RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 WDR97A6NE52 1622 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.06■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.06■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 MSH5O43196 834 aa20.05■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 PLIN1O60240 522 aa20.04■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.04■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.03■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.03■□□□□ 0.8
KCNS1-201ENST00000306117 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
KCNS1-201ENST00000306117 SLC4A3P48751 1232 aa20.01■□□□□ 0.79
KCNS1-201ENST00000306117 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.01■□□□□ 0.79
KCNS1-201ENST00000306117 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20■□□□□ 0.79
KCNS1-201ENST00000306117 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
KCNS1-201ENST00000306117 ZBTB7CA1YPR0 619 aa19.99■□□□□ 0.79
KCNS1-201ENST00000306117 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.98■□□□□ 0.79
KCNS1-201ENST00000306117 PRXQ9BXM0 1461 aa19.98■□□□□ 0.79
KCNS1-201ENST00000306117 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
KCNS1-201ENST00000306117 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa19.97■□□□□ 0.79
KCNS1-201ENST00000306117 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
KCNS1-201ENST00000306117 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.95■□□□□ 0.78
KCNS1-201ENST00000306117 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.94■□□□□ 0.78
KCNS1-201ENST00000306117 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
KCNS1-201ENST00000306117 HSCBQ8IWL3 235 aa19.93■□□□□ 0.78
KCNS1-201ENST00000306117 NUP155O75694 1391 aa19.93■□□□□ 0.78
KCNS1-201ENST00000306117 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.92■□□□□ 0.78
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC7Q96M83 1385 aa19.91■□□□□ 0.78
KCNS1-201ENST00000306117 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.9■□□□□ 0.78
KCNS1-201ENST00000306117 PDE4AP27815 886 aa19.89■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 UACAQ9BZF9 1416 aa19.88■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.88■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.87■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa19.86■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 USP35Q9P2H5 1018 aa19.86■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 AKNAQ7Z591 1439 aa19.86■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.85■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 TMF1P82094 1093 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 GSE1Q14687 1217 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 USP47Q96K76 1375 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC146Q8IYE0 955 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.83■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 RRP1P56182 461 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
KCNS1-201ENST00000306117 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 RALBP1Q15311 655 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 CASC1Q6TDU7 716 aa19.82■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 NLRP13Q86W25 1043 aa19.82■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 CUX1P39880 1505 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 CRBNQ96SW2 442 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 TOP2BQ02880 1626 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 CFAP53Q96M91 514 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.78■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.78■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.77■□□□□ 0.76
KCNS1-201ENST00000306117 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 TIAM1Q13009 1591 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 CFTRP13569 1480 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 GBP4Q96PP9 640 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 PANK3Q9H999 370 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 NCOA2Q15596 1464 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 SKAP1Q86WV1 359 aa19.74■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 CDCA8Q53HL2 280 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 KIF15Q9NS87 1388 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 KIAA2012Q0VF49 1180 aa19.71■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 IL27Q8NEV9 243 aa19.71■□□□□ 0.75
KCNS1-201ENST00000306117 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.7■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.69■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 MAPKBP1O60336 1514 aa19.68■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA2Q08379 1002 aa19.67■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 DRC7Q8IY82 874 aa19.67■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.67■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa19.66■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 TAOK2Q9UL54 1235 aa19.66■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 MS4A1P11836 297 aa19.66■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.66■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 HFM1A2PYH4 1435 aa19.65■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 PDE3BQ13370 1112 aa19.64■□□□□ 0.74
KCNS1-201ENST00000306117 NRDCO43847 1150 aa19.64■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 NAIPQ13075 1403 aa19.63■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 NCAPD3P42695 1498 aa19.62■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.62■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms