RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490633.1

LAMTOR4-211, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, humanhuman

TSL 3

Gene LAMTOR4, Length 401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4-211ENST00000490633 KIF3BO15066 747 aa22.37■■□□□ 1.17
LAMTOR4-211ENST00000490633 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.36■■□□□ 1.17
LAMTOR4-211ENST00000490633 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LAMTOR4-211ENST00000490633 PZPP20742 1482 aa22.34■■□□□ 1.17
LAMTOR4-211ENST00000490633 TNRQ92752 1358 aa22.33■■□□□ 1.17
LAMTOR4-211ENST00000490633 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.33■■□□□ 1.16
LAMTOR4-211ENST00000490633 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.33■■□□□ 1.16
LAMTOR4-211ENST00000490633 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LAMTOR4-211ENST00000490633 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.31■■□□□ 1.16
LAMTOR4-211ENST00000490633 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.31■■□□□ 1.16
LAMTOR4-211ENST00000490633 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.28■■□□□ 1.16
LAMTOR4-211ENST00000490633 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.27■■□□□ 1.16
LAMTOR4-211ENST00000490633 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.26■■□□□ 1.15
LAMTOR4-211ENST00000490633 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.25■■□□□ 1.15
LAMTOR4-211ENST00000490633 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.157e-6■■■□□ 16.5
LAMTOR4-211ENST00000490633 SOCS7O14512 581 aa22.24■■□□□ 1.15
LAMTOR4-211ENST00000490633 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.23■■□□□ 1.15
LAMTOR4-211ENST00000490633 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LAMTOR4-211ENST00000490633 MIA2Q96PC5 1412 aa22.23■■□□□ 1.15
LAMTOR4-211ENST00000490633 TSPY4P0CV99 314 aa22.22■■□□□ 1.15
LAMTOR4-211ENST00000490633 TSPY10P0CW01 314 aa22.22■■□□□ 1.15
LAMTOR4-211ENST00000490633 NLRP1Q9C000 1473 aa22.22■■□□□ 1.15
LAMTOR4-211ENST00000490633 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.21■■□□□ 1.15
LAMTOR4-211ENST00000490633 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.21■■□□□ 1.15
LAMTOR4-211ENST00000490633 ABCC3O15438 1527 aa22.21■■□□□ 1.15
LAMTOR4-211ENST00000490633 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.2■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 CPS1P31327 1500 aa22.19■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.19■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.19■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.17■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 DEPDC5O75140 1603 aa22.17■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 CEP152O94986 1710 aa22.16■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 MED14O60244 1454 aa22.15■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.14■■□□□ 1.14
LAMTOR4-211ENST00000490633 PIP4K2BP78356 416 aa22.14■■□□□ 1.13
LAMTOR4-211ENST00000490633 ERVK-7P63135 1459 aa22.14■■□□□ 1.13
LAMTOR4-211ENST00000490633 IQGAP1P46940 1657 aa22.14■■□□□ 1.13
LAMTOR4-211ENST00000490633 MAP3K1Q13233 1512 aa22.13■■□□□ 1.13
LAMTOR4-211ENST00000490633 HSPA1LP34931 641 aa22.12■■□□□ 1.13
LAMTOR4-211ENST00000490633 ALKQ9UM73 1620 aa22.1■■□□□ 1.13
LAMTOR4-211ENST00000490633 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.1■■□□□ 1.13
LAMTOR4-211ENST00000490633 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.08■■□□□ 1.13
LAMTOR4-211ENST00000490633 TOM1O60784 492 aa22.08■■□□□ 1.13
LAMTOR4-211ENST00000490633 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.07■■□□□ 1.12
LAMTOR4-211ENST00000490633 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.07■■□□□ 1.12
LAMTOR4-211ENST00000490633 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
LAMTOR4-211ENST00000490633 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LAMTOR4-211ENST00000490633 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
LAMTOR4-211ENST00000490633 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.03■■□□□ 1.12
LAMTOR4-211ENST00000490633 KIF15Q9NS87 1388 aa22.03■■□□□ 1.12
LAMTOR4-211ENST00000490633 ABCC5O15440 1437 aa22.03■■□□□ 1.12
LAMTOR4-211ENST00000490633 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.02■■□□□ 1.12
LAMTOR4-211ENST00000490633 SYNMO15061 1565 aa22■■□□□ 1.11
LAMTOR4-211ENST00000490633 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22■■□□□ 1.11
LAMTOR4-211ENST00000490633 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
LAMTOR4-211ENST00000490633 ERBINQ96RT1 1412 aa21.99■■□□□ 1.11
LAMTOR4-211ENST00000490633 DAPK1P53355 1430 aa21.97■■□□□ 1.11
LAMTOR4-211ENST00000490633 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.97■■□□□ 1.11
LAMTOR4-211ENST00000490633 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.97■■□□□ 1.11
LAMTOR4-211ENST00000490633 LTKP29376 864 aa21.97■■□□□ 1.11
LAMTOR4-211ENST00000490633 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
LAMTOR4-211ENST00000490633 PIK3C2BO00750 1634 aa21.97■■□□□ 1.11
LAMTOR4-211ENST00000490633 SLIT1O75093 1534 aa21.96■■□□□ 1.11
LAMTOR4-211ENST00000490633 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
LAMTOR4-211ENST00000490633 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.94■■□□□ 1.1
LAMTOR4-211ENST00000490633 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.92■■□□□ 1.1
LAMTOR4-211ENST00000490633 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
LAMTOR4-211ENST00000490633 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.9■■□□□ 1.1
LAMTOR4-211ENST00000490633 APLP2Q06481 763 aa21.88■■□□□ 1.09
LAMTOR4-211ENST00000490633 KANK1Q14678 1352 aa21.87■■□□□ 1.09
LAMTOR4-211ENST00000490633 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.87■■□□□ 1.09
LAMTOR4-211ENST00000490633 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.87■■□□□ 1.09
LAMTOR4-211ENST00000490633 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.86■■□□□ 1.09
LAMTOR4-211ENST00000490633 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.85■■□□□ 1.09
LAMTOR4-211ENST00000490633 EID1Q9Y6B2 187 aa21.85■■□□□ 1.09
LAMTOR4-211ENST00000490633 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
LAMTOR4-211ENST00000490633 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
LAMTOR4-211ENST00000490633 IDI1Q13907 227 aa21.83■■□□□ 1.09
LAMTOR4-211ENST00000490633 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.83■■□□□ 1.09
LAMTOR4-211ENST00000490633 NOS1P29475 1434 aa21.8■■□□□ 1.08
LAMTOR4-211ENST00000490633 ADGRB3O60242 1522 aa21.8■■□□□ 1.08
LAMTOR4-211ENST00000490633 ADGRL2O95490 1459 aa21.79■■□□□ 1.08
LAMTOR4-211ENST00000490633 TET3O43151 1660 aa21.79■■□□□ 1.08
LAMTOR4-211ENST00000490633 TMEM94Q12767 1356 aa21.77■■□□□ 1.08
LAMTOR4-211ENST00000490633 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.77■■□□□ 1.08
LAMTOR4-211ENST00000490633 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
LAMTOR4-211ENST00000490633 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LAMTOR4-211ENST00000490633 KCNA6P17658 529 aa21.72■■□□□ 1.07
LAMTOR4-211ENST00000490633 NWD1Q149M9 1564 aa21.72■■□□□ 1.07
LAMTOR4-211ENST00000490633 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.72■■□□□ 1.07
LAMTOR4-211ENST00000490633 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.71■■□□□ 1.07
LAMTOR4-211ENST00000490633 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.71■■□□□ 1.07
LAMTOR4-211ENST00000490633 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.7■■□□□ 1.06
LAMTOR4-211ENST00000490633 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.7■■□□□ 1.06
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