RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603538.1

YTHDF3-AS1-201, Transcript of YTHDF3 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

BASIC

Gene YTHDF3-AS1, Length 718 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PZPP20742 1482 aa25.53■■□□□ 1.68
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.53■■□□□ 1.68
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.49■■□□□ 1.67
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TNRQ92752 1358 aa25.47■■□□□ 1.67
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.46■■□□□ 1.67
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.46■■□□□ 1.67
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 KIF3BO15066 747 aa25.45■■□□□ 1.66
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.45■■□□□ 1.66
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.45■■□□□ 1.66
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 NLRP1Q9C000 1473 aa25.41■■□□□ 1.66
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ILDR2Q71H61 639 aa25.4■■□□□ 1.66
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CPS1P31327 1500 aa25.38■■□□□ 1.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MAP3K1Q13233 1512 aa25.38■■□□□ 1.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.37■■□□□ 1.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ABCC3O15438 1527 aa25.37■■□□□ 1.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DEPDC5O75140 1603 aa25.37■■□□□ 1.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.36■■□□□ 1.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.36■■□□□ 1.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.36■■□□□ 1.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MIA2Q96PC5 1412 aa25.36■■□□□ 1.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TSPY4P0CV99 314 aa25.33■■□□□ 1.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TSPY10P0CW01 314 aa25.33■■□□□ 1.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.33■■□□□ 1.65
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.32■■□□□ 1.64
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MED14O60244 1454 aa25.32■■□□□ 1.64
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.32■■□□□ 1.64
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SOCS7O14512 581 aa25.3■■□□□ 1.64
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 IQGAP1P46940 1657 aa25.29■■□□□ 1.64
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.29■■□□□ 1.64
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CEP152O94986 1710 aa25.29■■□□□ 1.64
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ERVK-7P63135 1459 aa25.28■■□□□ 1.64
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.27■■□□□ 1.64
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.25■■□□□ 1.63
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.22■■□□□ 1.63
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SYNMO15061 1565 aa25.22■■□□□ 1.63
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ALKQ9UM73 1620 aa25.2■■□□□ 1.62
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.18■■□□□ 1.62
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ERBINQ96RT1 1412 aa25.18■■□□□ 1.62
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.18■■□□□ 1.62
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.17■■□□□ 1.62
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TOM1O60784 492 aa25.15■■□□□ 1.62
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 KIF15Q9NS87 1388 aa25.15■■□□□ 1.62
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.14■■□□□ 1.62
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ABCC5O15440 1437 aa25.13■■□□□ 1.61
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SLIT1O75093 1534 aa25.12■■□□□ 1.61
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 HSPA1LP34931 641 aa25.12■■□□□ 1.61
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.12■■□□□ 1.61
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PIP4K2BP78356 416 aa25.11■■□□□ 1.61
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.11■■□□□ 1.61
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 DAPK1P53355 1430 aa25.1■■□□□ 1.61
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.07■■□□□ 1.6
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PIK3C2BO00750 1634 aa25.07■■□□□ 1.6
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.05■■□□□ 1.6
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25■■□□□ 1.59
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 KANK1Q14678 1352 aa24.99■■□□□ 1.59
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.99■■□□□ 1.59
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 LTKP29376 864 aa24.97■■□□□ 1.59
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.96■■□□□ 1.59
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.96■■□□□ 1.59
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ADGRL2O95490 1459 aa24.96■■□□□ 1.59
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 APLP2Q06481 763 aa24.95■■□□□ 1.58
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ADGRB3O60242 1522 aa24.93■■□□□ 1.58
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.93■■□□□ 1.58
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 EID1Q9Y6B2 187 aa24.91■■□□□ 1.58
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 NOS1P29475 1434 aa24.91■■□□□ 1.58
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TET3O43151 1660 aa24.88■■□□□ 1.57
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 NWD1Q149M9 1564 aa24.87■■□□□ 1.57
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.86■■□□□ 1.57
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.84■■□□□ 1.57
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 IDI1Q13907 227 aa24.83■■□□□ 1.57
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.8■■□□□ 1.56
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 UNC13BO14795 1591 aa24.8■■□□□ 1.56
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 TMEM94Q12767 1356 aa24.8■■□□□ 1.56
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.79■■□□□ 1.56
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.78■■□□□ 1.56
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.76■■□□□ 1.55
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.76■■□□□ 1.55
YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 ZFYVE9O95405 1425 aa24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms