Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcp4l1Q6W8Q3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcp4l1Q6W8Q3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcp4l1Q6W8Q3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcp4l1Q6W8Q3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcp4l1Q6W8Q3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcp4l1Q6W8Q3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcp4l1Q6W8Q3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcp4l1Q6W8Q3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcp4l1Q6W8Q3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcp4l1Q6W8Q3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcp4l1Q6W8Q3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcp4l1Q6W8Q3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcp4l1Q6W8Q3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcp4l1Q6W8Q3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcp4l1Q6W8Q3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcp4l1Q6W8Q3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcp4l1Q6W8Q3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcp4l1Q6W8Q3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcp4l1Q6W8Q3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcp4l1Q6W8Q3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcp4l1Q6W8Q3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcp4l1Q6W8Q3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcp4l1Q6W8Q3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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