Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKM7

Rab37, Ras-related protein Rab-37, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab37Q9JKM7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab37Q9JKM7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab37Q9JKM7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab37Q9JKM7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab37Q9JKM7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab37Q9JKM7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab37Q9JKM7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab37Q9JKM7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab37Q9JKM7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab37Q9JKM7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab37Q9JKM7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab37Q9JKM7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab37Q9JKM7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab37Q9JKM7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab37Q9JKM7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rab37Q9JKM7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab37Q9JKM7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab37Q9JKM7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab37Q9JKM7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab37Q9JKM7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab37Q9JKM7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab37Q9JKM7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab37Q9JKM7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab37Q9JKM7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab37Q9JKM7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab37Q9JKM7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab37Q9JKM7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab37Q9JKM7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab37Q9JKM7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab37Q9JKM7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab37Q9JKM7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab37Q9JKM7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab37Q9JKM7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab37Q9JKM7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab37Q9JKM7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab37Q9JKM7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab37Q9JKM7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab37Q9JKM7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab37Q9JKM7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab37Q9JKM7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab37Q9JKM7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab37Q9JKM7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab37Q9JKM7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab37Q9JKM7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab37Q9JKM7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab37Q9JKM7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab37Q9JKM7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab37Q9JKM7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab37Q9JKM7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab37Q9JKM7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rab37Q9JKM7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rab37Q9JKM7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rab37Q9JKM7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab37Q9JKM7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab37Q9JKM7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab37Q9JKM7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab37Q9JKM7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab37Q9JKM7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab37Q9JKM7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab37Q9JKM7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab37Q9JKM7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab37Q9JKM7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab37Q9JKM7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab37Q9JKM7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab37Q9JKM7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab37Q9JKM7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab37Q9JKM7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab37Q9JKM7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab37Q9JKM7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab37Q9JKM7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab37Q9JKM7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab37Q9JKM7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab37Q9JKM7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab37Q9JKM7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab37Q9JKM7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab37Q9JKM7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab37Q9JKM7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab37Q9JKM7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab37Q9JKM7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab37Q9JKM7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab37Q9JKM7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab37Q9JKM7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab37Q9JKM7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab37Q9JKM7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rab37Q9JKM7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab37Q9JKM7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab37Q9JKM7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab37Q9JKM7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab37Q9JKM7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab37Q9JKM7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab37Q9JKM7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab37Q9JKM7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab37Q9JKM7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab37Q9JKM7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab37Q9JKM7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab37Q9JKM7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab37Q9JKM7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab37Q9JKM7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab37Q9JKM7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab37Q9JKM7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms