RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432502.1

NUP50-AS1-202, humanhuman

TSL 2

Gene NUP50-AS1, Length 596 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.8■■■■■ 5.4
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 ABCC9O60706 1549 aa43.46■■■■■ 4.55
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.5■■■■■ 4.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NACADO15069 1562 aa41.29■■■■■ 4.2
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.98■■■■■ 4.15
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.84■■■■■ 4.13
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.63■■■■■ 4.09
NUP50-AS1-202ENST00000432502 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.56■■■■■ 4.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.48■■■■■ 4.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.37■■■■■ 4.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.31■■■■■ 4.04
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.83■■■■□ 3.97
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SCRIBQ14160 1630 aa39.78■■■■□ 3.96
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.3■■■■□ 3.88
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.16■■■■□ 3.86
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NCAPD3P42695 1498 aa38.13■■■■□ 3.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.02■■■■□ 3.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SMARCA4P51532 1647 aa38.01■■■■□ 3.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SMARCA2P51531 1590 aa37.92■■■■□ 3.66
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
NUP50-AS1-202ENST00000432502 HMGXB3Q12766 1538 aa37.86■■■■□ 3.65
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.69■■■■□ 3.62
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.59■■■■□ 3.61
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ERCC6Q03468 1493 aa37.51■■■■□ 3.59
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CUX2O14529 1486 aa37.44■■■■□ 3.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NESP48681 1621 aa37.4■■■■□ 3.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.21■■■■□ 3.55
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.19■■■■□ 3.54
NUP50-AS1-202ENST00000432502 WIZO95785 1651 aa37.12■■■■□ 3.53
NUP50-AS1-202ENST00000432502 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.98■■■■□ 3.51
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.95■■■■□ 3.51
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.93■■■■□ 3.5
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.65■■■■□ 3.46
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CFTRP13569 1480 aa36.59■■■■□ 3.45
NUP50-AS1-202ENST00000432502 WDR62O43379 1518 aa36.57■■■■□ 3.44
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.53■■■■□ 3.44
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.51■■■■□ 3.44
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.27■■■■□ 3.4
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PRDM2Q13029 1718 aa36.22■■■■□ 3.39
NUP50-AS1-202ENST00000432502 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TOPBP1Q92547 1522 aa35.85■■■■□ 3.33
NUP50-AS1-202ENST00000432502 IFT140Q96RY7 1462 aa35.81■■■■□ 3.32
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ABCC8Q09428 1581 aa35.81■■■■□ 3.32
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.74■■■■□ 3.31
NUP50-AS1-202ENST00000432502 OSCARQ8IYS5 282 aa35.73■■■■□ 3.31
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TRIM41Q8WV44 630 aa35.55■■■■□ 3.28
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
NUP50-AS1-202ENST00000432502 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.34■■■■□ 3.25
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SOGA1O94964 1423 aa35.32■■■■□ 3.25
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CUX1P39880 1505 aa35.31■■■■□ 3.24
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.29■■■■□ 3.24
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.24■■■■□ 3.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.24■■■■□ 3.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.24■■■■□ 3.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CHD1O14646 1710 aa35.22■■■■□ 3.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 WDR97A6NE52 1622 aa35.21■■■■□ 3.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ARHGEF11O15085 1522 aa35.16■■■■□ 3.22
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FBLN2P98095 1184 aa35.08■■■■□ 3.21
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.06■■■■□ 3.2
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NUP50-AS1-202ENST00000432502 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.91■■■■□ 3.18
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SYNJ2O15056 1496 aa34.88■■■■□ 3.17
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PBRM1Q86U86 1689 aa34.87■■■■□ 3.17
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.86■■■■□ 3.17
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.86■■■■□ 3.17
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.85■■■■□ 3.17
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ARAP1Q96P48 1450 aa34.84■■■■□ 3.17
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SYNJ1O43426 1573 aa34.83■■■■□ 3.17
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.81■■■■□ 3.16
NUP50-AS1-202ENST00000432502 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.81■■■■□ 3.16
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TOP2BQ02880 1626 aa34.8■■■■□ 3.16
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GRIN2AQ12879 1464 aa34.57■■■■□ 3.12
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ADAMTS12P58397 1594 aa34.57■■■■□ 3.12
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.5■■■■□ 3.11
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.48■■■■□ 3.11
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NUP160Q12769 1436 aa34.47■■■■□ 3.11
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CEP170Q5SW79 1584 aa34.42■■■■□ 3.1
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.3■■■■□ 3.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SHROOM2Q13796 1616 aa34.3■■■■□ 3.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KIF27Q86VH2 1401 aa34.12■■■■□ 3.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 IGF1RP08069 1367 aa34.1■■■■□ 3.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.08■■■■□ 3.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
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