RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.25■■□□□ 1.95
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KCNS1-201ENST00000306117 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.97■■□□□ 1.75
KCNS1-201ENST00000306117 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.01■■□□□ 1.59
KCNS1-201ENST00000306117 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.98■■□□□ 1.59
KCNS1-201ENST00000306117 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
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KCNS1-201ENST00000306117 HRCP23327 699 aa24.3■■□□□ 1.48
KCNS1-201ENST00000306117 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
KCNS1-201ENST00000306117 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
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KCNS1-201ENST00000306117 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.16■■□□□ 1.46
KCNS1-201ENST00000306117 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.15■■□□□ 1.46
KCNS1-201ENST00000306117 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM41Q8WV44 630 aa23.9■■□□□ 1.42
KCNS1-201ENST00000306117 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.85■■□□□ 1.41
KCNS1-201ENST00000306117 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
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KCNS1-201ENST00000306117 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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KCNS1-201ENST00000306117 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
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KCNS1-201ENST00000306117 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
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KCNS1-201ENST00000306117 SCRIBQ14160 1630 aa22.25■■□□□ 1.15
KCNS1-201ENST00000306117 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.14■■□□□ 1.14
KCNS1-201ENST00000306117 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.07■■□□□ 1.12
KCNS1-201ENST00000306117 MIER1Q8N108 512 aa22.07■■□□□ 1.12
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KCNS1-201ENST00000306117 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.7■■□□□ 1.06
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KCNS1-201ENST00000306117 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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KCNS1-201ENST00000306117 SOGA1O94964 1423 aa21.53■■□□□ 1.04
KCNS1-201ENST00000306117 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS1-201ENST00000306117 ARID3CA6NKF2 412 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS1-201ENST00000306117 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS1-201ENST00000306117 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS1-201ENST00000306117 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
KCNS1-201ENST00000306117 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.4■■□□□ 1.02
KCNS1-201ENST00000306117 ABCC8Q09428 1581 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
KCNS1-201ENST00000306117 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
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KCNS1-201ENST00000306117 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
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KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA3Q08378 1498 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNS1-201ENST00000306117 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.32■■□□□ 1
KCNS1-201ENST00000306117 BCL11AQ9H165 835 aa21.3■■□□□ 1
KCNS1-201ENST00000306117 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
KCNS1-201ENST00000306117 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
KCNS1-201ENST00000306117 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.25■□□□□ 0.99
KCNS1-201ENST00000306117 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNS1-201ENST00000306117 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.21■□□□□ 0.99
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KCNS1-201ENST00000306117 WIZO95785 1651 aa21.18■□□□□ 0.98
KCNS1-201ENST00000306117 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
KCNS1-201ENST00000306117 ARXQ96QS3 562 aa21.17■□□□□ 0.98
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNS1-201ENST00000306117 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNS1-201ENST00000306117 KCNH8Q96L42 1107 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNS1-201ENST00000306117 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
KCNS1-201ENST00000306117 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.12■□□□□ 0.97
KCNS1-201ENST00000306117 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
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