RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 HSPA1LP34931 641 aa11.89□□□□□ -0.51
SMIM20-202ENST00000514384 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
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SMIM20-202ENST00000514384 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.89□□□□□ -0.51
SMIM20-202ENST00000514384 STRCQ7RTU9 1775 aa11.88□□□□□ -0.51
SMIM20-202ENST00000514384 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.87□□□□□ -0.51
SMIM20-202ENST00000514384 SPDYE6P0CI01 402 aa11.87□□□□□ -0.51
SMIM20-202ENST00000514384 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.87□□□□□ -0.51
SMIM20-202ENST00000514384 MLECQ14165 292 aa11.86□□□□□ -0.51
SMIM20-202ENST00000514384 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.86□□□□□ -0.51
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SMIM20-202ENST00000514384 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.84□□□□□ -0.51
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SMIM20-202ENST00000514384 IQSEC2Q5JU85 1478 aa11.83□□□□□ -0.52
SMIM20-202ENST00000514384 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.81□□□□□ -0.52
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SMIM20-202ENST00000514384 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
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SMIM20-202ENST00000514384 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SMIM20-202ENST00000514384 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.75□□□□□ -0.53
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SMIM20-202ENST00000514384 DISP1Q96F81 1524 aa11.73□□□□□ -0.53
SMIM20-202ENST00000514384 POGZQ7Z3K3 1410 aa11.72□□□□□ -0.53
SMIM20-202ENST00000514384 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.72□□□□□ -0.53
SMIM20-202ENST00000514384 TTC37Q6PGP7 1564 aa11.71□□□□□ -0.53
SMIM20-202ENST00000514384 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.71□□□□□ -0.53
SMIM20-202ENST00000514384 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa11.7□□□□□ -0.54
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SMIM20-202ENST00000514384 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.69□□□□□ -0.54
SMIM20-202ENST00000514384 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa11.68□□□□□ -0.54
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SMIM20-202ENST00000514384 IGF1RP08069 1367 aa11.67□□□□□ -0.54
SMIM20-202ENST00000514384 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.67□□□□□ -0.54
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SMIM20-202ENST00000514384 AKNAQ7Z591 1439 aa11.65□□□□□ -0.54
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SMIM20-202ENST00000514384 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa11.63□□□□□ -0.55
SMIM20-202ENST00000514384 NCOA1Q15788 1441 aa11.63□□□□□ -0.55
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SMIM20-202ENST00000514384 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SMIM20-202ENST00000514384 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.6□□□□□ -0.55
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SMIM20-202ENST00000514384 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.58□□□□□ -0.56
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SMIM20-202ENST00000514384 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.56□□□□□ -0.56
SMIM20-202ENST00000514384 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
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SMIM20-202ENST00000514384 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.54□□□□□ -0.56
SMIM20-202ENST00000514384 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.54□□□□□ -0.56
SMIM20-202ENST00000514384 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.54□□□□□ -0.56
SMIM20-202ENST00000514384 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.54□□□□□ -0.56
SMIM20-202ENST00000514384 ABCA8O94911 1581 aa11.54□□□□□ -0.56
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SMIM20-202ENST00000514384 KIF27Q86VH2 1401 aa11.5□□□□□ -0.57
SMIM20-202ENST00000514384 ATP10BO94823 1461 aa11.49□□□□□ -0.57
SMIM20-202ENST00000514384 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.49□□□□□ -0.57
SMIM20-202ENST00000514384 ALKQ9UM73 1620 aa11.49□□□□□ -0.57
SMIM20-202ENST00000514384 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.48□□□□□ -0.57
SMIM20-202ENST00000514384 HECW1Q76N89 1606 aa11.48□□□□□ -0.57
SMIM20-202ENST00000514384 C3P01024 1663 aa11.46□□□□□ -0.57
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SMIM20-202ENST00000514384 PCGF6Q9BYE7 350 aa11.43□□□□□ -0.58
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM52Q96A61 297 aa11.42□□□□□ -0.58
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SMIM20-202ENST00000514384 CPS1P31327 1500 aa11.39□□□□□ -0.59
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SMIM20-202ENST00000514384 SHANK2Q9UPX8 1470 aa11.38□□□□□ -0.59
SMIM20-202ENST00000514384 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.38□□□□□ -0.59
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SMIM20-202ENST00000514384 P3H3Q8IVL6 736 aa11.38□□□□□ -0.59
SMIM20-202ENST00000514384 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.36□□□□□ -0.59
SMIM20-202ENST00000514384 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.36□□□□□ -0.59
SMIM20-202ENST00000514384 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.35□□□□□ -0.59
SMIM20-202ENST00000514384 PLA2R1Q13018 1463 aa11.35□□□□□ -0.59
SMIM20-202ENST00000514384 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
SMIM20-202ENST00000514384 IFFO2Q5TF58 517 aa11.33□□□□□ -0.6
SMIM20-202ENST00000514384 GOLGA3Q08378 1498 aa11.32□□□□□ -0.6
SMIM20-202ENST00000514384 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.32□□□□□ -0.6
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