RNA–Protein interactions for RNA: YMR118C

SHH3, Transcript of Putative mitochondrial inner membrane protein of unknown function, yeast

Gene SHH3, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHH3	YMR118C	REV3	P14284	1504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	CLA4	P48562	842 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	ENV9	Q08651	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	SIN3	P22579	1536 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	YPR148C	Q06523	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	TAF2	P23255	1407 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	CST6	P40535	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	CDC4	P07834	779 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	ORC6	P38826	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	VPS70	P47161	811 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	SSK2	P53599	1579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	UFD4	P33202	1483 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SHH3	YMR118C	COX6	P00427	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	SEC2	P17065	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	LAM6	Q08001	693 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	YTA7	P40340	1379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	YPR109W	Q06104	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	POL1	P13382	1468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	STU1	P38198	1513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	SWR1	Q05471	1514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	MTC5	Q03897	1148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	RGR1	P19263	1082 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	RRN7	P40992	514 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	TRM732	Q03496	1420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	BDP1	P46678	594 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	YDL176W	Q12027	708 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHH3	YMR118C	HED1	Q03937	162 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	SPP41	P38904	1435 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	KEX2	P13134	814 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	BPT1	P14772	1559 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	ESP1	Q03018	1630 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	ERF2	Q06551	359 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	MYO4	P32492	1471 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	YPK9	Q12697	1472 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	BUD4	P47136	1447 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	ECM5	Q03214	1411 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	DNA2	P38859	1522 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	YOR1	P53049	1477 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	SCC2	Q04002	1493 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	TAF7	Q05021	590 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SHH3	YMR118C	PBS2	P08018	668 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	ASH1	P34233	588 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	CKB1	P43639	278 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	SSM4	P40318	1319 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	SMC4	Q12267	1418 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	RKR1	Q04781	1562 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	NUP170	P38181	1502 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	STH1	P32597	1359 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	AFT1	P22149	690 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	CLB5	P30283	435 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	HST3	P53687	447 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	MOD5	P07884	428 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	TUB4	P53378	473 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	PUS5	Q06244	254 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	MET32	Q12041	191 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	MAM3	Q12296	706 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	ATG2	P53855	1592 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SHH3	YMR118C	PAN1	P32521	1480 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	AGE1	Q04412	482 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	RPO31	P04051	1460 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	YNL115C	P53925	644 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66

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