RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534206.5

ACER3-214, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene ACER3, Length 834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-214ENST00000534206 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.94■■■■■ 4.79
ACER3-214ENST00000534206 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP44.93■■■■■ 4.78
ACER3-214ENST00000534206 MIA2Q96PC5 1412 aa44.92■■■■■ 4.78
ACER3-214ENST00000534206 MAST1Q9Y2H9 1570 aa44.92■■■■■ 4.78
ACER3-214ENST00000534206 PLA2R1Q13018 1463 aa44.91■■■■■ 4.78
ACER3-214ENST00000534206 KDM5DQ9BY66 1539 aa44.9■■■■■ 4.78
ACER3-214ENST00000534206 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP44.88■■■■■ 4.78
ACER3-214ENST00000534206 FAM135AQ9P2D6 1515 aa44.88■■■■■ 4.78
ACER3-214ENST00000534206 PZPP20742 1482 aa44.85■■■■■ 4.77
ACER3-214ENST00000534206 A2ML1A8K2U0 1454 aa44.85■■■■■ 4.77
ACER3-214ENST00000534206 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa44.84■■■■■ 4.77
ACER3-214ENST00000534206 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
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ACER3-214ENST00000534206 TNRQ92752 1358 aa44.8■■■■■ 4.76
ACER3-214ENST00000534206 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP44.78■■■■■ 4.76
ACER3-214ENST00000534206 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
ACER3-214ENST00000534206 MROH1Q8NDA8 1641 aa44.7■■■■■ 4.75
ACER3-214ENST00000534206 ABCC3O15438 1527 aa44.69■■■■■ 4.74
ACER3-214ENST00000534206 ABCC5O15440 1437 aa44.68■■■■■ 4.74
ACER3-214ENST00000534206 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
ACER3-214ENST00000534206 IQSEC2Q5JU85 1478 aa44.66■■■■■ 4.74
ACER3-214ENST00000534206 PTPN23Q9H3S7 1636 aa44.64■■■■■ 4.74
ACER3-214ENST00000534206 DUOX2Q9NRD8 1548 aa44.6■■■■■ 4.73
ACER3-214ENST00000534206 APLP2Q06481 763 aa44.6■■■■■ 4.73
ACER3-214ENST00000534206 NEURL4Q96JN8 1562 aa44.6■■■■■ 4.73
ACER3-214ENST00000534206 SHANK2Q9UPX8 1470 aa44.59■■■■■ 4.73
ACER3-214ENST00000534206 NLRP1Q9C000 1473 aa44.58■■■■■ 4.73
ACER3-214ENST00000534206 CROCC2H7BZ55 1655 aa44.57■■■■■ 4.73
ACER3-214ENST00000534206 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP44.57■■■■■ 4.73
ACER3-214ENST00000534206 FGD6Q6ZV73 1430 aa44.57■■■■■ 4.72
ACER3-214ENST00000534206 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa44.55■■■■■ 4.72
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ACER3-214ENST00000534206 DAPK1P53355 1430 aa44.53■■■■■ 4.72
ACER3-214ENST00000534206 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
ACER3-214ENST00000534206 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa44.51■■■■■ 4.72
ACER3-214ENST00000534206 ERVK-7P63135 1459 aa44.5■■■■■ 4.71
ACER3-214ENST00000534206 CEP152O94986 1710 aa44.5■■■■■ 4.71
ACER3-214ENST00000534206 UGGT1Q9NYU2 1555 aa44.49■■■■■ 4.71
ACER3-214ENST00000534206 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP44.49■■■■■ 4.71
ACER3-214ENST00000534206 ERBINQ96RT1 1412 aa44.45■■■■■ 4.71
ACER3-214ENST00000534206 ANKLE2Q86XL3 938 aa44.43■■■■■ 4.7
ACER3-214ENST00000534206 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP44.43■■■■■ 4.7
ACER3-214ENST00000534206 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP44.42■■■■■ 4.7
ACER3-214ENST00000534206 MED14O60244 1454 aa44.4■■■■■ 4.7
ACER3-214ENST00000534206 DEPDC5O75140 1603 aa44.37■■■■■ 4.69
ACER3-214ENST00000534206 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa44.36■■■■■ 4.69
ACER3-214ENST00000534206 CHIC2Q9UKJ5 165 aa44.36■■■■■ 4.69
ACER3-214ENST00000534206 VWDEQ8N2E2 1590 aa44.32■■■■■ 4.69
ACER3-214ENST00000534206 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.68
ACER3-214ENST00000534206 UBAP1LF5GYI3 381 aa44.3■■■■■ 4.68
ACER3-214ENST00000534206 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa44.28■■■■■ 4.68
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ACER3-214ENST00000534206 ADGRL2O95490 1459 aa44.22■■■■■ 4.67
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ACER3-214ENST00000534206 LMTK2Q8IWU2 1503 aa44.19■■■■■ 4.67
ACER3-214ENST00000534206 ARHGAP23Q9P227 1491 aa44.16■■■■■ 4.66
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ACER3-214ENST00000534206 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.66
ACER3-214ENST00000534206 KANK1Q14678 1352 aa44.13■■■■■ 4.65
ACER3-214ENST00000534206 DISP3Q9P2K9 1392 aa44.13■■■■■ 4.65
ACER3-214ENST00000534206 SLIT1O75093 1534 aa44.12■■■■■ 4.65
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ACER3-214ENST00000534206 PIK3C2BO00750 1634 aa44.08■■■■■ 4.65
ACER3-214ENST00000534206 ILDR2Q71H61 639 aa44.07■■■■■ 4.65
ACER3-214ENST00000534206 ALKQ9UM73 1620 aa44.05■■■■■ 4.64
ACER3-214ENST00000534206 IDI1Q13907 227 aa44.04■■■■■ 4.64
ACER3-214ENST00000534206 SYNMO15061 1565 aa44.03■■■■■ 4.64
ACER3-214ENST00000534206 NOS1P29475 1434 aa44.03■■■■■ 4.64
ACER3-214ENST00000534206 TXNDC2Q86VQ3 553 aa44.03■■■■■ 4.64
ACER3-214ENST00000534206 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa44.01■■■■■ 4.64
ACER3-214ENST00000534206 EFCAB6Q5THR3 1501 aa44.01■■■■■ 4.64
ACER3-214ENST00000534206 LRRC7Q96NW7 1537 aa43.99■■■■■ 4.63
ACER3-214ENST00000534206 TMEM2Q9UHN6 1383 aa43.98■■■■■ 4.63
ACER3-214ENST00000534206 TOM1O60784 492 aa43.97■■■■■ 4.63
ACER3-214ENST00000534206 PIP4K2BP78356 416 aa43.94■■■■■ 4.62
ACER3-214ENST00000534206 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
ACER3-214ENST00000534206 HSPA1LP34931 641 aa43.91■■■■■ 4.62
ACER3-214ENST00000534206 EID1Q9Y6B2 187 aa43.88■■■■■ 4.62
ACER3-214ENST00000534206 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
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ACER3-214ENST00000534206 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
ACER3-214ENST00000534206 SLC52A1Q9NWF4 448 aa43.81■■■■■ 4.6
ACER3-214ENST00000534206 ROCK1Q13464 1354 aa43.8■■■■■ 4.6
ACER3-214ENST00000534206 ADGRB3O60242 1522 aa43.79■■■■■ 4.6
ACER3-214ENST00000534206 TET3O43151 1660 aa43.79■■■■■ 4.6
ACER3-214ENST00000534206 UNC13BO14795 1591 aa43.79■■■■■ 4.6
ACER3-214ENST00000534206 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
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ACER3-214ENST00000534206 GCC2Q8IWJ2 1684 aa43.69■■■■■ 4.58
ACER3-214ENST00000534206 SLC26A8Q96RN1 970 aa43.68■■■■■ 4.58
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ACER3-214ENST00000534206 E9PCH4 1651 aa43.64■■■■■ 4.58
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ACER3-214ENST00000534206 KCNA6P17658 529 aa43.63■■■■■ 4.57
ACER3-214ENST00000534206 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa43.62■■■■■ 4.57
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