RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323482.8

ACSS1-201, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSS1, Length 3,680 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-201ENST00000323482 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.68■■■□□ 2.5
ACSS1-201ENST00000323482 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
ACSS1-201ENST00000323482 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.86■■■□□ 2.05
ACSS1-201ENST00000323482 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.54■■■□□ 2
ACSS1-201ENST00000323482 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
ACSS1-201ENST00000323482 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.18■■□□□ 1.94
ACSS1-201ENST00000323482 HRCP23327 699 aa27.15■■□□□ 1.94
ACSS1-201ENST00000323482 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.85■■□□□ 1.89
ACSS1-201ENST00000323482 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.51■■□□□ 1.83
ACSS1-201ENST00000323482 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.37■■□□□ 1.81
ACSS1-201ENST00000323482 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
ACSS1-201ENST00000323482 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
ACSS1-201ENST00000323482 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
ACSS1-201ENST00000323482 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.02■■□□□ 1.76
ACSS1-201ENST00000323482 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
ACSS1-201ENST00000323482 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
ACSS1-201ENST00000323482 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
ACSS1-201ENST00000323482 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
ACSS1-201ENST00000323482 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
ACSS1-201ENST00000323482 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
ACSS1-201ENST00000323482 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
ACSS1-201ENST00000323482 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.51■■□□□ 1.67
ACSS1-201ENST00000323482 TRIM41Q8WV44 630 aa25.4■■□□□ 1.66
ACSS1-201ENST00000323482 NEUROD1Q13562 356 aa25.39■■□□□ 1.65
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.35■■□□□ 1.65
ACSS1-201ENST00000323482 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
ACSS1-201ENST00000323482 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
ACSS1-201ENST00000323482 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ACSS1-201ENST00000323482 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25■■□□□ 1.59
ACSS1-201ENST00000323482 MYT1Q01538 1121 aa24.9■■□□□ 1.58
ACSS1-201ENST00000323482 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ACSS1-201ENST00000323482 SCRIBQ14160 1630 aa24.67■■□□□ 1.54
ACSS1-201ENST00000323482 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
ACSS1-201ENST00000323482 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
ACSS1-201ENST00000323482 BCANQ96GW7 911 aa24.5■■□□□ 1.51
ACSS1-201ENST00000323482 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
ACSS1-201ENST00000323482 MIER1Q8N108 512 aa24.47■■□□□ 1.51
ACSS1-201ENST00000323482 ABCC9O60706 1549 aa24.44■■□□□ 1.5
ACSS1-201ENST00000323482 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.43■■□□□ 1.5
ACSS1-201ENST00000323482 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
ACSS1-201ENST00000323482 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.29■■□□□ 1.48
ACSS1-201ENST00000323482 APLP2Q06481 763 aa24.21■■□□□ 1.47
ACSS1-201ENST00000323482 ITGAEP38570 1179 aa24.12■■□□□ 1.45
ACSS1-201ENST00000323482 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.07■■□□□ 1.44
ACSS1-201ENST00000323482 WIZO95785 1651 aa23.93■■□□□ 1.42
ACSS1-201ENST00000323482 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.92■■□□□ 1.42
ACSS1-201ENST00000323482 BCL11AQ9H165 835 aa23.91■■□□□ 1.42
ACSS1-201ENST00000323482 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
ACSS1-201ENST00000323482 NEFLP07196 543 aa23.81■■□□□ 1.4
ACSS1-201ENST00000323482 FKBP8Q14318 412 aa23.81■■□□□ 1.4
ACSS1-201ENST00000323482 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.78■■□□□ 1.4
ACSS1-201ENST00000323482 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.78■■□□□ 1.4
ACSS1-201ENST00000323482 ABCC8Q09428 1581 aa23.77■■□□□ 1.4
ACSS1-201ENST00000323482 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
ACSS1-201ENST00000323482 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.73■■□□□ 1.39
ACSS1-201ENST00000323482 SOGA1O94964 1423 aa23.71■■□□□ 1.39
ACSS1-201ENST00000323482 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.7■■□□□ 1.38
ACSS1-201ENST00000323482 CEP162Q5TB80 1403 aa23.67■■□□□ 1.38
ACSS1-201ENST00000323482 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
ACSS1-201ENST00000323482 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
ACSS1-201ENST00000323482 NACADO15069 1562 aa23.65■■□□□ 1.38
ACSS1-201ENST00000323482 KCNH8Q96L42 1107 aa23.65■■□□□ 1.38
ACSS1-201ENST00000323482 TRIM52Q96A61 297 aa23.65■■□□□ 1.38
ACSS1-201ENST00000323482 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ACSS1-201ENST00000323482 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ACSS1-201ENST00000323482 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.57■■□□□ 1.36
ACSS1-201ENST00000323482 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ACSS1-201ENST00000323482 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ACSS1-201ENST00000323482 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.43■■□□□ 1.34
ACSS1-201ENST00000323482 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
ACSS1-201ENST00000323482 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
ACSS1-201ENST00000323482 NBR1Q14596 966 aa23.3■■□□□ 1.32
ACSS1-201ENST00000323482 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ACSS1-201ENST00000323482 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.28■■□□□ 1.32
ACSS1-201ENST00000323482 SMARCA2P51531 1590 aa23.26■■□□□ 1.31
ACSS1-201ENST00000323482 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ACSS1-201ENST00000323482 GOLGA3Q08378 1498 aa23.24■■□□□ 1.31
ACSS1-201ENST00000323482 SMARCA4P51532 1647 aa23.22■■□□□ 1.31
ACSS1-201ENST00000323482 CLIP1P30622 1438 aa23.2■■□□□ 1.31
ACSS1-201ENST00000323482 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ACSS1-201ENST00000323482 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
ACSS1-201ENST00000323482 ANP32CO43423 234 aa23.13■■□□□ 1.29
ACSS1-201ENST00000323482 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.13■■□□□ 1.29
ACSS1-201ENST00000323482 EEA1Q15075 1411 aa23.13■■□□□ 1.29
ACSS1-201ENST00000323482 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
ACSS1-201ENST00000323482 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.09■■□□□ 1.29
ACSS1-201ENST00000323482 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
ACSS1-201ENST00000323482 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.05■■□□□ 1.28
ACSS1-201ENST00000323482 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.02■■□□□ 1.28
ACSS1-201ENST00000323482 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.01■■□□□ 1.27
ACSS1-201ENST00000323482 P3H3Q8IVL6 736 aa22.98■■□□□ 1.27
ACSS1-201ENST00000323482 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ACSS1-201ENST00000323482 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.96■■□□□ 1.27
ACSS1-201ENST00000323482 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ACSS1-201ENST00000323482 SYNJ1O43426 1573 aa22.92■■□□□ 1.26
ACSS1-201ENST00000323482 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.92■■□□□ 1.26
ACSS1-201ENST00000323482 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
ACSS1-201ENST00000323482 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ACSS1-201ENST00000323482 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.89■■□□□ 1.25
ACSS1-201ENST00000323482 MSH5O43196 834 aa22.87■■□□□ 1.25
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