RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490316.6

MTMR1-211, Transcript of myotubularin related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MTMR1, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1-211ENST00000490316 NISCHQ9Y2I1 1504 aa72.21■■■■■ 9.15
MTMR1-211ENST00000490316 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa64.57■■■■■ 7.93
MTMR1-211ENST00000490316 ABCC9O60706 1549 aa64.02■■■■■ 7.84
MTMR1-211ENST00000490316 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa61.2■■■■■ 7.39
MTMR1-211ENST00000490316 NACADO15069 1562 aa60.92■■■■■ 7.34
MTMR1-211ENST00000490316 DCAF8L2P0C7V8 631 aa60.73■■■■■ 7.31
MTMR1-211ENST00000490316 MYO15BQ96JP2 1530 aa60.27■■■■■ 7.24
MTMR1-211ENST00000490316 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP59.95■■■■■ 7.19
MTMR1-211ENST00000490316 UNC13AQ9UPW8 1703 aa59.81■■■■■ 7.17
MTMR1-211ENST00000490316 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa59.7■■■■■ 7.15
MTMR1-211ENST00000490316 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP59.69■■■■■ 7.15
MTMR1-211ENST00000490316 DNAJC5BQ9UF47 199 aa59.57■■■■■ 7.13
MTMR1-211ENST00000490316 BICRAQ9NZM4 1560 aa59.38■■■■■ 7.1
MTMR1-211ENST00000490316 SCRIBQ14160 1630 aa58.85■■■■■ 7.01
MTMR1-211ENST00000490316 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa58.66■■■■■ 6.98
MTMR1-211ENST00000490316 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP57.88■■■■■ 6.86
MTMR1-211ENST00000490316 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa57.87■■■■■ 6.85
MTMR1-211ENST00000490316 CECR2Q9BXF3 1484 aa57.61■■■■■ 6.81
MTMR1-211ENST00000490316 NCAPD3P42695 1498 aa56.24■■■■■ 6.59
MTMR1-211ENST00000490316 SMARCA4P51532 1647 aa56.21■■■■■ 6.59
MTMR1-211ENST00000490316 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa56.13■■■■■ 6.58
MTMR1-211ENST00000490316 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP56.03■■■■■ 6.56
MTMR1-211ENST00000490316 SMARCA2P51531 1590 aa56.01■■■■■ 6.56
MTMR1-211ENST00000490316 HMGXB3Q12766 1538 aa55.86■■■■■ 6.53
MTMR1-211ENST00000490316 PEG3Q9GZU2 1588 aa55.67■■■■■ 6.5
MTMR1-211ENST00000490316 MROH2BQ7Z745 1585 aa55.64■■■■■ 6.5
MTMR1-211ENST00000490316 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP55.62■■■■■ 6.49
MTMR1-211ENST00000490316 ERCC6Q03468 1493 aa55.24■■■■■ 6.43
MTMR1-211ENST00000490316 NESP48681 1621 aa55.15■■■■■ 6.42
MTMR1-211ENST00000490316 WIZO95785 1651 aa55■■■■■ 6.4
MTMR1-211ENST00000490316 CUX2O14529 1486 aa54.97■■■■■ 6.39
MTMR1-211ENST00000490316 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.89■■■■■ 6.38
MTMR1-211ENST00000490316 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP54.69■■■■■ 6.34
MTMR1-211ENST00000490316 PDS5BQ9NTI5 1447 aa54.55■■■■■ 6.32
MTMR1-211ENST00000490316 CADPSQ9ULU8 1353 aa54.55■■■■■ 6.32
MTMR1-211ENST00000490316 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP54.48■■■■■ 6.31
MTMR1-211ENST00000490316 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa54.46■■■■■ 6.31
MTMR1-211ENST00000490316 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP54.34■■■■■ 6.29
MTMR1-211ENST00000490316 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54.33■■■■■ 6.29
MTMR1-211ENST00000490316 CFTRP13569 1480 aa54.03■■■■■ 6.24
MTMR1-211ENST00000490316 MRC2Q9UBG0 1479 aa54.03■■■■■ 6.24
MTMR1-211ENST00000490316 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.92■■■■■ 6.22
MTMR1-211ENST00000490316 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.91■■■■■ 6.22
MTMR1-211ENST00000490316 WDR62O43379 1518 aa53.88■■■■■ 6.22
MTMR1-211ENST00000490316 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.73■■■■■ 6.19
MTMR1-211ENST00000490316 PRDM2Q13029 1718 aa53.55■■■■■ 6.16
MTMR1-211ENST00000490316 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP53.43■■■■■ 6.14
MTMR1-211ENST00000490316 TOPBP1Q92547 1522 aa52.96■■■■■ 6.07
MTMR1-211ENST00000490316 ABCC8Q09428 1581 aa52.92■■■■■ 6.06
MTMR1-211ENST00000490316 IFT140Q96RY7 1462 aa52.83■■■■■ 6.05
MTMR1-211ENST00000490316 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52.81■■■■■ 6.05
MTMR1-211ENST00000490316 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.69■■■■■ 6.03
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52.67■■■■■ 6.02
MTMR1-211ENST00000490316 OSCARQ8IYS5 282 aa52.58■■■■■ 6.01
MTMR1-211ENST00000490316 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP52.45■■■■■ 5.99
MTMR1-211ENST00000490316 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP52.45■■■■■ 5.99
MTMR1-211ENST00000490316 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP52.42■■■■■ 5.98
MTMR1-211ENST00000490316 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP52.28■■■■■ 5.963e-7■■■■■ 30.5
MTMR1-211ENST00000490316 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa52.24■■■■■ 5.95
MTMR1-211ENST00000490316 SOGA1O94964 1423 aa52.24■■■■■ 5.95
MTMR1-211ENST00000490316 CUX1P39880 1505 aa52.23■■■■■ 5.95
MTMR1-211ENST00000490316 FGD5Q6ZNL6 1462 aa52.2■■■■■ 5.95
MTMR1-211ENST00000490316 TRIM41Q8WV44 630 aa52.15■■■■■ 5.94
MTMR1-211ENST00000490316 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP52.06■■■■■ 5.92
MTMR1-211ENST00000490316 WDR97A6NE52 1622 aa51.97■■■■■ 5.91
MTMR1-211ENST00000490316 CHD1O14646 1710 aa51.93■■■■■ 5.9
MTMR1-211ENST00000490316 FBLN2P98095 1184 aa51.84■■■■■ 5.89
MTMR1-211ENST00000490316 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa51.8■■■■■ 5.88
MTMR1-211ENST00000490316 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.8■■■■■ 5.88
MTMR1-211ENST00000490316 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.8■■■■■ 5.88
MTMR1-211ENST00000490316 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.76■■■■■ 5.88
MTMR1-211ENST00000490316 GRIN2BQ13224 1484 aa51.72■■■■■ 5.87
MTMR1-211ENST00000490316 ARHGEF11O15085 1522 aa51.69■■■■■ 5.87
MTMR1-211ENST00000490316 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51.67■■■■■ 5.86
MTMR1-211ENST00000490316 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa51.65■■■■■ 5.86
MTMR1-211ENST00000490316 GAPVD1Q14C86 1478 aa51.61■■■■■ 5.85
MTMR1-211ENST00000490316 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.59■■■■■ 5.85
MTMR1-211ENST00000490316 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP51.57■■■■■ 5.85
MTMR1-211ENST00000490316 TOP2BQ02880 1626 aa51.56■■■■■ 5.85
MTMR1-211ENST00000490316 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa51.56■■■■■ 5.85
MTMR1-211ENST00000490316 PBRM1Q86U86 1689 aa51.55■■■■■ 5.84
MTMR1-211ENST00000490316 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa51.52■■■■■ 5.84
MTMR1-211ENST00000490316 SYNJ1O43426 1573 aa51.5■■■■■ 5.84
MTMR1-211ENST00000490316 SYNJ2O15056 1496 aa51.48■■■■■ 5.83
MTMR1-211ENST00000490316 CLASP1Q7Z460 1538 aa51.35■■■■■ 5.81
MTMR1-211ENST00000490316 CYB5RLQ6IPT4 315 aa51.3■■■■■ 5.8
MTMR1-211ENST00000490316 ARAP1Q96P48 1450 aa51.21■■■■■ 5.79
MTMR1-211ENST00000490316 ADAMTS12P58397 1594 aa51.07■■■■■ 5.77
MTMR1-211ENST00000490316 GRIN2AQ12879 1464 aa51.04■■■■■ 5.76
MTMR1-211ENST00000490316 ERICH3Q5RHP9 1530 aa51.02■■■■■ 5.76
MTMR1-211ENST00000490316 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.98■■■■■ 5.75
MTMR1-211ENST00000490316 NUP160Q12769 1436 aa50.85■■■■■ 5.73
MTMR1-211ENST00000490316 CEP170Q5SW79 1584 aa50.83■■■■■ 5.73
MTMR1-211ENST00000490316 KIF27Q86VH2 1401 aa50.58■■■■■ 5.69
MTMR1-211ENST00000490316 ERCC6L2Q5T890 1561 aa50.58■■■■■ 5.69
MTMR1-211ENST00000490316 SHROOM2Q13796 1616 aa50.58■■■■■ 5.69
MTMR1-211ENST00000490316 TRHP20396 242 aaPredicted RBP50.55■■■■■ 5.68
MTMR1-211ENST00000490316 IGF1RP08069 1367 aa50.5■■■■■ 5.67
MTMR1-211ENST00000490316 CUL7Q14999 1698 aa50.39■■■■■ 5.66
MTMR1-211ENST00000490316 JPH4Q96JJ6 628 aa50.36■■■■■ 5.65
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