RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027351.12

Ccl20-201, Transcript of C-C motif chemokine 20, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl20, Length 1,417 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap16-3Q8C1I6 86 aa4.09□□□□□ -1.75
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm10308Q9CVR5 141 aa4.09□□□□□ -1.75
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ormdl1Q921I0 153 aa4.08□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap19-1Q925H2 87 aa4.08□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap19-3Q925H6 87 aa4.08□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm44790A0A0N4SV91 103 aa4.07□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gtf2h5Q8K2X8 71 aa4.07□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm45213A0A0U1RNZ6 101 aa4.06□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Igkv8-21A0A140T8P7 120 aa4.06□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm16253D3Z167 63 aa4.06□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pxt1Q8K459 51 aa4.06□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa4.05□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mrpl34Q99N91 92 aa4.05□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa4.04□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 UqcrqQ9CQ69 82 aa4.04□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Defa21Q8C1P2 93 aa4.04□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 C130032M10RikQ8C888 123 aa4.04□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Muc5bE9Q5I3 4800 aa4.03□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem213Q08EA8 116 aa4.03□□□□□ -1.76
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ubl5Q9EPV8 73 aa4.02□□□□□ -1.77
Ccl20-201ENSMUST00000027351 SspoQ8CG65 4998 aa4.02□□□□□ -1.77
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lyrm7Q9DA03 104 aa4.01□□□□□ -1.77
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Reg3aO09037 175 aa4□□□□□ -1.77
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rpl37Q9D823 97 aa4□□□□□ -1.77
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm37013Q8K491 104 aa3.99□□□□□ -1.77
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm26620Q9CY65 116 aa3.99□□□□□ -1.77
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fam240bJ3QMB3 78 aa3.97□□□□□ -1.77
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cypt15B1AXS0 87 aa3.96□□□□□ -1.77
Ccl20-201ENSMUST00000027351 BatfO35284 125 aa3.96□□□□□ -1.77
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Igkv3-3A0A140T8Q0 119 aa3.95□□□□□ -1.78
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa3.95□□□□□ -1.78
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Igkv8-19A0A0G2JFN8 121 aa3.94□□□□□ -1.78
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem254aP0DN89 123 aa3.94□□□□□ -1.78
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem254bP0DN90 123 aa3.94□□□□□ -1.78
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem254cP0DN91 123 aa3.94□□□□□ -1.78
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Prr15lQ8JZM2 100 aa3.94□□□□□ -1.78
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trav3-1Q5R1I8 114 aa3.92□□□□□ -1.78
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm11564A2A4L9 201 aa3.91□□□□□ -1.78
Ccl20-201ENSMUST00000027351 BikO70337 150 aa3.9□□□□□ -1.78
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Defb13Q8R2I4 64 aa3.9□□□□□ -1.78
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Samd13D3YUG0 102 aa3.88□□□□□ -1.79
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm10337F7DEP7 55 aa3.88□□□□□ -1.79
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm10267M0QWD8 85 aa3.88□□□□□ -1.79
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Spink8Q09TK9 105 aa3.87□□□□□ -1.79
Ccl20-201ENSMUST00000027351 A0A286YE49 62 aa3.86□□□□□ -1.79
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm10160F6Y577 67 aa3.86□□□□□ -1.79
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fam229bQ8CF36 80 aa3.84□□□□□ -1.79
Ccl20-201ENSMUST00000027351 7530416G11RikJ3QJX6 159 aa3.83□□□□□ -1.8
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Naa38Q9D2U5 125 aa3.83□□□□□ -1.8
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap9-1Q64526 186 aa3.82□□□□□ -1.8
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Atp5eP56382 52 aa3.78□□□□□ -1.8
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ndufc1Q9CQY9 76 aa3.78□□□□□ -1.8
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm28539A0A087WSL9 92 aa3.78□□□□□ -1.8
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm11568A2A4M2 211 aa3.78□□□□□ -1.8
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Anapc13Q8R034 74 aa3.77□□□□□ -1.81
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fsip2A2ARZ3 6995 aa3.76□□□□□ -1.81
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Smim20D3Z7Q2 69 aa3.75□□□□□ -1.81
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm17416Q30KP4 66 aa3.75□□□□□ -1.81
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Apoc4Q61268 124 aa3.75□□□□□ -1.81
Ccl20-201ENSMUST00000027351 H2al1bA0A087WP11 105 aa3.74□□□□□ -1.81
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa3.74□□□□□ -1.81
Ccl20-201ENSMUST00000027351 H2al1kJ3QP08 105 aa3.74□□□□□ -1.81
Ccl20-201ENSMUST00000027351 H2al1eQ810S6 105 aa3.74□□□□□ -1.81
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap13-1Q8K198 168 aa3.74□□□□□ -1.81
Ccl20-201ENSMUST00000027351 H2al1mQ9DAD9 105 aa3.74□□□□□ -1.81
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm4553A0A1B0GSA9 284 aa3.72□□□□□ -1.81
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm4491E0CX42 125 aa3.72□□□□□ -1.81
Ccl20-201ENSMUST00000027351 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa3.72□□□□□ -1.81
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Defb38Q7TNV7 63 aa3.71□□□□□ -1.82
Ccl20-201ENSMUST00000027351 H2al1aQ5M8Q2 105 aa3.7□□□□□ -1.82
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm10999F6Q4M4 69 aa3.7□□□□□ -1.82
Ccl20-201ENSMUST00000027351 B230307C23RikQ8BLB2 64 aa3.7□□□□□ -1.82
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm19935A0A1B0GSF9 52 aa3.69□□□□□ -1.82
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm20538F6Z9R1 75 aa3.69□□□□□ -1.82
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Atox1O08997 68 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Serp2Q6TAW2 65 aa3.69□□□□□ -1.82
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mt4P47945 62 aa3.68□□□□□ -1.82
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Q8BGJ3 129 aa3.68□□□□□ -1.82
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap19-2Q925I0 141 aa3.67□□□□□ -1.82
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Coa6Q8BGD8 79 aa3.64□□□□□ -1.83
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Spint4Q9D263 159 aa3.62□□□□□ -1.83
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm21798J3QNU5 87 aa3.61□□□□□ -1.83
Ccl20-201ENSMUST00000027351 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa3.6□□□□□ -1.83
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm7579A0A1B0GRJ4 243 aa3.58□□□□□ -1.84
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa3.58□□□□□ -1.84
Ccl20-201ENSMUST00000027351 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa3.58□□□□□ -1.84
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Defb1P56386 69 aa3.56□□□□□ -1.84
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rps28P62858 69 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Coa5Q99M07 74 aa3.55□□□□□ -1.84
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm6358A0A087WPH4 74 aa3.54□□□□□ -1.84
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pet100P0DJE0 76 aa3.53□□□□□ -1.84
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap5-1Q64507 230 aa3.53□□□□□ -1.84
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa3.53□□□□□ -1.84
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sprr2kO70562 68 aa3.53□□□□□ -1.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pla2g10Q9QXX3 151 aa3.51□□□□□ -1.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm10643Q3URG9 111 aa3.5□□□□□ -1.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem258P61166 79 aa3.49□□□□□ -1.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 SnurfQ9WU12 71 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 86.5 ms