RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518928.1

TSNARE1-203, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSNARE1, Length 940 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-203ENST00000518928 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-203ENST00000518928 CERKQ8TCT0 537 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-203ENST00000518928 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-203ENST00000518928 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-203ENST00000518928 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-203ENST00000518928 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-203ENST00000518928 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-203ENST00000518928 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-203ENST00000518928 PTPRTO14522 1441 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-203ENST00000518928 APLP2Q06481 763 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-203ENST00000518928 PZPP20742 1482 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-203ENST00000518928 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-203ENST00000518928 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-203ENST00000518928 ABCC3O15438 1527 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 DAPK1P53355 1430 aa22.14■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 TNRQ92752 1358 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 CEP152O94986 1710 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 KIF15Q9NS87 1388 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 PLA2R1Q13018 1463 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1-203ENST00000518928 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-203ENST00000518928 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-203ENST00000518928 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-203ENST00000518928 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-203ENST00000518928 ERVK-7P63135 1459 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-203ENST00000518928 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-203ENST00000518928 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-203ENST00000518928 ERBINQ96RT1 1412 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-203ENST00000518928 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TSNARE1-203ENST00000518928 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TSNARE1-203ENST00000518928 DEPDC5O75140 1603 aa21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1-203ENST00000518928 PKD2Q13563 968 aa21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1-203ENST00000518928 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1-203ENST00000518928 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1-203ENST00000518928 NLRP1Q9C000 1473 aa21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1-203ENST00000518928 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1-203ENST00000518928 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1-203ENST00000518928 ADGRL2O95490 1459 aa21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1-203ENST00000518928 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1-203ENST00000518928 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-203ENST00000518928 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.89■■□□□ 1.1
TSNARE1-203ENST00000518928 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TSNARE1-203ENST00000518928 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TSNARE1-203ENST00000518928 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1-203ENST00000518928 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1-203ENST00000518928 SYNMO15061 1565 aa21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1-203ENST00000518928 MED14O60244 1454 aa21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1-203ENST00000518928 PIK3C2BO00750 1634 aa21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1-203ENST00000518928 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-203ENST00000518928 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-203ENST00000518928 IQGAP1P46940 1657 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-203ENST00000518928 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-203ENST00000518928 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-203ENST00000518928 LTKP29376 864 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-203ENST00000518928 KANK1Q14678 1352 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-203ENST00000518928 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-203ENST00000518928 ITGAEP38570 1179 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-203ENST00000518928 NOS1P29475 1434 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-203ENST00000518928 IDI1Q13907 227 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-203ENST00000518928 SLIT1O75093 1534 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-203ENST00000518928 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1-203ENST00000518928 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
TSNARE1-203ENST00000518928 UNC13BO14795 1591 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-203ENST00000518928 ALKQ9UM73 1620 aa21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1-203ENST00000518928 CPS1P31327 1500 aa21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1-203ENST00000518928 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1-203ENST00000518928 ROCK1Q13464 1354 aa21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1-203ENST00000518928 TET3O43151 1660 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-203ENST00000518928 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-203ENST00000518928 ADGRB3O60242 1522 aa21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-203ENST00000518928 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-203ENST00000518928 E9PCH4 1651 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-203ENST00000518928 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.67■■□□□ 1.06
TSNARE1-203ENST00000518928 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.67■■□□□ 1.06
TSNARE1-203ENST00000518928 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.66■■□□□ 1.06
TSNARE1-203ENST00000518928 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TSNARE1-203ENST00000518928 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.66■■□□□ 1.06
TSNARE1-203ENST00000518928 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1-203ENST00000518928 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1-203ENST00000518928 PIP4K2BP78356 416 aa21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1-203ENST00000518928 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-203ENST00000518928 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-203ENST00000518928 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-203ENST00000518928 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-203ENST00000518928 NUP155O75694 1391 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-203ENST00000518928 EID1Q9Y6B2 187 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-203ENST00000518928 ZFYVE9O95405 1425 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-203ENST00000518928 HSPA1LP34931 641 aa21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1-203ENST00000518928 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.6■■□□□ 1.05
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