RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551738.1

CRIP2-209, Transcript of cysteine rich protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene CRIP2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2-209ENST00000551738 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.85■■■■■ 8.29
CRIP2-209ENST00000551738 ABCC9O60706 1549 aa60.19■■■■■ 7.23
CRIP2-209ENST00000551738 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.08■■■■■ 7.21
CRIP2-209ENST00000551738 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.25■■■■■ 6.76
CRIP2-209ENST00000551738 NACADO15069 1562 aa56.81■■■■■ 6.69
CRIP2-209ENST00000551738 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.48■■■■■ 6.63
CRIP2-209ENST00000551738 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.47■■■■■ 6.63
CRIP2-209ENST00000551738 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.99■■■■■ 6.55
CRIP2-209ENST00000551738 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.97■■■■■ 6.55
CRIP2-209ENST00000551738 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.93■■■■■ 6.54
CRIP2-209ENST00000551738 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.55■■■■■ 6.48
CRIP2-209ENST00000551738 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.4■■■■■ 6.46
CRIP2-209ENST00000551738 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.21■■■■■ 6.43
CRIP2-209ENST00000551738 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.83■■■■■ 6.37
CRIP2-209ENST00000551738 SCRIBQ14160 1630 aa54.76■■■■■ 6.36
CRIP2-209ENST00000551738 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.36■■■■■ 6.29
CRIP2-209ENST00000551738 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.23■■■■■ 6.27
CRIP2-209ENST00000551738 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.22■■■■■ 6.27
CRIP2-209ENST00000551738 NCAPD3P42695 1498 aa52.43■■■■■ 5.98
CRIP2-209ENST00000551738 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.26■■■■■ 5.96
CRIP2-209ENST00000551738 SMARCA4P51532 1647 aa52.2■■■■■ 5.95
CRIP2-209ENST00000551738 SMARCA2P51531 1590 aa52.13■■■■■ 5.94
CRIP2-209ENST00000551738 HMGXB3Q12766 1538 aa52.06■■■■■ 5.92
CRIP2-209ENST00000551738 ERCC6Q03468 1493 aa52.01■■■■■ 5.92
CRIP2-209ENST00000551738 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.98■■■■■ 5.91
CRIP2-209ENST00000551738 CUX2O14529 1486 aa51.93■■■■■ 5.9
CRIP2-209ENST00000551738 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.93■■■■■ 5.9
CRIP2-209ENST00000551738 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.78■■■■■ 5.88
CRIP2-209ENST00000551738 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.68■■■■■ 5.86
CRIP2-209ENST00000551738 NESP48681 1621 aa51.66■■■■■ 5.86
CRIP2-209ENST00000551738 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.51■■■■■ 5.84
CRIP2-209ENST00000551738 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.29■■■■■ 5.8
CRIP2-209ENST00000551738 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.19■■■■■ 5.78
CRIP2-209ENST00000551738 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.01■■■■■ 5.76
CRIP2-209ENST00000551738 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51■■■■■ 5.75
CRIP2-209ENST00000551738 WIZO95785 1651 aa50.9■■■■■ 5.74
CRIP2-209ENST00000551738 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.82■■■■■ 5.73
CRIP2-209ENST00000551738 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.59■■■■■ 5.69
CRIP2-209ENST00000551738 WDR62O43379 1518 aa50.46■■■■■ 5.67
CRIP2-209ENST00000551738 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.39■■■■■ 5.66
CRIP2-209ENST00000551738 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.37■■■■■ 5.65
CRIP2-209ENST00000551738 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.28■■■■■ 5.64
CRIP2-209ENST00000551738 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.27■■■■■ 5.64
CRIP2-209ENST00000551738 CFTRP13569 1480 aa50.23■■■■■ 5.63
CRIP2-209ENST00000551738 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.86■■■■■ 5.57
CRIP2-209ENST00000551738 PRDM2Q13029 1718 aa49.76■■■■■ 5.56
CRIP2-209ENST00000551738 TRIM41Q8WV44 630 aa49.7■■■■■ 5.55
CRIP2-209ENST00000551738 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.66■■■■■ 5.54
