
AIM10P39965 TAT1YBR069C 1860 nt11.56□□□□□ -0.56
AIM10P39965 PTP1YDL230W 1008 nt11.53□□□□□ -0.56
AIM10P39965 YBR220CYBR220C 1683 nt11.52□□□□□ -0.56
AIM10P39965 WWM1YFL010C 636 nt11.51□□□□□ -0.57
AIM10P39965 YMR090WYMR090W 684 nt11.51□□□□□ -0.57
AIM10P39965 TRM9YML014W 840 nt11.5□□□□□ -0.57
AIM10P39965 ALF1YNL148C 765 nt11.5□□□□□ -0.57
AIM10P39965 CAC2YML102W 1407 nt11.5□□□□□ -0.57
AIM10P39965 RPP2AYOL039W 321 nt11.49□□□□□ -0.57
AIM10P39965 YDL221WYDL221W 552 nt11.48□□□□□ -0.57
AIM10P39965 LSM3YLR438C-A 270 nt11.44□□□□□ -0.58
AIM10P39965 PAC11YDR488C 1602 nt11.42□□□□□ -0.58
AIM10P39965 CCT6YDR188W 1641 nt11.42□□□□□ -0.58
AIM10P39965 SDH1YKL148C 1923 nt11.41□□□□□ -0.58
AIM10P39965 SIS1YNL007C 1059 nt11.38□□□□□ -0.59
AIM10P39965 IRC15YPL017C 1500 nt11.33□□□□□ -0.6
AIM10P39965 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.32□□□□□ -0.6
AIM10P39965 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.32□□□□□ -0.6
AIM10P39965 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.31□□□□□ -0.6
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