Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl28P41105 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl28P41105 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl28P41105 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl28P41105 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl28P41105 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl28P41105 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl28P41105 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl28P41105 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl28P41105 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl28P41105 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpl28P41105 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpl28P41105 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl28P41105 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl28P41105 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl28P41105 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl28P41105 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl28P41105 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl28P41105 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl28P41105 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl28P41105 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl28P41105 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl28P41105 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpl28P41105 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpl28P41105 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpl28P41105 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpl28P41105 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpl28P41105 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpl28P41105 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl28P41105 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl28P41105 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl28P41105 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rpl28P41105 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl28P41105 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl28P41105 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpl28P41105 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpl28P41105 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpl28P41105 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl28P41105 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl28P41105 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl28P41105 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl28P41105 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl28P41105 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl28P41105 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl28P41105 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl28P41105 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl28P41105 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl28P41105 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl28P41105 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl28P41105 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl28P41105 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpl28P41105 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl28P41105 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpl28P41105 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpl28P41105 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl28P41105 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpl28P41105 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl28P41105 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl28P41105 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl28P41105 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl28P41105 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl28P41105 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl28P41105 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpl28P41105 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl28P41105 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl28P41105 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl28P41105 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl28P41105 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl28P41105 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl28P41105 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rpl28P41105 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl28P41105 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl28P41105 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl28P41105 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl28P41105 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl28P41105 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpl28P41105 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpl28P41105 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpl28P41105 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl28P41105 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl28P41105 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl28P41105 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl28P41105 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl28P41105 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl28P41105 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl28P41105 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl28P41105 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl28P41105 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl28P41105 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl28P41105 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl28P41105 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl28P41105 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl28P41105 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl28P41105 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl28P41105 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl28P41105 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl28P41105 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl28P41105 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl28P41105 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl28P41105 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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