RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538923.1

MRE11-208, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, humanhuman

TSL 5

Gene MRE11, Length 558 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11-208ENST00000538923 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.13■□□□□ 0.01
MRE11-208ENST00000538923 AKT1S1Q96B36 256 aa15.13■□□□□ 0.01
MRE11-208ENST00000538923 KCNH8Q96L42 1107 aa15.13■□□□□ 0.01
MRE11-208ENST00000538923 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.09■□□□□ 0.01
MRE11-208ENST00000538923 P3H3Q8IVL6 736 aa15.04■□□□□ -0
MRE11-208ENST00000538923 ATP10BO94823 1461 aa15.03■□□□□ -0
MRE11-208ENST00000538923 ARID3CA6NKF2 412 aa15.03■□□□□ -0
MRE11-208ENST00000538923 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.02■□□□□ -0
MRE11-208ENST00000538923 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.02□□□□□ -0.01
MRE11-208ENST00000538923 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.01□□□□□ -0.01
MRE11-208ENST00000538923 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
MRE11-208ENST00000538923 PROM2Q8N271 834 aa15□□□□□ -0.01
MRE11-208ENST00000538923 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
MRE11-208ENST00000538923 SAMD9Q5K651 1589 aa14.98□□□□□ -0.01
MRE11-208ENST00000538923 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.96□□□□□ -0.01
MRE11-208ENST00000538923 EEA1Q15075 1411 aa14.96□□□□□ -0.01
MRE11-208ENST00000538923 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.95□□□□□ -0.02
MRE11-208ENST00000538923 NEO1Q92859 1461 aa14.95□□□□□ -0.02
MRE11-208ENST00000538923 KIF21BO75037 1637 aa14.94□□□□□ -0.02
MRE11-208ENST00000538923 RAPGEF3O95398 923 aa14.92□□□□□ -0.02
MRE11-208ENST00000538923 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
MRE11-208ENST00000538923 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
MRE11-208ENST00000538923 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
MRE11-208ENST00000538923 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.89□□□□□ -0.03
MRE11-208ENST00000538923 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.89□□□□□ -0.03
MRE11-208ENST00000538923 PTPRMP28827 1452 aa14.87□□□□□ -0.03
MRE11-208ENST00000538923 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.85□□□□□ -0.03
MRE11-208ENST00000538923 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
MRE11-208ENST00000538923 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.85□□□□□ -0.03
MRE11-208ENST00000538923 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.84□□□□□ -0.03
MRE11-208ENST00000538923 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.84□□□□□ -0.03
MRE11-208ENST00000538923 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
MRE11-208ENST00000538923 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.83□□□□□ -0.04
MRE11-208ENST00000538923 FANCAO15360 1455 aa14.82□□□□□ -0.04
MRE11-208ENST00000538923 PITPNM1O00562 1244 aa14.82□□□□□ -0.04
MRE11-208ENST00000538923 AKNAQ7Z591 1439 aa14.82□□□□□ -0.04
MRE11-208ENST00000538923 FBXO3Q9UK99 471 aa14.81□□□□□ -0.04
MRE11-208ENST00000538923 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
MRE11-208ENST00000538923 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.8□□□□□ -0.04
MRE11-208ENST00000538923 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.8□□□□□ -0.04
MRE11-208ENST00000538923 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.79□□□□□ -0.04
MRE11-208ENST00000538923 MADDQ8WXG6 1647 aa14.77□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.76□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.76□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 FBXO41Q8TF61 875 aa14.75□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.75□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.75□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 RICTORQ6R327 1708 aa14.75□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.74□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 PLCH2O75038 1416 aa14.74□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 FMN1Q68DA7 1419 aa14.74□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.73□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.72□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.71□□□□□ -0.05
MRE11-208ENST00000538923 PRR29P0C7W0 189 aa14.7□□□□□ -0.06
MRE11-208ENST00000538923 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.7□□□□□ -0.06
MRE11-208ENST00000538923 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MRE11-208ENST00000538923 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.69□□□□□ -0.06
MRE11-208ENST00000538923 HECW1Q76N89 1606 aa14.69□□□□□ -0.06
MRE11-208ENST00000538923 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.67□□□□□ -0.06
MRE11-208ENST00000538923 MLECQ14165 292 aa14.66□□□□□ -0.06
MRE11-208ENST00000538923 ATP10AO60312 1499 aa14.65□□□□□ -0.06
MRE11-208ENST00000538923 CLIP1P30622 1438 aa14.65□□□□□ -0.06
MRE11-208ENST00000538923 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.65□□□□□ -0.06
MRE11-208ENST00000538923 HSPA2P54652 639 aa14.64□□□□□ -0.07
MRE11-208ENST00000538923 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MRE11-208ENST00000538923 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.63□□□□□ -0.07
MRE11-208ENST00000538923 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.63□□□□□ -0.07
MRE11-208ENST00000538923 KIF14Q15058 1648 aa14.63□□□□□ -0.07
MRE11-208ENST00000538923 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.61□□□□□ -0.07
MRE11-208ENST00000538923 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.61□□□□□ -0.07
MRE11-208ENST00000538923 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.61□□□□□ -0.07
MRE11-208ENST00000538923 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MRE11-208ENST00000538923 AFAP1Q8N556 730 aa14.59□□□□□ -0.07
MRE11-208ENST00000538923 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.57□□□□□ -0.08
MRE11-208ENST00000538923 KDM5CP41229 1560 aa14.57□□□□□ -0.08
MRE11-208ENST00000538923 POTEHQ6S545 545 aa14.57□□□□□ -0.08
MRE11-208ENST00000538923 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.57□□□□□ -0.08
MRE11-208ENST00000538923 MIER1Q8N108 512 aa14.55□□□□□ -0.08
MRE11-208ENST00000538923 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.55□□□□□ -0.08
MRE11-208ENST00000538923 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.55□□□□□ -0.08
MRE11-208ENST00000538923 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MRE11-208ENST00000538923 CERKQ8TCT0 537 aa14.54□□□□□ -0.08
MRE11-208ENST00000538923 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.54□□□□□ -0.08
MRE11-208ENST00000538923 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.54□□□□□ -0.08
MRE11-208ENST00000538923 REREQ9P2R6 1566 aa14.52□□□□□ -0.08
MRE11-208ENST00000538923 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.52□□□□□ -0.08
MRE11-208ENST00000538923 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.51□□□□□ -0.09
MRE11-208ENST00000538923 PLEKHG5O94827 1062 aa14.51□□□□□ -0.09
MRE11-208ENST00000538923 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
MRE11-208ENST00000538923 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.51□□□□□ -0.09
MRE11-208ENST00000538923 ABCC1P33527 1531 aa14.51□□□□□ -0.09
MRE11-208ENST00000538923 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
MRE11-208ENST00000538923 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.49□□□□□ -0.09
MRE11-208ENST00000538923 PREX2Q70Z35 1606 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms