RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534206.5

ACER3-214, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene ACER3, Length 834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-214ENST00000534206 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.25■■■■■ 9
ACER3-214ENST00000534206 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa63.73■■■■■ 7.79
ACER3-214ENST00000534206 ABCC9O60706 1549 aa63.6■■■■■ 7.77
ACER3-214ENST00000534206 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.55■■■■■ 7.28
ACER3-214ENST00000534206 NACADO15069 1562 aa60.24■■■■■ 7.23
ACER3-214ENST00000534206 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.92■■■■■ 7.18
ACER3-214ENST00000534206 DNAJC5BQ9UF47 199 aa59.7■■■■■ 7.15
ACER3-214ENST00000534206 MYO15BQ96JP2 1530 aa59.54■■■■■ 7.12
ACER3-214ENST00000534206 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP59.3■■■■■ 7.08
ACER3-214ENST00000534206 UNC13AQ9UPW8 1703 aa59.29■■■■■ 7.08
ACER3-214ENST00000534206 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP59.09■■■■■ 7.05
ACER3-214ENST00000534206 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.97■■■■■ 7.03
ACER3-214ENST00000534206 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.86■■■■■ 7.01
ACER3-214ENST00000534206 SCRIBQ14160 1630 aa58.11■■■■■ 6.89
ACER3-214ENST00000534206 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa58.02■■■■■ 6.88
ACER3-214ENST00000534206 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa57.47■■■■■ 6.79
ACER3-214ENST00000534206 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP57.4■■■■■ 6.78
ACER3-214ENST00000534206 CECR2Q9BXF3 1484 aa57.26■■■■■ 6.76
ACER3-214ENST00000534206 NCAPD3P42695 1498 aa55.69■■■■■ 6.51
ACER3-214ENST00000534206 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa55.56■■■■■ 6.48
ACER3-214ENST00000534206 SMARCA4P51532 1647 aa55.5■■■■■ 6.47
ACER3-214ENST00000534206 SMARCA2P51531 1590 aa55.29■■■■■ 6.44
ACER3-214ENST00000534206 HMGXB3Q12766 1538 aa55.22■■■■■ 6.43
ACER3-214ENST00000534206 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55.2■■■■■ 6.43
ACER3-214ENST00000534206 PEG3Q9GZU2 1588 aa55■■■■■ 6.39
ACER3-214ENST00000534206 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.94■■■■■ 6.39
ACER3-214ENST00000534206 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.92■■■■■ 6.38
ACER3-214ENST00000534206 NESP48681 1621 aa54.77■■■■■ 6.36
ACER3-214ENST00000534206 ERCC6Q03468 1493 aa54.77■■■■■ 6.36
ACER3-214ENST00000534206 CUX2O14529 1486 aa54.67■■■■■ 6.34
ACER3-214ENST00000534206 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54.53■■■■■ 6.32
ACER3-214ENST00000534206 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.3■■■■■ 6.28
ACER3-214ENST00000534206 WIZO95785 1651 aa54.25■■■■■ 6.28
ACER3-214ENST00000534206 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP54.12■■■■■ 6.25
ACER3-214ENST00000534206 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.99■■■■■ 6.23
ACER3-214ENST00000534206 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.98■■■■■ 6.23
ACER3-214ENST00000534206 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.97■■■■■ 6.23
ACER3-214ENST00000534206 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.89■■■■■ 6.22
ACER3-214ENST00000534206 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.53■■■■■ 6.16
ACER3-214ENST00000534206 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.52■■■■■ 6.16
ACER3-214ENST00000534206 CFTRP13569 1480 aa53.44■■■■■ 6.15
ACER3-214ENST00000534206 WDR62O43379 1518 aa53.42■■■■■ 6.14
ACER3-214ENST00000534206 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.33■■■■■ 6.13
ACER3-214ENST00000534206 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.31■■■■■ 6.12
ACER3-214ENST00000534206 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.01■■■■■ 6.08
ACER3-214ENST00000534206 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.96■■■■■ 6.07
ACER3-214ENST00000534206 PRDM2Q13029 1718 aa52.78■■■■■ 6.04
ACER3-214ENST00000534206 TOPBP1Q92547 1522 aa52.37■■■■■ 5.97
ACER3-214ENST00000534206 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52.28■■■■■ 5.96
ACER3-214ENST00000534206 IFT140Q96RY7 1462 aa52.27■■■■■ 5.96
ACER3-214ENST00000534206 OSCARQ8IYS5 282 aa52.24■■■■■ 5.95
ACER3-214ENST00000534206 ABCC8Q09428 1581 aa52.17■■■■■ 5.94
ACER3-214ENST00000534206 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52.15■■■■■ 5.94
ACER3-214ENST00000534206 TRIM41Q8WV44 630 aa52.09■■■■■ 5.93
ACER3-214ENST00000534206 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.93■■■■■ 5.9
ACER3-214ENST00000534206 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.89■■■■■ 5.9
ACER3-214ENST00000534206 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.86■■■■■ 5.89
ACER3-214ENST00000534206 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.8■■■■■ 5.88
ACER3-214ENST00000534206 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.7■■■■■ 5.87
ACER3-214ENST00000534206 SOGA1O94964 1423 aa51.6■■■■■ 5.85
ACER3-214ENST00000534206 CUX1P39880 1505 aa51.59■■■■■ 5.85
ACER3-214ENST00000534206 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa51.56■■■■■ 5.84
ACER3-214ENST00000534206 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.56■■■■■ 5.84
ACER3-214ENST00000534206 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.56■■■■■ 5.84
ACER3-214ENST00000534206 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.55■■■■■ 5.84
ACER3-214ENST00000534206 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.54■■■■■ 5.84
ACER3-214ENST00000534206 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.51■■■■■ 5.84
ACER3-214ENST00000534206 CHD1O14646 1710 aa51.46■■■■■ 5.83
ACER3-214ENST00000534206 ARHGEF11O15085 1522 aa51.42■■■■■ 5.82
ACER3-214ENST00000534206 WDR97A6NE52 1622 aa51.28■■■■■ 5.8
ACER3-214ENST00000534206 FBLN2P98095 1184 aa51.28■■■■■ 5.8
ACER3-214ENST00000534206 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.22■■■■■ 5.79
ACER3-214ENST00000534206 GRIN2BQ13224 1484 aa51.1■■■■■ 5.77
ACER3-214ENST00000534206 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51.07■■■■■ 5.77
ACER3-214ENST00000534206 CYB5RLQ6IPT4 315 aa51.02■■■■■ 5.76
ACER3-214ENST00000534206 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.99■■■■■ 5.75
ACER3-214ENST00000534206 ARAP1Q96P48 1450 aa50.98■■■■■ 5.75
ACER3-214ENST00000534206 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.97■■■■■ 5.75
ACER3-214ENST00000534206 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.97■■■■■ 5.75
ACER3-214ENST00000534206 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.96■■■■■ 5.75
ACER3-214ENST00000534206 SYNJ2O15056 1496 aa50.91■■■■■ 5.74
ACER3-214ENST00000534206 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.88■■■■■ 5.74
ACER3-214ENST00000534206 PBRM1Q86U86 1689 aa50.88■■■■■ 5.74
ACER3-214ENST00000534206 SYNJ1O43426 1573 aa50.81■■■■■ 5.72
ACER3-214ENST00000534206 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.76■■■■■ 5.72
ACER3-214ENST00000534206 TOP2BQ02880 1626 aa50.76■■■■■ 5.72
ACER3-214ENST00000534206 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.76■■■■■ 5.72
ACER3-214ENST00000534206 GRIN2AQ12879 1464 aa50.46■■■■■ 5.67
ACER3-214ENST00000534206 ADAMTS12P58397 1594 aa50.46■■■■■ 5.67
ACER3-214ENST00000534206 NUP160Q12769 1436 aa50.35■■■■■ 5.65
ACER3-214ENST00000534206 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.32■■■■■ 5.65
ACER3-214ENST00000534206 CEP170Q5SW79 1584 aa50.31■■■■■ 5.64
ACER3-214ENST00000534206 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.31■■■■■ 5.64
ACER3-214ENST00000534206 TRHP20396 242 aaPredicted RBP50.27■■■■■ 5.64
ACER3-214ENST00000534206 ERCC6L2Q5T890 1561 aa50.24■■■■■ 5.63
ACER3-214ENST00000534206 SHROOM2Q13796 1616 aa50.08■■■■■ 5.61
ACER3-214ENST00000534206 IGF1RP08069 1367 aa49.83■■■■■ 5.57
ACER3-214ENST00000534206 JPH4Q96JJ6 628 aa49.81■■■■■ 5.56
ACER3-214ENST00000534206 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.78■■■■■ 5.56
ACER3-214ENST00000534206 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.74■■■■■ 5.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms