RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
NELFE-212ENST00000492539 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.74■■■□□ 2.67
NELFE-212ENST00000492539 KIF3BO15066 747 aa31.73■■■□□ 2.67
NELFE-212ENST00000492539 PZPP20742 1482 aa31.72■■■□□ 2.67
NELFE-212ENST00000492539 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
NELFE-212ENST00000492539 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.68■■■□□ 2.66
NELFE-212ENST00000492539 MAP3K1Q13233 1512 aa31.67■■■□□ 2.66
NELFE-212ENST00000492539 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
NELFE-212ENST00000492539 TNRQ92752 1358 aa31.66■■■□□ 2.66
NELFE-212ENST00000492539 TSPY4P0CV99 314 aa31.64■■■□□ 2.66
NELFE-212ENST00000492539 TSPY10P0CW01 314 aa31.64■■■□□ 2.66
NELFE-212ENST00000492539 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
NELFE-212ENST00000492539 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.63■■■□□ 2.65
NELFE-212ENST00000492539 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
NELFE-212ENST00000492539 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.62■■■□□ 2.65
NELFE-212ENST00000492539 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.6■■■□□ 2.65
NELFE-212ENST00000492539 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
NELFE-212ENST00000492539 MIA2Q96PC5 1412 aa31.58■■■□□ 2.65
NELFE-212ENST00000492539 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.65
NELFE-212ENST00000492539 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
NELFE-212ENST00000492539 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.56■■■□□ 2.64
NELFE-212ENST00000492539 NLRP1Q9C000 1473 aa31.56■■■□□ 2.64
NELFE-212ENST00000492539 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.56■■■□□ 2.64
NELFE-212ENST00000492539 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.53■■■□□ 2.64
NELFE-212ENST00000492539 ABCC3O15438 1527 aa31.53■■■□□ 2.64
NELFE-212ENST00000492539 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.52■■■□□ 2.64
NELFE-212ENST00000492539 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.51■■■□□ 2.63
NELFE-212ENST00000492539 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.48■■■□□ 2.632e-7■■■■□ 20.6
NELFE-212ENST00000492539 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.48■■■□□ 2.63
NELFE-212ENST00000492539 DEPDC5O75140 1603 aa31.48■■■□□ 2.63
NELFE-212ENST00000492539 CPS1P31327 1500 aa31.46■■■□□ 2.63
NELFE-212ENST00000492539 CEP152O94986 1710 aa31.45■■■□□ 2.63
NELFE-212ENST00000492539 ILDR2Q71H61 639 aa31.45■■■□□ 2.63
NELFE-212ENST00000492539 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
NELFE-212ENST00000492539 MED14O60244 1454 aa31.45■■■□□ 2.62
NELFE-212ENST00000492539 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.44■■■□□ 2.62
NELFE-212ENST00000492539 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.44■■■□□ 2.62
NELFE-212ENST00000492539 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.44■■■□□ 2.62
NELFE-212ENST00000492539 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.43■■■□□ 2.62
NELFE-212ENST00000492539 ERVK-7P63135 1459 aa31.42■■■□□ 2.62
NELFE-212ENST00000492539 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.42■■■□□ 2.62
NELFE-212ENST00000492539 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
NELFE-212ENST00000492539 IQGAP1P46940 1657 aa31.38■■■□□ 2.61
NELFE-212ENST00000492539 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.38■■■□□ 2.61
NELFE-212ENST00000492539 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
NELFE-212ENST00000492539 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
NELFE-212ENST00000492539 ABCC5O15440 1437 aa31.35■■■□□ 2.61
NELFE-212ENST00000492539 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.34■■■□□ 2.61
NELFE-212ENST00000492539 ERBINQ96RT1 1412 aa31.32■■■□□ 2.61
NELFE-212ENST00000492539 KIF15Q9NS87 1388 aa31.32■■■□□ 2.6
NELFE-212ENST00000492539 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.3■■■□□ 2.6
NELFE-212ENST00000492539 SOCS7O14512 581 aa31.28■■■□□ 2.6
NELFE-212ENST00000492539 DAPK1P53355 1430 aa31.28■■■□□ 2.6
NELFE-212ENST00000492539 STRCP1A6NGW2 1772 aa31.28■■■□□ 2.6
NELFE-212ENST00000492539 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.25■■■□□ 2.59
NELFE-212ENST00000492539 TOM1O60784 492 aa31.25■■■□□ 2.59
NELFE-212ENST00000492539 APLP2Q06481 763 aa31.24■■■□□ 2.59
NELFE-212ENST00000492539 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.23■■■□□ 2.59
NELFE-212ENST00000492539 ALKQ9UM73 1620 aa31.23■■■□□ 2.59
NELFE-212ENST00000492539 SYNMO15061 1565 aa31.22■■■□□ 2.59
NELFE-212ENST00000492539 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.21■■■□□ 2.59
NELFE-212ENST00000492539 SLIT1O75093 1534 aa31.21■■■□□ 2.59
NELFE-212ENST00000492539 PIP4K2BP78356 416 aa31.19■■■□□ 2.58
NELFE-212ENST00000492539 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
NELFE-212ENST00000492539 HSPA1LP34931 641 aa31.18■■■□□ 2.58
NELFE-212ENST00000492539 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
NELFE-212ENST00000492539 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.17■■■□□ 2.58
NELFE-212ENST00000492539 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.16■■■□□ 2.58
NELFE-212ENST00000492539 PIK3C2BO00750 1634 aa31.16■■■□□ 2.58
NELFE-212ENST00000492539 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.13■■■□□ 2.57
NELFE-212ENST00000492539 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
NELFE-212ENST00000492539 KANK1Q14678 1352 aa31.12■■■□□ 2.57
NELFE-212ENST00000492539 LTKP29376 864 aa31.11■■■□□ 2.57
NELFE-212ENST00000492539 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.11■■■□□ 2.571e-6■■□□□ 11.9
NELFE-212ENST00000492539 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
NELFE-212ENST00000492539 ADGRL2O95490 1459 aa31.08■■■□□ 2.57
NELFE-212ENST00000492539 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.08■■■□□ 2.57
NELFE-212ENST00000492539 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.07■■■□□ 2.56
NELFE-212ENST00000492539 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
NELFE-212ENST00000492539 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.05■■■□□ 2.56
NELFE-212ENST00000492539 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.04■■■□□ 2.56
NELFE-212ENST00000492539 EID1Q9Y6B2 187 aa31.02■■■□□ 2.56
NELFE-212ENST00000492539 NOS1P29475 1434 aa31.01■■■□□ 2.55
NELFE-212ENST00000492539 IDI1Q13907 227 aa30.98■■■□□ 2.55
NELFE-212ENST00000492539 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.96■■■□□ 2.55
NELFE-212ENST00000492539 ADGRB3O60242 1522 aa30.96■■■□□ 2.55
NELFE-212ENST00000492539 TET3O43151 1660 aa30.94■■■□□ 2.54
NELFE-212ENST00000492539 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.92■■■□□ 2.54
NELFE-212ENST00000492539 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
NELFE-212ENST00000492539 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
NELFE-212ENST00000492539 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.88■■■□□ 2.53
NELFE-212ENST00000492539 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.85■■■□□ 2.53
NELFE-212ENST00000492539 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.84■■■□□ 2.53
NELFE-212ENST00000492539 UNC13BO14795 1591 aa30.84■■■□□ 2.53
NELFE-212ENST00000492539 NWD1Q149M9 1564 aa30.83■■■□□ 2.53
NELFE-212ENST00000492539 KCNA6P17658 529 aa30.82■■■□□ 2.52
NELFE-212ENST00000492539 TMEM94Q12767 1356 aa30.81■■■□□ 2.52
NELFE-212ENST00000492539 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
NELFE-212ENST00000492539 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.8■■■□□ 2.52
NELFE-212ENST00000492539 ZFYVE9O95405 1425 aa30.79■■■□□ 2.52
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