RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575186.5

AKAP1-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene AKAP1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-215ENST00000575186 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.64■■■■■ 6.18
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AKAP1-215ENST00000575186 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.05■■■■■ 4.96
AKAP1-215ENST00000575186 NACADO15069 1562 aa45.67■■■■■ 4.9
AKAP1-215ENST00000575186 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.59■■■■■ 4.89
AKAP1-215ENST00000575186 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.36■■■■■ 4.85
AKAP1-215ENST00000575186 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.95■■■■■ 4.79
AKAP1-215ENST00000575186 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.84■■■■■ 4.77
AKAP1-215ENST00000575186 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.76■■■■■ 4.76
AKAP1-215ENST00000575186 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
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AKAP1-215ENST00000575186 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.08■■■■■ 4.65
AKAP1-215ENST00000575186 SCRIBQ14160 1630 aa43.9■■■■■ 4.62
AKAP1-215ENST00000575186 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.86■■■■■ 4.61
AKAP1-215ENST00000575186 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.84■■■■■ 4.61
AKAP1-215ENST00000575186 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
AKAP1-215ENST00000575186 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.54■■■■■ 4.4
AKAP1-215ENST00000575186 NCAPD3P42695 1498 aa42.27■■■■■ 4.36
AKAP1-215ENST00000575186 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.08■■■■■ 4.33
AKAP1-215ENST00000575186 CUX2O14529 1486 aa42.01■■■■■ 4.32
AKAP1-215ENST00000575186 ERCC6Q03468 1493 aa41.99■■■■■ 4.31
AKAP1-215ENST00000575186 SMARCA2P51531 1590 aa41.85■■■■■ 4.29
AKAP1-215ENST00000575186 SMARCA4P51532 1647 aa41.84■■■■■ 4.29
AKAP1-215ENST00000575186 HMGXB3Q12766 1538 aa41.8■■■■■ 4.28
AKAP1-215ENST00000575186 NESP48681 1621 aa41.69■■■■■ 4.27
AKAP1-215ENST00000575186 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
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AKAP1-215ENST00000575186 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.34■■■■■ 4.21
AKAP1-215ENST00000575186 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.24■■■■■ 4.19
AKAP1-215ENST00000575186 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
AKAP1-215ENST00000575186 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.13■■■■■ 4.17
AKAP1-215ENST00000575186 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.99■■■■■ 4.15
AKAP1-215ENST00000575186 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.96■■■■■ 4.15
AKAP1-215ENST00000575186 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.75■■■■■ 4.11
AKAP1-215ENST00000575186 WIZO95785 1651 aa40.75■■■■■ 4.11
AKAP1-215ENST00000575186 WDR62O43379 1518 aa40.62■■■■■ 4.09
AKAP1-215ENST00000575186 TRIM41Q8WV44 630 aa40.52■■■■■ 4.08
AKAP1-215ENST00000575186 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.51■■■■■ 4.07
AKAP1-215ENST00000575186 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.47■■■■■ 4.07
AKAP1-215ENST00000575186 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
AKAP1-215ENST00000575186 CFTRP13569 1480 aa40.41■■■■■ 4.06
AKAP1-215ENST00000575186 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
AKAP1-215ENST00000575186 OSCARQ8IYS5 282 aa40.18■■■■■ 4.02
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AKAP1-215ENST00000575186 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
AKAP1-215ENST00000575186 IFT140Q96RY7 1462 aa39.75■■■■□ 3.95
AKAP1-215ENST00000575186 PRDM2Q13029 1718 aa39.67■■■■□ 3.94
AKAP1-215ENST00000575186 TOPBP1Q92547 1522 aa39.65■■■■□ 3.94
AKAP1-215ENST00000575186 ABCC8Q09428 1581 aa39.53■■■■□ 3.92
AKAP1-215ENST00000575186 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.51■■■■□ 3.91
AKAP1-215ENST00000575186 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.51■■■■□ 3.91
AKAP1-215ENST00000575186 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.51■■■■□ 3.91
AKAP1-215ENST00000575186 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.42■■■■□ 3.9
AKAP1-215ENST00000575186 ARHGEF11O15085 1522 aa39.4■■■■□ 3.9
AKAP1-215ENST00000575186 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.37■■■■□ 3.89
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AKAP1-215ENST00000575186 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.29■■■■□ 3.88
AKAP1-215ENST00000575186 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
AKAP1-215ENST00000575186 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
AKAP1-215ENST00000575186 FBLN2P98095 1184 aa39.23■■■■□ 3.87
AKAP1-215ENST00000575186 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.15■■■■□ 3.86
AKAP1-215ENST00000575186 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
AKAP1-215ENST00000575186 SOGA1O94964 1423 aa39.11■■■■□ 3.85
AKAP1-215ENST00000575186 CHD1O14646 1710 aa39.08■■■■□ 3.85
AKAP1-215ENST00000575186 ARAP1Q96P48 1450 aa39.02■■■■□ 3.84
AKAP1-215ENST00000575186 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.93■■■■□ 3.82
AKAP1-215ENST00000575186 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
AKAP1-215ENST00000575186 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.9■■■■□ 3.82
AKAP1-215ENST00000575186 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
AKAP1-215ENST00000575186 CUX1P39880 1505 aa38.84■■■■□ 3.81
AKAP1-215ENST00000575186 WDR97A6NE52 1622 aa38.78■■■■□ 3.8
AKAP1-215ENST00000575186 GRIN2BQ13224 1484 aa38.76■■■■□ 3.8
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AKAP1-215ENST00000575186 SYNJ2O15056 1496 aa38.66■■■■□ 3.78
AKAP1-215ENST00000575186 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.58■■■■□ 3.77
AKAP1-215ENST00000575186 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.48■■■■□ 3.75
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AKAP1-215ENST00000575186 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.29■■■■□ 3.72
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AKAP1-215ENST00000575186 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.1■■■■□ 3.69
AKAP1-215ENST00000575186 CEP170Q5SW79 1584 aa38.08■■■■□ 3.69
AKAP1-215ENST00000575186 TOP2BQ02880 1626 aa38.07■■■■□ 3.68
AKAP1-215ENST00000575186 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.02■■■■□ 3.68
AKAP1-215ENST00000575186 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.01■■■■□ 3.68
AKAP1-215ENST00000575186 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.95■■■■□ 3.67
AKAP1-215ENST00000575186 SHROOM2Q13796 1616 aa37.91■■■■□ 3.66
AKAP1-215ENST00000575186 JPH4Q96JJ6 628 aa37.87■■■■□ 3.65
AKAP1-215ENST00000575186 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
AKAP1-215ENST00000575186 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.57■■■■□ 3.6
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