Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC49.67■■■■■ 5.54
LRRC7Q96NW7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.17■■■■■ 5.46
LRRC7Q96NW7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.14■■■■■ 5.46
LRRC7Q96NW7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.3
LRRC7Q96NW7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
LRRC7Q96NW7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
LRRC7Q96NW7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
LRRC7Q96NW7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.4■■■■■ 5.18
LRRC7Q96NW7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
LRRC7Q96NW7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.31■■■■■ 5.16
LRRC7Q96NW7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.89■■■■■ 5.1
LRRC7Q96NW7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.88■■■■■ 5.09
LRRC7Q96NW7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.73■■■■■ 5.07
LRRC7Q96NW7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
LRRC7Q96NW7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.57■■■■■ 5.05
LRRC7Q96NW7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
LRRC7Q96NW7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.32■■■■■ 5
LRRC7Q96NW7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
LRRC7Q96NW7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
LRRC7Q96NW7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
LRRC7Q96NW7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
LRRC7Q96NW7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC45.83■■■■■ 4.93
LRRC7Q96NW7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.76■■■■■ 4.92
LRRC7Q96NW7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.76■■■■■ 4.92
LRRC7Q96NW7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
LRRC7Q96NW7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.63■■■■■ 4.9
LRRC7Q96NW7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
LRRC7Q96NW7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
LRRC7Q96NW7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.35■■■■■ 4.85
LRRC7Q96NW7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
LRRC7Q96NW7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
LRRC7Q96NW7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
LRRC7Q96NW7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
LRRC7Q96NW7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
LRRC7Q96NW7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
LRRC7Q96NW7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
LRRC7Q96NW7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
LRRC7Q96NW7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
LRRC7Q96NW7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
LRRC7Q96NW7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
LRRC7Q96NW7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
LRRC7Q96NW7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
LRRC7Q96NW7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
LRRC7Q96NW7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
LRRC7Q96NW7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
LRRC7Q96NW7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
LRRC7Q96NW7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
LRRC7Q96NW7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
LRRC7Q96NW7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
LRRC7Q96NW7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
LRRC7Q96NW7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
LRRC7Q96NW7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
LRRC7Q96NW7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
LRRC7Q96NW7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
LRRC7Q96NW7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
LRRC7Q96NW7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
LRRC7Q96NW7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
LRRC7Q96NW7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.56■■■■■ 4.56
LRRC7Q96NW7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
LRRC7Q96NW7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
LRRC7Q96NW7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
LRRC7Q96NW7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
LRRC7Q96NW7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
LRRC7Q96NW7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
LRRC7Q96NW7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
LRRC7Q96NW7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
LRRC7Q96NW7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
LRRC7Q96NW7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
LRRC7Q96NW7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
LRRC7Q96NW7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
LRRC7Q96NW7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
LRRC7Q96NW7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
LRRC7Q96NW7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
LRRC7Q96NW7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
LRRC7Q96NW7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
LRRC7Q96NW7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
LRRC7Q96NW7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
LRRC7Q96NW7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
LRRC7Q96NW7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
LRRC7Q96NW7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
LRRC7Q96NW7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
LRRC7Q96NW7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
LRRC7Q96NW7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
LRRC7Q96NW7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
LRRC7Q96NW7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
LRRC7Q96NW7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
LRRC7Q96NW7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
LRRC7Q96NW7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
LRRC7Q96NW7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
LRRC7Q96NW7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
LRRC7Q96NW7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
LRRC7Q96NW7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
LRRC7Q96NW7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
LRRC7Q96NW7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
LRRC7Q96NW7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
LRRC7Q96NW7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
LRRC7Q96NW7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
LRRC7Q96NW7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
LRRC7Q96NW7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
LRRC7Q96NW7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms