RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436744.2

NICN1-204, Transcript of nicolin 1, humanhuman

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Gene NICN1, Length 1,271 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-204ENST00000436744 KIF3BO15066 747 aa27.59■■■□□ 2.01
NICN1-204ENST00000436744 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.57■■■□□ 2
NICN1-204ENST00000436744 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.57■■■□□ 2
NICN1-204ENST00000436744 TNRQ92752 1358 aa27.56■■■□□ 2
NICN1-204ENST00000436744 NCOA2Q15596 1464 aa27.56■■■□□ 2
NICN1-204ENST00000436744 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.54■■■□□ 2
NICN1-204ENST00000436744 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
NICN1-204ENST00000436744 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.53■■■□□ 2
NICN1-204ENST00000436744 PZPP20742 1482 aa27.51■■■□□ 2
NICN1-204ENST00000436744 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.49■■□□□ 1.99
NICN1-204ENST00000436744 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
NICN1-204ENST00000436744 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.48■■□□□ 1.99
NICN1-204ENST00000436744 PIP4K2BP78356 416 aa27.46■■□□□ 1.99
NICN1-204ENST00000436744 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.44■■□□□ 1.98
NICN1-204ENST00000436744 HSPA1LP34931 641 aa27.42■■□□□ 1.98
NICN1-204ENST00000436744 MIA2Q96PC5 1412 aa27.41■■□□□ 1.98
NICN1-204ENST00000436744 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.41■■□□□ 1.98
NICN1-204ENST00000436744 CPS1P31327 1500 aa27.41■■□□□ 1.98
NICN1-204ENST00000436744 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.41■■□□□ 1.98
NICN1-204ENST00000436744 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.4■■□□□ 1.98
NICN1-204ENST00000436744 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.39■■□□□ 1.98
NICN1-204ENST00000436744 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.39■■□□□ 1.98
NICN1-204ENST00000436744 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.38■■□□□ 1.97
NICN1-204ENST00000436744 NLRP1Q9C000 1473 aa27.37■■□□□ 1.97
NICN1-204ENST00000436744 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
NICN1-204ENST00000436744 TSPY4P0CV99 314 aa27.36■■□□□ 1.97
NICN1-204ENST00000436744 TSPY10P0CW01 314 aa27.36■■□□□ 1.97
NICN1-204ENST00000436744 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
NICN1-204ENST00000436744 ABCC3O15438 1527 aa27.34■■□□□ 1.97
NICN1-204ENST00000436744 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
NICN1-204ENST00000436744 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.33■■□□□ 1.97
NICN1-204ENST00000436744 TOM1O60784 492 aa27.33■■□□□ 1.97
NICN1-204ENST00000436744 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
NICN1-204ENST00000436744 DEPDC5O75140 1603 aa27.31■■□□□ 1.96
NICN1-204ENST00000436744 ALKQ9UM73 1620 aa27.31■■□□□ 1.96
NICN1-204ENST00000436744 MED14O60244 1454 aa27.31■■□□□ 1.96
NICN1-204ENST00000436744 IQGAP1P46940 1657 aa27.3■■□□□ 1.96
NICN1-204ENST00000436744 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
NICN1-204ENST00000436744 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.29■■□□□ 1.96
NICN1-204ENST00000436744 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.29■■□□□ 1.96
NICN1-204ENST00000436744 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.29■■□□□ 1.96
NICN1-204ENST00000436744 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
NICN1-204ENST00000436744 CEP152O94986 1710 aa27.27■■□□□ 1.96
NICN1-204ENST00000436744 ERVK-7P63135 1459 aa27.27■■□□□ 1.96
NICN1-204ENST00000436744 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.27■■□□□ 1.96
NICN1-204ENST00000436744 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
NICN1-204ENST00000436744 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
NICN1-204ENST00000436744 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.25■■□□□ 1.95
NICN1-204ENST00000436744 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
NICN1-204ENST00000436744 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.21■■□□□ 1.95
NICN1-204ENST00000436744 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.19■■□□□ 1.94
NICN1-204ENST00000436744 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.19■■□□□ 1.94
NICN1-204ENST00000436744 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.15■■□□□ 1.94
NICN1-204ENST00000436744 SYNMO15061 1565 aa27.14■■□□□ 1.93
NICN1-204ENST00000436744 LTKP29376 864 aa27.13■■□□□ 1.93
NICN1-204ENST00000436744 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
NICN1-204ENST00000436744 KIF15Q9NS87 1388 aa27.11■■□□□ 1.93
NICN1-204ENST00000436744 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
NICN1-204ENST00000436744 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.1■■□□□ 1.93
NICN1-204ENST00000436744 MAP3K1Q13233 1512 aa27.1■■□□□ 1.93
NICN1-204ENST00000436744 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
NICN1-204ENST00000436744 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.93
NICN1-204ENST00000436744 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.08■■□□□ 1.92
NICN1-204ENST00000436744 ABCC5O15440 1437 aa27.07■■□□□ 1.92
NICN1-204ENST00000436744 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.07■■□□□ 1.92
NICN1-204ENST00000436744 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.06■■□□□ 1.92
NICN1-204ENST00000436744 SLIT1O75093 1534 aa27.06■■□□□ 1.92
NICN1-204ENST00000436744 PIK3C2BO00750 1634 aa27.05■■□□□ 1.92
NICN1-204ENST00000436744 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
NICN1-204ENST00000436744 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.04■■□□□ 1.92
NICN1-204ENST00000436744 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.03■■□□□ 1.92
NICN1-204ENST00000436744 ERBINQ96RT1 1412 aa27.03■■□□□ 1.92
NICN1-204ENST00000436744 DAPK1P53355 1430 aa26.99■■□□□ 1.91
NICN1-204ENST00000436744 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.97■■□□□ 1.91
NICN1-204ENST00000436744 EID1Q9Y6B2 187 aa26.97■■□□□ 1.91
NICN1-204ENST00000436744 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.97■■□□□ 1.91
NICN1-204ENST00000436744 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.95■■□□□ 1.9
NICN1-204ENST00000436744 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
NICN1-204ENST00000436744 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.92■■□□□ 1.9
NICN1-204ENST00000436744 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.92■■□□□ 1.9
NICN1-204ENST00000436744 IDI1Q13907 227 aa26.92■■□□□ 1.9
NICN1-204ENST00000436744 KANK1Q14678 1352 aa26.92■■□□□ 1.9
NICN1-204ENST00000436744 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
NICN1-204ENST00000436744 TMEM94Q12767 1356 aa26.9■■□□□ 1.9
NICN1-204ENST00000436744 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.89■■□□□ 1.9
NICN1-204ENST00000436744 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.88■■□□□ 1.89
NICN1-204ENST00000436744 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.86■■□□□ 1.89
NICN1-204ENST00000436744 APLP2Q06481 763 aa26.86■■□□□ 1.89
NICN1-204ENST00000436744 TET3O43151 1660 aa26.85■■□□□ 1.89
NICN1-204ENST00000436744 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
NICN1-204ENST00000436744 ADGRB3O60242 1522 aa26.83■■□□□ 1.89
NICN1-204ENST00000436744 NOS1P29475 1434 aa26.82■■□□□ 1.88
NICN1-204ENST00000436744 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.82■■□□□ 1.88
NICN1-204ENST00000436744 KCNA6P17658 529 aa26.82■■□□□ 1.88
NICN1-204ENST00000436744 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.81■■□□□ 1.88
NICN1-204ENST00000436744 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
NICN1-204ENST00000436744 BCANQ96GW7 911 aa26.77■■□□□ 1.88
NICN1-204ENST00000436744 NWD1Q149M9 1564 aa26.75■■□□□ 1.87
NICN1-204ENST00000436744 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.75■■□□□ 1.87
NICN1-204ENST00000436744 POTEAQ6S8J7 498 aa26.74■■□□□ 1.87
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