RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.64■■□□□ 1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.73■■□□□ 1.23
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ABCC9O60706 1549 aa21.3■■□□□ 1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.27■■□□□ 1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.29■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NACADO15069 1562 aa20.12■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.04■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.99■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.83■□□□□ 0.77
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.83■□□□□ 0.77
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP19.81■□□□□ 0.76
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.66■□□□□ 0.74
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.55■□□□□ 0.72
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FOXD1Q16676 465 aa19.51■□□□□ 0.71
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.43■□□□□ 0.7
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SCRIBQ14160 1630 aa19.33■□□□□ 0.69
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.25■□□□□ 0.67
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.21■□□□□ 0.67
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
SRP54-AS1-201ENST00000554945 POTEDQ86YR6 584 aa18.9■□□□□ 0.62
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NCAPD3P42695 1498 aa18.57■□□□□ 0.56
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.5■□□□□ 0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.49■□□□□ 0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SMARCA4P51532 1647 aa18.45■□□□□ 0.54
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SMARCA2P51531 1590 aa18.45■□□□□ 0.54
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CUX2O14529 1486 aa18.43■□□□□ 0.54
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HMGXB3Q12766 1538 aa18.43■□□□□ 0.54
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MSH5O43196 834 aa18.42■□□□□ 0.54
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ERCC6Q03468 1493 aa18.41■□□□□ 0.54
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.3■□□□□ 0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NESP48681 1621 aa18.27■□□□□ 0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.19■□□□□ 0.5
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.18■□□□□ 0.5
SRP54-AS1-201ENST00000554945 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.07■□□□□ 0.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.06■□□□□ 0.48
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CADPSQ9ULU8 1353 aa18■□□□□ 0.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 WIZO95785 1651 aa17.99■□□□□ 0.47
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.89■□□□□ 0.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 WDR62O43379 1518 aa17.85■□□□□ 0.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PPP6R1Q9UPN7 881 aa17.85■□□□□ 0.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.82■□□□□ 0.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.82■□□□□ 0.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.79■□□□□ 0.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ADRA2BP18089 450 aa17.78■□□□□ 0.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CFTRP13569 1480 aa17.77■□□□□ 0.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRDM2Q13029 1718 aa17.64■□□□□ 0.41
SRP54-AS1-201ENST00000554945 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRIM41Q8WV44 630 aa17.63■□□□□ 0.41
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OSCARQ8IYS5 282 aa17.58■□□□□ 0.4
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.56■□□□□ 0.4
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IFT140Q96RY7 1462 aa17.47■□□□□ 0.39
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ABCC8Q09428 1581 aa17.45■□□□□ 0.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TOPBP1Q92547 1522 aa17.44■□□□□ 0.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.37■□□□□ 0.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa17.34■□□□□ 0.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa17.34■□□□□ 0.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17.34■□□□□ 0.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARHGEF11O15085 1522 aa17.26■□□□□ 0.35
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.26■□□□□ 0.351e-6■■■■□ 25.1
SRP54-AS1-201ENST00000554945 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CHD1O14646 1710 aa17.24■□□□□ 0.35
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SOGA1O94964 1423 aa17.19■□□□□ 0.34
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FBLN2P98095 1184 aa17.18■□□□□ 0.34
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.18■□□□□ 0.34
SRP54-AS1-201ENST00000554945 WDR97A6NE52 1622 aa17.15■□□□□ 0.34
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.15■□□□□ 0.34
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.13■□□□□ 0.33
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CUX1P39880 1505 aa17.1■□□□□ 0.33
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.08■□□□□ 0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARAP1Q96P48 1450 aa17.08■□□□□ 0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GRIN2BQ13224 1484 aa17.05■□□□□ 0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.03■□□□□ 0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SYNJ1O43426 1573 aa17.02■□□□□ 0.32
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SYNJ2O15056 1496 aa17■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PBRM1Q86U86 1689 aa16.99■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.98■□□□□ 0.31
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.95■□□□□ 0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.92■□□□□ 0.3
SRP54-AS1-201ENST00000554945 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.84■□□□□ 0.29
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TOP2BQ02880 1626 aa16.83■□□□□ 0.28
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GRIN2AQ12879 1464 aa16.82■□□□□ 0.28
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