RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490316.6

MTMR1-211, Transcript of myotubularin related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MTMR1, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1-211ENST00000490316 NCOA1Q15788 1441 aa45.53■■■■■ 4.88
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP45.52■■■■■ 4.88
MTMR1-211ENST00000490316 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa45.52■■■■■ 4.88
MTMR1-211ENST00000490316 PTPRTO14522 1441 aa45.52■■■■■ 4.88
MTMR1-211ENST00000490316 CERKQ8TCT0 537 aa45.49■■■■■ 4.87
MTMR1-211ENST00000490316 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP45.48■■■■■ 4.87
MTMR1-211ENST00000490316 FGD6Q6ZV73 1430 aa45.47■■■■■ 4.87
MTMR1-211ENST00000490316 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP45.45■■■■■ 4.87
MTMR1-211ENST00000490316 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP45.45■■■■■ 4.87
MTMR1-211ENST00000490316 ABCC5O15440 1437 aa45.45■■■■■ 4.87
MTMR1-211ENST00000490316 PZPP20742 1482 aa45.44■■■■■ 4.87
MTMR1-211ENST00000490316 CROCC2H7BZ55 1655 aa45.44■■■■■ 4.86
MTMR1-211ENST00000490316 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
MTMR1-211ENST00000490316 SHANK2Q9UPX8 1470 aa45.42■■■■■ 4.86
MTMR1-211ENST00000490316 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
MTMR1-211ENST00000490316 DUOX2Q9NRD8 1548 aa45.41■■■■■ 4.86
MTMR1-211ENST00000490316 DAPK1P53355 1430 aa45.37■■■■■ 4.85
MTMR1-211ENST00000490316 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
MTMR1-211ENST00000490316 A2ML1A8K2U0 1454 aa45.36■■■■■ 4.85
MTMR1-211ENST00000490316 TNRQ92752 1358 aa45.36■■■■■ 4.85
MTMR1-211ENST00000490316 PLA2R1Q13018 1463 aa45.36■■■■■ 4.85
MTMR1-211ENST00000490316 KIF15Q9NS87 1388 aa45.33■■■■■ 4.85
MTMR1-211ENST00000490316 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa45.33■■■■■ 4.85
MTMR1-211ENST00000490316 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP45.33■■■■■ 4.85
MTMR1-211ENST00000490316 ABCC3O15438 1527 aa45.31■■■■■ 4.84
MTMR1-211ENST00000490316 PKD2Q13563 968 aa45.3■■■■■ 4.84
MTMR1-211ENST00000490316 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa45.3■■■■■ 4.84
MTMR1-211ENST00000490316 MROH1Q8NDA8 1641 aa45.3■■■■■ 4.84
MTMR1-211ENST00000490316 ERBINQ96RT1 1412 aa45.26■■■■■ 4.84
MTMR1-211ENST00000490316 CHIC2Q9UKJ5 165 aa45.19■■■■■ 4.82
MTMR1-211ENST00000490316 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa45.19■■■■■ 4.82
MTMR1-211ENST00000490316 CEP152O94986 1710 aa45.18■■■■■ 4.82
MTMR1-211ENST00000490316 NLRP1Q9C000 1473 aa45.18■■■■■ 4.82
MTMR1-211ENST00000490316 LTBP4Q8N2S1 1624 aa45.17■■■■■ 4.82
MTMR1-211ENST00000490316 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
MTMR1-211ENST00000490316 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
MTMR1-211ENST00000490316 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa45.14■■■■■ 4.82
MTMR1-211ENST00000490316 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
MTMR1-211ENST00000490316 ERVK-7P63135 1459 aa45.09■■■■■ 4.81
MTMR1-211ENST00000490316 DEPDC5O75140 1603 aa45.08■■■■■ 4.81
MTMR1-211ENST00000490316 UGGT1Q9NYU2 1555 aa45.08■■■■■ 4.81
MTMR1-211ENST00000490316 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP45.05■■■■■ 4.8
MTMR1-211ENST00000490316 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP45.05■■■■■ 4.8
MTMR1-211ENST00000490316 ADGRL2O95490 1459 aa45.04■■■■■ 4.8
MTMR1-211ENST00000490316 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP45.04■■■■■ 4.8
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
MTMR1-211ENST00000490316 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa45.01■■■■■ 4.8
MTMR1-211ENST00000490316 KANK1Q14678 1352 aa45.01■■■■■ 4.8
MTMR1-211ENST00000490316 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP45■■■■■ 4.79
MTMR1-211ENST00000490316 ANKLE2Q86XL3 938 aa44.99■■■■■ 4.79
MTMR1-211ENST00000490316 IQSEC2Q5JU85 1478 aa44.98■■■■■ 4.79
MTMR1-211ENST00000490316 NEURL4Q96JN8 1562 aa44.98■■■■■ 4.79
MTMR1-211ENST00000490316 VWDEQ8N2E2 1590 aa44.9■■■■■ 4.78
MTMR1-211ENST00000490316 LMTK2Q8IWU2 1503 aa44.89■■■■■ 4.78
MTMR1-211ENST00000490316 MED14O60244 1454 aa44.85■■■■■ 4.77
MTMR1-211ENST00000490316 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa44.84■■■■■ 4.77
MTMR1-211ENST00000490316 UBR1Q8IWV7 1749 aa44.84■■■■■ 4.77
MTMR1-211ENST00000490316 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP44.82■■■■■ 4.77
MTMR1-211ENST00000490316 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.81■■■■■ 4.76
MTMR1-211ENST00000490316 EFCAB6Q5THR3 1501 aa44.74■■■■■ 4.75
MTMR1-211ENST00000490316 IQGAP1P46940 1657 aa44.74■■■■■ 4.75
MTMR1-211ENST00000490316 ROCK1Q13464 1354 aa44.71■■■■■ 4.75
MTMR1-211ENST00000490316 PIK3C2BO00750 1634 aa44.7■■■■■ 4.75
MTMR1-211ENST00000490316 CPS1P31327 1500 aa44.69■■■■■ 4.74
MTMR1-211ENST00000490316 SLIT1O75093 1534 aa44.67■■■■■ 4.74
MTMR1-211ENST00000490316 ARHGAP23Q9P227 1491 aa44.66■■■■■ 4.74
MTMR1-211ENST00000490316 IDI1Q13907 227 aa44.64■■■■■ 4.74
MTMR1-211ENST00000490316 NOS1P29475 1434 aa44.64■■■■■ 4.74
MTMR1-211ENST00000490316 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
MTMR1-211ENST00000490316 SYNMO15061 1565 aa44.64■■■■■ 4.74
MTMR1-211ENST00000490316 UBAP1LF5GYI3 381 aa44.63■■■■■ 4.74
MTMR1-211ENST00000490316 STAG3Q9UJ98 1225 aa44.63■■■■■ 4.74
MTMR1-211ENST00000490316 ITGAEP38570 1179 aa44.62■■■■■ 4.73
MTMR1-211ENST00000490316 LTKP29376 864 aa44.61■■■■■ 4.73
MTMR1-211ENST00000490316 TXNDC2Q86VQ3 553 aa44.61■■■■■ 4.73
MTMR1-211ENST00000490316 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP44.61■■■■■ 4.73
MTMR1-211ENST00000490316 UNC13BO14795 1591 aa44.6■■■■■ 4.73
MTMR1-211ENST00000490316 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
MTMR1-211ENST00000490316 EID1Q9Y6B2 187 aa44.58■■■■■ 4.73
MTMR1-211ENST00000490316 TET3O43151 1660 aa44.58■■■■■ 4.73
MTMR1-211ENST00000490316 TMEM2Q9UHN6 1383 aa44.56■■■■■ 4.72
MTMR1-211ENST00000490316 SLC52A1Q9NWF4 448 aa44.54■■■■■ 4.72
MTMR1-211ENST00000490316 GCC2Q8IWJ2 1684 aa44.51■■■■■ 4.72
MTMR1-211ENST00000490316 ADGRB3O60242 1522 aa44.46■■■■■ 4.71
MTMR1-211ENST00000490316 STRCP1A6NGW2 1772 aa44.46■■■■■ 4.71
MTMR1-211ENST00000490316 IQGAP3Q86VI3 1631 aa44.43■■■■■ 4.7
MTMR1-211ENST00000490316 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
MTMR1-211ENST00000490316 TOM1O60784 492 aa44.4■■■■■ 4.7
MTMR1-211ENST00000490316 NUP155O75694 1391 aa44.39■■■■■ 4.7
MTMR1-211ENST00000490316 E9PCH4 1651 aa44.39■■■■■ 4.7
MTMR1-211ENST00000490316 LRRC7Q96NW7 1537 aa44.36■■■■■ 4.69
MTMR1-211ENST00000490316 PIP4K2BP78356 416 aa44.29■■■■■ 4.68
MTMR1-211ENST00000490316 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP44.28■■■■■ 4.68
MTMR1-211ENST00000490316 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa44.27■■■■■ 4.68
MTMR1-211ENST00000490316 MYO5BQ9ULV0 1848 aa44.27■■■■■ 4.68
MTMR1-211ENST00000490316 ZFYVE9O95405 1425 aa44.22■■■■■ 4.67
MTMR1-211ENST00000490316 SLC26A8Q96RN1 970 aa44.21■■■■■ 4.67
MTMR1-211ENST00000490316 ALKQ9UM73 1620 aa44.21■■■■■ 4.67
MTMR1-211ENST00000490316 HDGFP51858 240 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
MTMR1-211ENST00000490316 DISP3Q9P2K9 1392 aa44.18■■■■■ 4.66
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