Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krtap9-3Q3V2C1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap9-3Q3V2C1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krtap9-3Q3V2C1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Krtap9-3Q3V2C1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Krtap9-3Q3V2C1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krtap9-3Q3V2C1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krtap9-3Q3V2C1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krtap9-3Q3V2C1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krtap9-3Q3V2C1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap9-3Q3V2C1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krtap9-3Q3V2C1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krtap9-3Q3V2C1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krtap9-3Q3V2C1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krtap9-3Q3V2C1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krtap9-3Q3V2C1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krtap9-3Q3V2C1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Krtap9-3Q3V2C1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krtap9-3Q3V2C1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krtap9-3Q3V2C1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Krtap9-3Q3V2C1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krtap9-3Q3V2C1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krtap9-3Q3V2C1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap9-3Q3V2C1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap9-3Q3V2C1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Krtap9-3Q3V2C1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap9-3Q3V2C1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Krtap9-3Q3V2C1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krtap9-3Q3V2C1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Krtap9-3Q3V2C1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Krtap9-3Q3V2C1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Krtap9-3Q3V2C1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Krtap9-3Q3V2C1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krtap9-3Q3V2C1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krtap9-3Q3V2C1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Krtap9-3Q3V2C1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krtap9-3Q3V2C1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krtap9-3Q3V2C1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Krtap9-3Q3V2C1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Krtap9-3Q3V2C1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Krtap9-3Q3V2C1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Krtap9-3Q3V2C1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Krtap9-3Q3V2C1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krtap9-3Q3V2C1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Krtap9-3Q3V2C1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Krtap9-3Q3V2C1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Krtap9-3Q3V2C1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Krtap9-3Q3V2C1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Krtap9-3Q3V2C1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Krtap9-3Q3V2C1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Krtap9-3Q3V2C1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Krtap9-3Q3V2C1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Krtap9-3Q3V2C1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Krtap9-3Q3V2C1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Krtap9-3Q3V2C1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Krtap9-3Q3V2C1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krtap9-3Q3V2C1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krtap9-3Q3V2C1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap9-3Q3V2C1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Krtap9-3Q3V2C1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap9-3Q3V2C1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap9-3Q3V2C1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Krtap9-3Q3V2C1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap9-3Q3V2C1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap9-3Q3V2C1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap9-3Q3V2C1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap9-3Q3V2C1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap9-3Q3V2C1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap9-3Q3V2C1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap9-3Q3V2C1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap9-3Q3V2C1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap9-3Q3V2C1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap9-3Q3V2C1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Krtap9-3Q3V2C1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Krtap9-3Q3V2C1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Krtap9-3Q3V2C1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Krtap9-3Q3V2C1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Krtap9-3Q3V2C1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Krtap9-3Q3V2C1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Krtap9-3Q3V2C1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Krtap9-3Q3V2C1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Krtap9-3Q3V2C1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Krtap9-3Q3V2C1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Krtap9-3Q3V2C1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Krtap9-3Q3V2C1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Krtap9-3Q3V2C1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Krtap9-3Q3V2C1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krtap9-3Q3V2C1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krtap9-3Q3V2C1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap9-3Q3V2C1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap9-3Q3V2C1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap9-3Q3V2C1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap9-3Q3V2C1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap9-3Q3V2C1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap9-3Q3V2C1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap9-3Q3V2C1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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