RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603448.1

AP002365.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AP002365.1, Length 772 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002365.1-201ENST00000603448 KIF3BO15066 747 aa45.7■■■■■ 4.91
AP002365.1-201ENST00000603448 KDM5DQ9BY66 1539 aa45.67■■■■■ 4.9
AP002365.1-201ENST00000603448 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP45.67■■■■■ 4.9
AP002365.1-201ENST00000603448 APLP2Q06481 763 aa45.6■■■■■ 4.89
AP002365.1-201ENST00000603448 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP45.58■■■■■ 4.89
AP002365.1-201ENST00000603448 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.89
AP002365.1-201ENST00000603448 PLA2R1Q13018 1463 aa45.55■■■■■ 4.88
AP002365.1-201ENST00000603448 CROCC2H7BZ55 1655 aa45.54■■■■■ 4.88
AP002365.1-201ENST00000603448 PZPP20742 1482 aa45.54■■■■■ 4.88
AP002365.1-201ENST00000603448 PTPN23Q9H3S7 1636 aa45.53■■■■■ 4.88
AP002365.1-201ENST00000603448 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa45.51■■■■■ 4.88
AP002365.1-201ENST00000603448 A2ML1A8K2U0 1454 aa45.5■■■■■ 4.87
AP002365.1-201ENST00000603448 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
AP002365.1-201ENST00000603448 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP45.48■■■■■ 4.87
AP002365.1-201ENST00000603448 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.87
AP002365.1-201ENST00000603448 LTBP4Q8N2S1 1624 aa45.44■■■■■ 4.86
AP002365.1-201ENST00000603448 TNRQ92752 1358 aa45.43■■■■■ 4.86
AP002365.1-201ENST00000603448 SHANK2Q9UPX8 1470 aa45.42■■■■■ 4.86
AP002365.1-201ENST00000603448 DUOX2Q9NRD8 1548 aa45.42■■■■■ 4.86
AP002365.1-201ENST00000603448 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa45.42■■■■■ 4.86
AP002365.1-201ENST00000603448 PKD2Q13563 968 aa45.4■■■■■ 4.86
AP002365.1-201ENST00000603448 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP45.4■■■■■ 4.86
AP002365.1-201ENST00000603448 MROH1Q8NDA8 1641 aa45.4■■■■■ 4.86
AP002365.1-201ENST00000603448 ABCC3O15438 1527 aa45.38■■■■■ 4.86
AP002365.1-201ENST00000603448 ABCC5O15440 1437 aa45.36■■■■■ 4.85
AP002365.1-201ENST00000603448 FGD6Q6ZV73 1430 aa45.36■■■■■ 4.85
AP002365.1-201ENST00000603448 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
AP002365.1-201ENST00000603448 CEP152O94986 1710 aa45.35■■■■■ 4.85
AP002365.1-201ENST00000603448 DAPK1P53355 1430 aa45.31■■■■■ 4.84
AP002365.1-201ENST00000603448 NLRP1Q9C000 1473 aa45.29■■■■■ 4.84
AP002365.1-201ENST00000603448 KIF15Q9NS87 1388 aa45.28■■■■■ 4.84
AP002365.1-201ENST00000603448 IQSEC2Q5JU85 1478 aa45.28■■■■■ 4.84
AP002365.1-201ENST00000603448 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa45.26■■■■■ 4.84
AP002365.1-201ENST00000603448 ERBINQ96RT1 1412 aa45.26■■■■■ 4.84
AP002365.1-201ENST00000603448 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
AP002365.1-201ENST00000603448 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP45.22■■■■■ 4.83
AP002365.1-201ENST00000603448 NEURL4Q96JN8 1562 aa45.2■■■■■ 4.83
AP002365.1-201ENST00000603448 UGGT1Q9NYU2 1555 aa45.2■■■■■ 4.83
AP002365.1-201ENST00000603448 DEPDC5O75140 1603 aa45.19■■■■■ 4.82
AP002365.1-201ENST00000603448 ERVK-7P63135 1459 aa45.17■■■■■ 4.82
AP002365.1-201ENST00000603448 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa45.17■■■■■ 4.82
AP002365.1-201ENST00000603448 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP45.17■■■■■ 4.82
AP002365.1-201ENST00000603448 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
AP002365.1-201ENST00000603448 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa45.09■■■■■ 4.81
AP002365.1-201ENST00000603448 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP45.09■■■■■ 4.81
AP002365.1-201ENST00000603448 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa45.04■■■■■ 4.8
AP002365.1-201ENST00000603448 ANKLE2Q86XL3 938 aa45.03■■■■■ 4.8
AP002365.1-201ENST00000603448 UBR1Q8IWV7 1749 aa45.02■■■■■ 4.8
AP002365.1-201ENST00000603448 CHIC2Q9UKJ5 165 aa45.02■■■■■ 4.8
AP002365.1-201ENST00000603448 ADGRL2O95490 1459 aa45.01■■■■■ 4.8
AP002365.1-201ENST00000603448 MED14O60244 1454 aa44.99■■■■■ 4.79
AP002365.1-201ENST00000603448 IQGAP1P46940 1657 aa44.96■■■■■ 4.79
AP002365.1-201ENST00000603448 KANK1Q14678 1352 aa44.96■■■■■ 4.79
AP002365.1-201ENST00000603448 VWDEQ8N2E2 1590 aa44.95■■■■■ 4.79
AP002365.1-201ENST00000603448 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP44.94■■■■■ 4.78
AP002365.1-201ENST00000603448 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP44.93■■■■■ 4.78
AP002365.1-201ENST00000603448 LMTK2Q8IWU2 1503 aa44.93■■■■■ 4.78
AP002365.1-201ENST00000603448 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
AP002365.1-201ENST00000603448 CPS1P31327 1500 aa44.91■■■■■ 4.78
AP002365.1-201ENST00000603448 PIK3C2BO00750 1634 aa44.83■■■■■ 4.77
AP002365.1-201ENST00000603448 EFCAB6Q5THR3 1501 aa44.8■■■■■ 4.76
AP002365.1-201ENST00000603448 UBAP1LF5GYI3 381 aa44.79■■■■■ 4.76
AP002365.1-201ENST00000603448 SLIT1O75093 1534 aa44.79■■■■■ 4.76
AP002365.1-201ENST00000603448 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP44.78■■■■■ 4.76
AP002365.1-201ENST00000603448 ARHGAP23Q9P227 1491 aa44.77■■■■■ 4.76
AP002365.1-201ENST00000603448 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa44.76■■■■■ 4.76
AP002365.1-201ENST00000603448 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
AP002365.1-201ENST00000603448 SYNMO15061 1565 aa44.73■■■■■ 4.75
AP002365.1-201ENST00000603448 STRCP1A6NGW2 1772 aa44.72■■■■■ 4.75
AP002365.1-201ENST00000603448 NOS1P29475 1434 aa44.66■■■■■ 4.74
AP002365.1-201ENST00000603448 TET3O43151 1660 aa44.65■■■■■ 4.74
AP002365.1-201ENST00000603448 UNC13BO14795 1591 aa44.65■■■■■ 4.74
AP002365.1-201ENST00000603448 GCC2Q8IWJ2 1684 aa44.63■■■■■ 4.73
AP002365.1-201ENST00000603448 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP44.62■■■■■ 4.73
AP002365.1-201ENST00000603448 LTKP29376 864 aa44.61■■■■■ 4.73
AP002365.1-201ENST00000603448 ROCK1Q13464 1354 aa44.6■■■■■ 4.73
AP002365.1-201ENST00000603448 TXNDC2Q86VQ3 553 aa44.6■■■■■ 4.73
AP002365.1-201ENST00000603448 TMEM2Q9UHN6 1383 aa44.59■■■■■ 4.73
AP002365.1-201ENST00000603448 IDI1Q13907 227 aa44.58■■■■■ 4.73
AP002365.1-201ENST00000603448 STAG3Q9UJ98 1225 aa44.58■■■■■ 4.73
AP002365.1-201ENST00000603448 EID1Q9Y6B2 187 aa44.57■■■■■ 4.73
AP002365.1-201ENST00000603448 ADGRB3O60242 1522 aa44.56■■■■■ 4.72
AP002365.1-201ENST00000603448 TOM1O60784 492 aa44.53■■■■■ 4.72
AP002365.1-201ENST00000603448 LRRC7Q96NW7 1537 aa44.52■■■■■ 4.72
AP002365.1-201ENST00000603448 DISP3Q9P2K9 1392 aa44.52■■■■■ 4.72
AP002365.1-201ENST00000603448 MYO5BQ9ULV0 1848 aa44.48■■■■■ 4.71
AP002365.1-201ENST00000603448 SLC52A1Q9NWF4 448 aa44.48■■■■■ 4.71
AP002365.1-201ENST00000603448 IQGAP3Q86VI3 1631 aa44.47■■■■■ 4.71
AP002365.1-201ENST00000603448 ALKQ9UM73 1620 aa44.46■■■■■ 4.71
AP002365.1-201ENST00000603448 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.46■■■■■ 4.71
AP002365.1-201ENST00000603448 E9PCH4 1651 aa44.45■■■■■ 4.71
AP002365.1-201ENST00000603448 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
AP002365.1-201ENST00000603448 PIP4K2BP78356 416 aa44.42■■■■■ 4.7
AP002365.1-201ENST00000603448 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
AP002365.1-201ENST00000603448 ITGAEP38570 1179 aa44.37■■■■■ 4.69
AP002365.1-201ENST00000603448 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa44.35■■■■■ 4.69
AP002365.1-201ENST00000603448 HSPA1LP34931 641 aa44.29■■■■■ 4.68
AP002365.1-201ENST00000603448 ZFYVE9O95405 1425 aa44.26■■■■■ 4.68
AP002365.1-201ENST00000603448 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
AP002365.1-201ENST00000603448 NUP155O75694 1391 aa44.25■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms