RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.32■■■■■ 4.05
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RP9-201ENST00000297157 KIF3BO15066 747 aa40.28■■■■■ 4.04
RP9-201ENST00000297157 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
RP9-201ENST00000297157 PZPP20742 1482 aa40.27■■■■■ 4.04
RP9-201ENST00000297157 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
RP9-201ENST00000297157 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.22■■■■■ 4.03
RP9-201ENST00000297157 TNRQ92752 1358 aa40.2■■■■■ 4.03
RP9-201ENST00000297157 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
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RP9-201ENST00000297157 TSPY10P0CW01 314 aa40.17■■■■■ 4.02
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RP9-201ENST00000297157 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.11■■■■■ 4.01
RP9-201ENST00000297157 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.1■■■■■ 4.01
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RP9-201ENST00000297157 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.94■■■■□ 3.98
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RP9-201ENST00000297157 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
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RP9-201ENST00000297157 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.9■■■■□ 3.98
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RP9-201ENST00000297157 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.9■■■■□ 3.98
RP9-201ENST00000297157 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.89■■■■□ 3.98
RP9-201ENST00000297157 CEP152O94986 1710 aa39.87■■■■□ 3.97
RP9-201ENST00000297157 VWDEQ8N2E2 1590 aa39.86■■■■□ 3.97
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RP9-201ENST00000297157 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
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RP9-201ENST00000297157 KIF15Q9NS87 1388 aa39.81■■■■□ 3.96
RP9-201ENST00000297157 ERBINQ96RT1 1412 aa39.81■■■■□ 3.96
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RP9-201ENST00000297157 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa39.75■■■■□ 3.95
RP9-201ENST00000297157 DAPK1P53355 1430 aa39.74■■■■□ 3.95
RP9-201ENST00000297157 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.74■■■■□ 3.95
RP9-201ENST00000297157 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.74■■■■□ 3.95
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RP9-201ENST00000297157 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.63■■■■□ 3.94
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RP9-201ENST00000297157 HSPA1LP34931 641 aa39.53■■■■□ 3.92
RP9-201ENST00000297157 PIP4K2BP78356 416 aa39.53■■■■□ 3.92
RP9-201ENST00000297157 KANK1Q14678 1352 aa39.53■■■■□ 3.92
RP9-201ENST00000297157 PIK3C2BO00750 1634 aa39.53■■■■□ 3.92
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RP9-201ENST00000297157 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
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RP9-201ENST00000297157 NWD1Q149M9 1564 aa39.13■■■■□ 3.85
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RP9-201ENST00000297157 TMEM94Q12767 1356 aa39.1■■■■□ 3.85
RP9-201ENST00000297157 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
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