RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575186.5

AKAP1-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, human

TSL 4

Gene AKAP1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP1-215	ENST00000575186	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		34.05	■■■■□ 3.04
AKAP1-215	ENST00000575186	TNR	Q92752	1358 aa		34.03	■■■■□ 3.04
AKAP1-215	ENST00000575186	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		34.01	■■■■□ 3.03
AKAP1-215	ENST00000575186	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		34.01	■■■■□ 3.03
AKAP1-215	ENST00000575186	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	34	■■■■□ 3.03
AKAP1-215	ENST00000575186	NCOA2	Q15596	1464 aa		34	■■■■□ 3.03
AKAP1-215	ENST00000575186	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.96	■■■■□ 3.03
AKAP1-215	ENST00000575186	PZP	P20742	1482 aa		33.95	■■■■□ 3.03
AKAP1-215	ENST00000575186	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.93	■■■■□ 3.02
AKAP1-215	ENST00000575186	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.93	■■■■□ 3.02
AKAP1-215	ENST00000575186	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.92	■■■■□ 3.02
AKAP1-215	ENST00000575186	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.92	■■■■□ 3.02
AKAP1-215	ENST00000575186	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.91	■■■■□ 3.02
AKAP1-215	ENST00000575186	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.9	■■■■□ 3.02
AKAP1-215	ENST00000575186	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.89	■■■■□ 3.02
AKAP1-215	ENST00000575186	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.88	■■■■□ 3.01
AKAP1-215	ENST00000575186	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.85	■■■■□ 3.01
AKAP1-215	ENST00000575186	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.85	■■■■□ 3.01
AKAP1-215	ENST00000575186	TOM1	O60784	492 aa		33.84	■■■■□ 3.01
AKAP1-215	ENST00000575186	PIP4K2B	P78356	416 aa		33.84	■■■■□ 3.01
AKAP1-215	ENST00000575186	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
AKAP1-215	ENST00000575186	HSPA1L	P34931	641 aa		33.83	■■■■□ 3.01
AKAP1-215	ENST00000575186	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.82	■■■■□ 3
AKAP1-215	ENST00000575186	CPS1	P31327	1500 aa		33.81	■■■■□ 3
AKAP1-215	ENST00000575186	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.81	■■■■□ 3
AKAP1-215	ENST00000575186	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.76	■■■□□ 2.99
AKAP1-215	ENST00000575186	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.76	■■■□□ 2.99
AKAP1-215	ENST00000575186	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.74	■■■□□ 2.99
AKAP1-215	ENST00000575186	MED14	O60244	1454 aa		33.74	■■■□□ 2.99
AKAP1-215	ENST00000575186	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.74	■■■□□ 2.99
AKAP1-215	ENST00000575186	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.72	■■■□□ 2.99
AKAP1-215	ENST00000575186	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
AKAP1-215	ENST00000575186	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.7	■■■□□ 2.98
AKAP1-215	ENST00000575186	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.69	■■■□□ 2.98
AKAP1-215	ENST00000575186	ABCC3	O15438	1527 aa		33.69	■■■□□ 2.98
AKAP1-215	ENST00000575186	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.65	■■■□□ 2.98
AKAP1-215	ENST00000575186	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
AKAP1-215	ENST00000575186	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.64	■■■□□ 2.98
AKAP1-215	ENST00000575186	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.63	■■■□□ 2.97
AKAP1-215	ENST00000575186	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.58	■■■□□ 2.97
AKAP1-215	ENST00000575186	ALK	Q9UM73	1620 aa		33.57	■■■□□ 2.96
AKAP1-215	ENST00000575186	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
AKAP1-215	ENST00000575186	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.55	■■■□□ 2.96
AKAP1-215	ENST00000575186	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.54	■■■□□ 2.96
AKAP1-215	ENST00000575186	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.54	■■■□□ 2.96
AKAP1-215	ENST00000575186	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		33.53	■■■□□ 2.96
AKAP1-215	ENST00000575186	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
AKAP1-215	ENST00000575186	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
AKAP1-215	ENST00000575186	LTK	P29376	864 aa		33.52	■■■□□ 2.96
AKAP1-215	ENST00000575186	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.5	■■■□□ 2.95
AKAP1-215	ENST00000575186	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33.5	■■■□□ 2.95
AKAP1-215	ENST00000575186	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.49	■■■□□ 2.95
AKAP1-215	ENST00000575186	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.48	■■■□□ 2.95
AKAP1-215	ENST00000575186	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
AKAP1-215	ENST00000575186	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
AKAP1-215	ENST00000575186	ABCC5	O15440	1437 aa		33.45	■■■□□ 2.95
AKAP1-215	ENST00000575186	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.45	■■■□□ 2.95
AKAP1-215	ENST00000575186	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		33.45	■■■□□ 2.95
AKAP1-215	ENST00000575186	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.44	■■■□□ 2.94
AKAP1-215	ENST00000575186	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
AKAP1-215	ENST00000575186	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		33.43	■■■□□ 2.94
AKAP1-215	ENST00000575186	CEP152	O94986	1710 aa		33.41	■■■□□ 2.94
AKAP1-215	ENST00000575186	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
AKAP1-215	ENST00000575186	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.4	■■■□□ 2.94
AKAP1-215	ENST00000575186	EID1	Q9Y6B2	187 aa		33.4	■■■□□ 2.94
AKAP1-215	ENST00000575186	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.39	■■■□□ 2.94
AKAP1-215	ENST00000575186	SLIT1	O75093	1534 aa		33.38	■■■□□ 2.93
AKAP1-215	ENST00000575186	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
AKAP1-215	ENST00000575186	SYNM	O15061	1565 aa		33.35	■■■□□ 2.93
AKAP1-215	ENST00000575186	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		33.34	■■■□□ 2.93
AKAP1-215	ENST00000575186	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33.33	■■■□□ 2.93
AKAP1-215	ENST00000575186	APLP2	Q06481	763 aa		33.32	■■■□□ 2.92
AKAP1-215	ENST00000575186	KANK1	Q14678	1352 aa		33.32	■■■□□ 2.92
AKAP1-215	ENST00000575186	DAPK1	P53355	1430 aa		33.31	■■■□□ 2.92
AKAP1-215	ENST00000575186	IDI1	Q13907	227 aa		33.31	■■■□□ 2.92
AKAP1-215	ENST00000575186	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		33.3	■■■□□ 2.92
AKAP1-215	ENST00000575186	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.28	■■■□□ 2.92
AKAP1-215	ENST00000575186	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.24	■■■□□ 2.91
AKAP1-215	ENST00000575186	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.24	■■■□□ 2.91
AKAP1-215	ENST00000575186	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33.23	■■■□□ 2.91
AKAP1-215	ENST00000575186	KCNA6	P17658	529 aa		33.22	■■■□□ 2.91
AKAP1-215	ENST00000575186	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.21	■■■□□ 2.91
AKAP1-215	ENST00000575186	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		33.21	■■■□□ 2.91
AKAP1-215	ENST00000575186	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
AKAP1-215	ENST00000575186	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.2	■■■□□ 2.91
AKAP1-215	ENST00000575186	TMEM94	Q12767	1356 aa		33.2	■■■□□ 2.9
AKAP1-215	ENST00000575186	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		33.19	■■■□□ 2.9
AKAP1-215	ENST00000575186	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.18	■■■□□ 2.9
AKAP1-215	ENST00000575186	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
AKAP1-215	ENST00000575186	NOS1	P29475	1434 aa		33.15	■■■□□ 2.9
AKAP1-215	ENST00000575186	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
AKAP1-215	ENST00000575186	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		33.13	■■■□□ 2.89
AKAP1-215	ENST00000575186	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
AKAP1-215	ENST00000575186	TET3	O43151	1660 aa		33.1	■■■□□ 2.89
AKAP1-215	ENST00000575186	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.07	■■■□□ 2.88
AKAP1-215	ENST00000575186	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
AKAP1-215	ENST00000575186	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
AKAP1-215	ENST00000575186	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.03	■■■□□ 2.88
AKAP1-215	ENST00000575186	ADGRB3	O60242	1522 aa		33.02	■■■□□ 2.88
AKAP1-215	ENST00000575186	POTEA	Q6S8J7	498 aa		32.99	■■■□□ 2.87

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