Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1P2

Defa21, Alpha-defensin 21, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa21Q8C1P2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defa21Q8C1P2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Defa21Q8C1P2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Defa21Q8C1P2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Defa21Q8C1P2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Defa21Q8C1P2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Defa21Q8C1P2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Defa21Q8C1P2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Defa21Q8C1P2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Defa21Q8C1P2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Defa21Q8C1P2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Defa21Q8C1P2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa21Q8C1P2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa21Q8C1P2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa21Q8C1P2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa21Q8C1P2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa21Q8C1P2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa21Q8C1P2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa21Q8C1P2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa21Q8C1P2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa21Q8C1P2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa21Q8C1P2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa21Q8C1P2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa21Q8C1P2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa21Q8C1P2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa21Q8C1P2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa21Q8C1P2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa21Q8C1P2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa21Q8C1P2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa21Q8C1P2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa21Q8C1P2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa21Q8C1P2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa21Q8C1P2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa21Q8C1P2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa21Q8C1P2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa21Q8C1P2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa21Q8C1P2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa21Q8C1P2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa21Q8C1P2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa21Q8C1P2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa21Q8C1P2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa21Q8C1P2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa21Q8C1P2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa21Q8C1P2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa21Q8C1P2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa21Q8C1P2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa21Q8C1P2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa21Q8C1P2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa21Q8C1P2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa21Q8C1P2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa21Q8C1P2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa21Q8C1P2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa21Q8C1P2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa21Q8C1P2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa21Q8C1P2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa21Q8C1P2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa21Q8C1P2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa21Q8C1P2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa21Q8C1P2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa21Q8C1P2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa21Q8C1P2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa21Q8C1P2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa21Q8C1P2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa21Q8C1P2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa21Q8C1P2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa21Q8C1P2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa21Q8C1P2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa21Q8C1P2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa21Q8C1P2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa21Q8C1P2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa21Q8C1P2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa21Q8C1P2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa21Q8C1P2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa21Q8C1P2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa21Q8C1P2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa21Q8C1P2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa21Q8C1P2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa21Q8C1P2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa21Q8C1P2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa21Q8C1P2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa21Q8C1P2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa21Q8C1P2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa21Q8C1P2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa21Q8C1P2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa21Q8C1P2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa21Q8C1P2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa21Q8C1P2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa21Q8C1P2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa21Q8C1P2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa21Q8C1P2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa21Q8C1P2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa21Q8C1P2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa21Q8C1P2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa21Q8C1P2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa21Q8C1P2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa21Q8C1P2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa21Q8C1P2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa21Q8C1P2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa21Q8C1P2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa21Q8C1P2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1127.6 ms