Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20538F6Z9R1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20538F6Z9R1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20538F6Z9R1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20538F6Z9R1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20538F6Z9R1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20538F6Z9R1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20538F6Z9R1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20538F6Z9R1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20538F6Z9R1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20538F6Z9R1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20538F6Z9R1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20538F6Z9R1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20538F6Z9R1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20538F6Z9R1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20538F6Z9R1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20538F6Z9R1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20538F6Z9R1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20538F6Z9R1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20538F6Z9R1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20538F6Z9R1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20538F6Z9R1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm20538F6Z9R1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20538F6Z9R1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20538F6Z9R1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20538F6Z9R1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20538F6Z9R1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20538F6Z9R1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20538F6Z9R1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20538F6Z9R1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20538F6Z9R1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20538F6Z9R1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20538F6Z9R1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20538F6Z9R1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20538F6Z9R1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm20538F6Z9R1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm20538F6Z9R1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm20538F6Z9R1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20538F6Z9R1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20538F6Z9R1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20538F6Z9R1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20538F6Z9R1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20538F6Z9R1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20538F6Z9R1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20538F6Z9R1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20538F6Z9R1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20538F6Z9R1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20538F6Z9R1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20538F6Z9R1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20538F6Z9R1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20538F6Z9R1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm20538F6Z9R1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20538F6Z9R1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20538F6Z9R1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20538F6Z9R1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20538F6Z9R1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20538F6Z9R1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20538F6Z9R1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20538F6Z9R1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20538F6Z9R1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20538F6Z9R1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20538F6Z9R1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20538F6Z9R1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20538F6Z9R1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20538F6Z9R1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20538F6Z9R1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20538F6Z9R1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20538F6Z9R1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20538F6Z9R1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20538F6Z9R1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20538F6Z9R1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm20538F6Z9R1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20538F6Z9R1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20538F6Z9R1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20538F6Z9R1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20538F6Z9R1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20538F6Z9R1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20538F6Z9R1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20538F6Z9R1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20538F6Z9R1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20538F6Z9R1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20538F6Z9R1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20538F6Z9R1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20538F6Z9R1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20538F6Z9R1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20538F6Z9R1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20538F6Z9R1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20538F6Z9R1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20538F6Z9R1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20538F6Z9R1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20538F6Z9R1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20538F6Z9R1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20538F6Z9R1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20538F6Z9R1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20538F6Z9R1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20538F6Z9R1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20538F6Z9R1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms