RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.99□□□□□ -0.01
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.96□□□□□ -0.01
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 TNRQ92752 1358 aa14.95□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PZPP20742 1482 aa14.95□□□□□ -0.02
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 ILDR2Q71H61 639 aa14.92□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.026e-9■■□□□ 12.6
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.92□□□□□ -0.02
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.91□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MIA2Q96PC5 1412 aa14.9□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NLRP1Q9C000 1473 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SOCS7O14512 581 aa14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAP3K1Q13233 1512 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CPS1P31327 1500 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.86□□□□□ -0.03
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.81□□□□□ -0.04
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 CEP152O94986 1710 aa14.8□□□□□ -0.04
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EID1Q9Y6B2 187 aa14.7□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LTKP29376 864 aa14.69□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.68□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.68□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PIK3C2BO00750 1634 aa14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.66□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.65□□□□□ -0.06
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-201ENST00000554945 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IDI1Q13907 227 aa14.63□□□□□ -0.07
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