CRIP2-209ENST00000551738 OSCARQ8IYS5 282 aa49.49■■■■■ 5.51
CRIP2-209ENST00000551738 IFT140Q96RY7 1462 aa49.35■■■■■ 5.49
CRIP2-209ENST00000551738 TOPBP1Q92547 1522 aa49.31■■■■■ 5.48
CRIP2-209ENST00000551738 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.27■■■■■ 5.48
CRIP2-209ENST00000551738 ABCC8Q09428 1581 aa49.19■■■■■ 5.46
CRIP2-209ENST00000551738 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.14■■■■■ 5.46
CRIP2-209ENST00000551738 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.03■■■■■ 5.44
CRIP2-209ENST00000551738 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.91■■■■■ 5.42
CRIP2-209ENST00000551738 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.91■■■■■ 5.42
CRIP2-209ENST00000551738 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.91■■■■■ 5.42
CRIP2-209ENST00000551738 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.87■■■■■ 5.41
CRIP2-209ENST00000551738 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.8■■■■■ 5.4
CRIP2-209ENST00000551738 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.8■■■■■ 5.4
CRIP2-209ENST00000551738 ARHGEF11O15085 1522 aa48.75■■■■■ 5.39
CRIP2-209ENST00000551738 CHD1O14646 1710 aa48.68■■■■■ 5.38
CRIP2-209ENST00000551738 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.61■■■■■ 5.37
CRIP2-209ENST00000551738 SOGA1O94964 1423 aa48.56■■■■■ 5.36
CRIP2-209ENST00000551738 FBLN2P98095 1184 aa48.52■■■■■ 5.36
CRIP2-209ENST00000551738 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.49■■■■■ 5.35
CRIP2-209ENST00000551738 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.49■■■■■ 5.35
CRIP2-209ENST00000551738 CUX1P39880 1505 aa48.42■■■■■ 5.34
CRIP2-209ENST00000551738 WDR97A6NE52 1622 aa48.4■■■■■ 5.34
CRIP2-209ENST00000551738 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.36■■■■■ 5.33
CRIP2-209ENST00000551738 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.34■■■■■ 5.33
CRIP2-209ENST00000551738 ARAP1Q96P48 1450 aa48.26■■■■■ 5.32
CRIP2-209ENST00000551738 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.2■■■■■ 5.31
CRIP2-209ENST00000551738 GRIN2BQ13224 1484 aa48.17■■■■■ 5.3
CRIP2-209ENST00000551738 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.13■■■■■ 5.3
CRIP2-209ENST00000551738 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.11■■■■■ 5.29
CRIP2-209ENST00000551738 SYNJ1O43426 1573 aa48.09■■■■■ 5.29
CRIP2-209ENST00000551738 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.08■■■■■ 5.29
CRIP2-209ENST00000551738 SYNJ2O15056 1496 aa48.04■■■■■ 5.28
CRIP2-209ENST00000551738 PBRM1Q86U86 1689 aa48■■■■■ 5.27
CRIP2-209ENST00000551738 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.98■■■■■ 5.27
CRIP2-209ENST00000551738 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.92■■■■■ 5.26
CRIP2-209ENST00000551738 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.89■■■■■ 5.26
CRIP2-209ENST00000551738 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.88■■■■■ 5.25
CRIP2-209ENST00000551738 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.71■■■■■ 5.23
CRIP2-209ENST00000551738 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.62■■■■■ 5.21
CRIP2-209ENST00000551738 TOP2BQ02880 1626 aa47.61■■■■■ 5.21
CRIP2-209ENST00000551738 GRIN2AQ12879 1464 aa47.56■■■■■ 5.2
CRIP2-209ENST00000551738 ADAMTS12P58397 1594 aa47.54■■■■■ 5.2
CRIP2-209ENST00000551738 CEP170Q5SW79 1584 aa47.4■■■■■ 5.18
CRIP2-209ENST00000551738 NUP160Q12769 1436 aa47.39■■■■■ 5.18
CRIP2-209ENST00000551738 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.38■■■■■ 5.17
CRIP2-209ENST00000551738 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.34■■■■■ 5.17
CRIP2-209ENST00000551738 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.32■■■■■ 5.17
CRIP2-209ENST00000551738 SHROOM2Q13796 1616 aa47.2■■■■■ 5.15
CRIP2-209ENST00000551738 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.95■■■■■ 5.11
CRIP2-209ENST00000551738 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.88■■■■■ 5.09
CRIP2-209ENST00000551738 JPH4Q96JJ6 628 aa46.87■■■■■ 5.09
CRIP2-209ENST00000551738 KIF27Q86VH2 1401 aa46.69■■■■■ 5.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms