RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432502.1

NUP50-AS1-202, humanhuman

TSL 2

Gene NUP50-AS1, Length 596 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.82■■■□□ 2.52
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.8■■■□□ 2.52
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PLA2R1Q13018 1463 aa30.78■■■□□ 2.52
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PZPP20742 1482 aa30.75■■■□□ 2.51
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.73■■■□□ 2.51
NUP50-AS1-202ENST00000432502 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.73■■■□□ 2.51
NUP50-AS1-202ENST00000432502 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.73■■■□□ 2.51
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.72■■■□□ 2.51
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PKD2Q13563 968 aa30.71■■■□□ 2.51
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TNRQ92752 1358 aa30.68■■■□□ 2.5
NUP50-AS1-202ENST00000432502 APLP2Q06481 763 aa30.68■■■□□ 2.5
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
NUP50-AS1-202ENST00000432502 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.63■■■□□ 2.49
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.62■■■□□ 2.49
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.62■■■□□ 2.49
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ABCC3O15438 1527 aa30.62■■■□□ 2.49
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.62■■■□□ 2.49
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.61■■■□□ 2.49
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ABCC5O15440 1437 aa30.6■■■□□ 2.49
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.59■■■□□ 2.49
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NLRP1Q9C000 1473 aa30.57■■■□□ 2.48
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.57■■■□□ 2.48
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KIF15Q9NS87 1388 aa30.54■■■□□ 2.48
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DAPK1P53355 1430 aa30.53■■■□□ 2.48
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.53■■■□□ 2.48
NUP50-AS1-202ENST00000432502 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.51■■■□□ 2.47
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ERBINQ96RT1 1412 aa30.51■■■□□ 2.47
NUP50-AS1-202ENST00000432502 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
NUP50-AS1-202ENST00000432502 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.49■■■□□ 2.47
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CEP152O94986 1710 aa30.48■■■□□ 2.47
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ERVK-7P63135 1459 aa30.48■■■□□ 2.47
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.47■■■□□ 2.47
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.47■■■□□ 2.47
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.45■■■□□ 2.47
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.42■■■□□ 2.46
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DEPDC5O75140 1603 aa30.42■■■□□ 2.46
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MED14O60244 1454 aa30.41■■■□□ 2.46
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.4■■■□□ 2.46
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.36■■■□□ 2.45
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ADGRL2O95490 1459 aa30.34■■■□□ 2.45
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CPS1P31327 1500 aa30.33■■■□□ 2.45
NUP50-AS1-202ENST00000432502 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.33■■■□□ 2.45
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KANK1Q14678 1352 aa30.32■■■□□ 2.44
NUP50-AS1-202ENST00000432502 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.32■■■□□ 2.44
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.32■■■□□ 2.44
NUP50-AS1-202ENST00000432502 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.31■■■□□ 2.44
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.31■■■□□ 2.44
NUP50-AS1-202ENST00000432502 IQGAP1P46940 1657 aa30.3■■■□□ 2.44
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.25■■■□□ 2.43
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SLIT1O75093 1534 aa30.24■■■□□ 2.43
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PIK3C2BO00750 1634 aa30.19■■■□□ 2.42
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.19■■■□□ 2.42
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.18■■■□□ 2.42
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LTKP29376 864 aa30.17■■■□□ 2.42
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NOS1P29475 1434 aa30.16■■■□□ 2.42
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.15■■■□□ 2.42
NUP50-AS1-202ENST00000432502 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.15■■■□□ 2.42
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SYNMO15061 1565 aa30.15■■■□□ 2.42
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.14■■■□□ 2.42
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.13■■■□□ 2.41
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TOM1O60784 492 aa30.12■■■□□ 2.41
NUP50-AS1-202ENST00000432502 IDI1Q13907 227 aa30.12■■■□□ 2.41
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EID1Q9Y6B2 187 aa30.1■■■□□ 2.41
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.09■■■□□ 2.41
NUP50-AS1-202ENST00000432502 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.08■■■□□ 2.41
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ROCK1Q13464 1354 aa30.07■■■□□ 2.4
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ALKQ9UM73 1620 aa30.07■■■□□ 2.4
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TET3O43151 1660 aa30.05■■■□□ 2.4
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.05■■■□□ 2.4
NUP50-AS1-202ENST00000432502 UNC13BO14795 1591 aa30.04■■■□□ 2.4
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ADGRB3O60242 1522 aa30.04■■■□□ 2.4
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PIP4K2BP78356 416 aa30.03■■■□□ 2.4
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ILDR2Q71H61 639 aa30■■■□□ 2.39
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.99■■■□□ 2.39
NUP50-AS1-202ENST00000432502 HSPA1LP34931 641 aa29.99■■■□□ 2.39
NUP50-AS1-202ENST00000432502 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.93■■■□□ 2.38
NUP50-AS1-202ENST00000432502 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
NUP50-AS1-202ENST00000432502 E9PCH4 1651 aa29.91■■■□□ 2.38
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZFYVE9O95405 1425 aa29.89■■■□□ 2.38
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.89■■■□□ 2.37
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.88■■■□□ 2.37
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KCNA6P17658 529 aa29.87■■■□□ 2.37
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ITGAEP38570 1179 aa29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms