RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000054930.6

Ptx4-201, Transcript of Pentraxin-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptx4, Length 1,582 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 119 aa8.57□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 S100a8P27005 89 aa8.57□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dnah8Q91XQ0 4731 aa8.57□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Defa13P50711 93 aa8.56□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Smr3aQ61900 147 aa8.56□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 P01819 144 aa8.56□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 CckP09240 115 aa8.56□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Vps13bQ80TY5 3993 aa8.55□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam104aA2A6P4 185 aa8.55□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 BtcQ05928 177 aa8.55□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 G0s2Q61585 103 aa8.55□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10770F7D043 238 aa8.54□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 SelenowP63300 88 aa8.54□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 5930422O12RikQ8C4Y4 123 aa8.54□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rab37Q9JKM7 223 aa8.54□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fat2Q5F226 4351 aa8.54□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 2310034G01RikA0A286YDL3 209 aa8.53□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pcp4l1Q6W8Q3 68 aa8.53□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dmac1Q9CQ00 111 aa8.53□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tax1bp3Q9DBG9 124 aa8.53□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 6030445D17RikE9Q8F9 148 aa8.52□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Defa7P50705 93 aa8.52□□□□□ -1.04
Ptx4-201ENSMUST00000054930 NbdyA0A0N4SUI7 68 aa8.52□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Klk12B2RVZ0 247 aa8.52□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10570F6VB42 170 aa8.52□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 A330070K13RikQ8CA53 115 aa8.52□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Scgb1b3J3QJY4 93 aa8.51□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Krtap14O08640 167 aa8.51□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cd164Q9R0L9 197 aa8.51□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10320E9PW43 113 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm9805F6YK59 57 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tnp2P11378 117 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rpl28P41105 137 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 ScxQ64124 207 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm5142Q8C5X9 133 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lgals4Q8K419 326 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cdk2ap2Q9CPY4 127 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mrpl52Q9D0Y8 121 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cox7cP17665 63 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Defa4P28311 92 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tac4Q99N14 128 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Q9DAA7 145 aa8.48□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trav13n-2A0A0G2JF93 110 aa8.48□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm11027G8JL69 66 aa8.48□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Q9DAA3 117 aa8.48□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 HrnrQ8VHD8 2496 aa8.46□□□□□ -1.05
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Adm2Q7TNK8 150 aa8.46□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Defb47Q30KN1 79 aa8.45□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Spink13Q3UTS8 97 aa8.45□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm11011D3Z3L9 86 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rpl32-psP17932 135 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm7276Q3TYW4 209 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Defb29Q8BGW9 78 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 CenpwQ3URR0 86 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 BC048502Q80Y74 154 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 5730596B20RikQ8BQ08 205 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Phpt1Q9DAK9 124 aa8.44□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ube2bP63147 152 aa8.43□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Spata45Q9CVW4 97 aa8.43□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm17521F6QAC8 156 aa8.42□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Igkv4-58A0A0G2JGI6 119 aa8.41□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 A0A286YCQ8 80 aa8.41□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ccl25O35903 144 aa8.41□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Elof1P60003 83 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 MturnQ8CGA4 131 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fat3Q8BNA6 4555 aa8.4□□□□□ -1.06
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Wfdc10Q3V2J9 124 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Smim26Q3V460 107 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Msrb1Q9JLC3 116 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Birc6O88738 4882 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10642Q3TWM1 71 aa8.39□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 E130218I03RikA0A0U1RNU5 63 aa8.38□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Herc2Q4U2R1 4836 aa8.36□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10135F6TEE5 83 aa8.36□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 TeppQ6IMH0 216 aa8.36□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dnal4Q9DCM4 105 aa8.36□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm29423A0A087WRM1 55 aa8.35□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ighv10-1A0A0B4J1J6 119 aa8.35□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trav3-4A0A075B654 114 aa8.35□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 A930002H24RikQ8C8Y3 163 aa8.35□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Igkv1-35A0A0G2JDE5 120 aa8.34□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Krtap19-5O08632 62 aa8.34□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10139O88245 57 aa8.34□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Defb37Q7TMD2 62 aa8.34□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rpl39lQ9CQD0 51 aa8.34□□□□□ -1.07
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm16381A0A1Y7VKT9 73 aa8.33□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 D130052B06RikQ3UW13 202 aa8.33□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 AI606181Q8C7B9 129 aa8.33□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm27235Q3UW50 83 aa8.32□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Abca13Q5SSE9 5034 aa8.32□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa8.32□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Igkv3-7A0A0G2JE31 119 aa8.31□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Vpreb2P13373 142 aa8.31□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 LbhQ9CX60 105 aa8.31□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa8.3□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm26602M0QWA4 95 aa8.3□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam19a3Q7TPG6 132 aa8.3□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 4930524J08RikQ9CUJ5 163 aa8.3□□□□□ -1.08
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Igkv1-110A0A0B4J1I0 119 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57.4 ms