RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323482.8

ACSS1-201, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSS1, Length 3,680 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-201ENST00000323482 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.69■■□□□ 1.06
ACSS1-201ENST00000323482 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
ACSS1-201ENST00000323482 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
ACSS1-201ENST00000323482 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.68■■□□□ 1.06
ACSS1-201ENST00000323482 GSE1Q14687 1217 aa21.66■■□□□ 1.06
ACSS1-201ENST00000323482 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.66■■□□□ 1.06
ACSS1-201ENST00000323482 FMN1Q68DA7 1419 aa21.65■■□□□ 1.06
ACSS1-201ENST00000323482 UACAQ9BZF9 1416 aa21.65■■□□□ 1.06
ACSS1-201ENST00000323482 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
ACSS1-201ENST00000323482 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.64■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.63■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 RGL3Q3MIN7 710 aa21.63■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 NFKBIBQ15653 356 aa21.62■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.62■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 NAIPQ13075 1403 aa21.62■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.61■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 NCOA2Q15596 1464 aa21.61■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 HFM1A2PYH4 1435 aa21.6■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.59■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.59■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ACSS1-201ENST00000323482 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ACSS1-201ENST00000323482 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.56■■□□□ 1.04
ACSS1-201ENST00000323482 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.56■■□□□ 1.04
ACSS1-201ENST00000323482 CRBNQ96SW2 442 aa21.56■■□□□ 1.04
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC7Q96M83 1385 aa21.55■■□□□ 1.04
ACSS1-201ENST00000323482 TOPBP1Q92547 1522 aa21.54■■□□□ 1.04
ACSS1-201ENST00000323482 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ACSS1-201ENST00000323482 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.52■■□□□ 1.04
ACSS1-201ENST00000323482 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.49■■□□□ 1.03
ACSS1-201ENST00000323482 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
ACSS1-201ENST00000323482 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.49■■□□□ 1.03
ACSS1-201ENST00000323482 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.49■■□□□ 1.03
ACSS1-201ENST00000323482 ARID3AQ99856 593 aa21.48■■□□□ 1.03
ACSS1-201ENST00000323482 BACH2Q9BYV9 841 aa21.48■■□□□ 1.03
ACSS1-201ENST00000323482 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.48■■□□□ 1.03
ACSS1-201ENST00000323482 NEUROD2Q15784 382 aa21.46■■□□□ 1.03
ACSS1-201ENST00000323482 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
ACSS1-201ENST00000323482 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.45■■□□□ 1.02
ACSS1-201ENST00000323482 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.45■■□□□ 1.02
ACSS1-201ENST00000323482 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.45■■□□□ 1.02
ACSS1-201ENST00000323482 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.43■■□□□ 1.02
ACSS1-201ENST00000323482 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.42■■□□□ 1.02
ACSS1-201ENST00000323482 USP35Q9P2H5 1018 aa21.42■■□□□ 1.02
ACSS1-201ENST00000323482 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.42■■□□□ 1.02
ACSS1-201ENST00000323482 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.41■■□□□ 1.02
ACSS1-201ENST00000323482 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.4■■□□□ 1.02
ACSS1-201ENST00000323482 FBLN2P98095 1184 aa21.4■■□□□ 1.02
ACSS1-201ENST00000323482 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ACSS1-201ENST00000323482 PKD2Q13563 968 aa21.37■■□□□ 1.01
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ACSS1-201ENST00000323482 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
ACSS1-201ENST00000323482 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.36■■□□□ 1.01
ACSS1-201ENST00000323482 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.35■■□□□ 1.01
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ACSS1-201ENST00000323482 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
ACSS1-201ENST00000323482 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.32■■□□□ 1
ACSS1-201ENST00000323482 GRIN2BQ13224 1484 aa21.31■■□□□ 1
ACSS1-201ENST00000323482 KDM6BO15054 1643 aa21.31■■□□□ 1
ACSS1-201ENST00000323482 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
ACSS1-201ENST00000323482 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
ACSS1-201ENST00000323482 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.29■■□□□ 1
ACSS1-201ENST00000323482 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.28■■□□□ 1
ACSS1-201ENST00000323482 PRDM2Q13029 1718 aa21.28■■□□□ 1
ACSS1-201ENST00000323482 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
ACSS1-201ENST00000323482 USP47Q96K76 1375 aa21.28■■□□□ 1
ACSS1-201ENST00000323482 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
ACSS1-201ENST00000323482 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
ACSS1-201ENST00000323482 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
ACSS1-201ENST00000323482 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.26■□□□□ 0.99
ACSS1-201ENST00000323482 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
ACSS1-201ENST00000323482 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.25■□□□□ 0.99
ACSS1-201ENST00000323482 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.25■□□□□ 0.99
ACSS1-201ENST00000323482 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.25■□□□□ 0.99
ACSS1-201ENST00000323482 CUL7Q14999 1698 aa21.24■□□□□ 0.99
ACSS1-201ENST00000323482 NCOA1Q15788 1441 aa21.24■□□□□ 0.99
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ACSS1-201ENST00000323482 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.23■□□□□ 0.99
ACSS1-201ENST00000323482 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
ACSS1-201ENST00000323482 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.23■□□□□ 0.99
ACSS1-201ENST00000323482 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.23■□□□□ 0.99
ACSS1-201ENST00000323482 FAM161AQ3B820 660 aa21.23■□□□□ 0.99
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ACSS1-201ENST00000323482 BECN1Q14457 450 aa21.22■□□□□ 0.99
ACSS1-201ENST00000323482 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.22■□□□□ 0.99
ACSS1-201ENST00000323482 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.22■□□□□ 0.99
ACSS1-201ENST00000323482 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.21■□□□□ 0.99
ACSS1-201ENST00000323482 MS4A1P11836 297 aa21.2■□□□□ 0.98
ACSS1-201ENST00000323482 NLRP13Q86W25 1043 aa21.18■□□□□ 0.98
ACSS1-201ENST00000323482 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
ACSS1-201ENST00000323482 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.18■□□□□ 0.98
ACSS1-201ENST00000323482 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
ACSS1-201ENST00000323482 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.18■□□□□ 0.98
ACSS1-201ENST00000323482 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
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