RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551738.1

CRIP2-209, Transcript of cysteine rich protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene CRIP2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2-209ENST00000551738 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
CRIP2-209ENST00000551738 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.31■■■■■ 4.36
CRIP2-209ENST00000551738 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
CRIP2-209ENST00000551738 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.28■■■■■ 4.36
CRIP2-209ENST00000551738 PZPP20742 1482 aa42.26■■■■■ 4.36
CRIP2-209ENST00000551738 TNRQ92752 1358 aa42.26■■■■■ 4.35
CRIP2-209ENST00000551738 DISP3Q9P2K9 1392 aa42.25■■■■■ 4.35
CRIP2-209ENST00000551738 TSPY4P0CV99 314 aa42.24■■■■■ 4.35
CRIP2-209ENST00000551738 TSPY10P0CW01 314 aa42.24■■■■■ 4.35
CRIP2-209ENST00000551738 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.23■■■■■ 4.35
CRIP2-209ENST00000551738 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
CRIP2-209ENST00000551738 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.18■■■■■ 4.34
CRIP2-209ENST00000551738 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
CRIP2-209ENST00000551738 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.13■■■■■ 4.33
CRIP2-209ENST00000551738 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.1■■■■■ 4.33
CRIP2-209ENST00000551738 UBAP1LF5GYI3 381 aa42.1■■■■■ 4.33
CRIP2-209ENST00000551738 MAP3K1Q13233 1512 aa42.1■■■■■ 4.33
CRIP2-209ENST00000551738 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.09■■■■■ 4.33
CRIP2-209ENST00000551738 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
CRIP2-209ENST00000551738 MIA2Q96PC5 1412 aa42.07■■■■■ 4.33
CRIP2-209ENST00000551738 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
CRIP2-209ENST00000551738 NLRP1Q9C000 1473 aa42.06■■■■■ 4.32
CRIP2-209ENST00000551738 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.05■■■■■ 4.32
CRIP2-209ENST00000551738 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
CRIP2-209ENST00000551738 ABCC3O15438 1527 aa42.02■■■■■ 4.32
CRIP2-209ENST00000551738 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
CRIP2-209ENST00000551738 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.01■■■■■ 4.32
CRIP2-209ENST00000551738 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.01■■■■■ 4.32
CRIP2-209ENST00000551738 ILDR2Q71H61 639 aa42.01■■■■■ 4.32
CRIP2-209ENST00000551738 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
CRIP2-209ENST00000551738 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.97■■■■■ 4.31
CRIP2-209ENST00000551738 CPS1P31327 1500 aa41.95■■■■■ 4.31
CRIP2-209ENST00000551738 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.92■■■■■ 4.3
CRIP2-209ENST00000551738 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.92■■■■■ 4.3
CRIP2-209ENST00000551738 DEPDC5O75140 1603 aa41.89■■■■■ 4.3
CRIP2-209ENST00000551738 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.89■■■■■ 4.3
CRIP2-209ENST00000551738 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.3
CRIP2-209ENST00000551738 ERVK-7P63135 1459 aa41.88■■■■■ 4.29
CRIP2-209ENST00000551738 CEP152O94986 1710 aa41.86■■■■■ 4.29
CRIP2-209ENST00000551738 MED14O60244 1454 aa41.86■■■■■ 4.29
CRIP2-209ENST00000551738 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.84■■■■■ 4.29
CRIP2-209ENST00000551738 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.8■■■■■ 4.28
CRIP2-209ENST00000551738 IQGAP1P46940 1657 aa41.8■■■■■ 4.28
CRIP2-209ENST00000551738 KIF15Q9NS87 1388 aa41.8■■■■■ 4.28
CRIP2-209ENST00000551738 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
CRIP2-209ENST00000551738 SOCS7O14512 581 aa41.79■■■■■ 4.28
CRIP2-209ENST00000551738 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.77■■■■■ 4.28
CRIP2-209ENST00000551738 APLP2Q06481 763 aa41.77■■■■■ 4.28
CRIP2-209ENST00000551738 ABCC5O15440 1437 aa41.76■■■■■ 4.28
CRIP2-209ENST00000551738 TOM1O60784 492 aa41.75■■■■■ 4.27
CRIP2-209ENST00000551738 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
CRIP2-209ENST00000551738 PIP4K2BP78356 416 aa41.74■■■■■ 4.27
CRIP2-209ENST00000551738 ERBINQ96RT1 1412 aa41.74■■■■■ 4.27
CRIP2-209ENST00000551738 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
CRIP2-209ENST00000551738 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.7■■■■■ 4.27
CRIP2-209ENST00000551738 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.69■■■■■ 4.26
CRIP2-209ENST00000551738 DAPK1P53355 1430 aa41.68■■■■■ 4.26
CRIP2-209ENST00000551738 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.66■■■■■ 4.26
CRIP2-209ENST00000551738 HSPA1LP34931 641 aa41.65■■■■■ 4.26
CRIP2-209ENST00000551738 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.65■■■■■ 4.26
CRIP2-209ENST00000551738 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
CRIP2-209ENST00000551738 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.6■■■■■ 4.25
CRIP2-209ENST00000551738 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.6■■■■■ 4.25
CRIP2-209ENST00000551738 SYNMO15061 1565 aa41.58■■■■■ 4.25
CRIP2-209ENST00000551738 KANK1Q14678 1352 aa41.56■■■■■ 4.24
CRIP2-209ENST00000551738 ALKQ9UM73 1620 aa41.55■■■■■ 4.24
CRIP2-209ENST00000551738 SLIT1O75093 1534 aa41.55■■■■■ 4.24
CRIP2-209ENST00000551738 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.55■■■■■ 4.24
CRIP2-209ENST00000551738 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.55■■■■■ 4.24
CRIP2-209ENST00000551738 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.53■■■■■ 4.24
CRIP2-209ENST00000551738 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.51■■■■■ 4.24
CRIP2-209ENST00000551738 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.5■■■■■ 4.23
CRIP2-209ENST00000551738 PIK3C2BO00750 1634 aa41.5■■■■■ 4.23
CRIP2-209ENST00000551738 LTKP29376 864 aa41.49■■■■■ 4.23
CRIP2-209ENST00000551738 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
CRIP2-209ENST00000551738 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.45■■■■■ 4.23
CRIP2-209ENST00000551738 EID1Q9Y6B2 187 aa41.45■■■■■ 4.23
CRIP2-209ENST00000551738 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.42■■■■■ 4.22
CRIP2-209ENST00000551738 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.4■■■■■ 4.22
CRIP2-209ENST00000551738 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
CRIP2-209ENST00000551738 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.37■■■■■ 4.21
CRIP2-209ENST00000551738 ADGRL2O95490 1459 aa41.35■■■■■ 4.21
CRIP2-209ENST00000551738 IDI1Q13907 227 aa41.32■■■■■ 4.21
CRIP2-209ENST00000551738 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
CRIP2-209ENST00000551738 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
CRIP2-209ENST00000551738 NOS1P29475 1434 aa41.28■■■■■ 4.2
CRIP2-209ENST00000551738 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
CRIP2-209ENST00000551738 ADGRB3O60242 1522 aa41.25■■■■■ 4.19
CRIP2-209ENST00000551738 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.22■■■■■ 4.19
CRIP2-209ENST00000551738 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
CRIP2-209ENST00000551738 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
CRIP2-209ENST00000551738 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.16■■■■■ 4.18
CRIP2-209ENST00000551738 TET3O43151 1660 aa41.16■■■■■ 4.18
CRIP2-209ENST00000551738 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.14■■■■■ 4.18
CRIP2-209ENST00000551738 TMEM94Q12767 1356 aa41.12■■■■■ 4.17
CRIP2-209ENST00000551738 KCNA6P17658 529 aa41.12■■■■■ 4.17
CRIP2-209ENST00000551738 BCANQ96GW7 911 aa41.05■■■■■ 4.16
CRIP2-209ENST00000551738 NWD1Q149M9 1564 aa41.04■■■■■ 4.16
CRIP2-209ENST00000551738 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.04■■■■■ 4.16
CRIP2-209ENST00000551738 UNC13BO14795 1591 aa41.03■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms