Protein–RNA interactions for Protein: Q99N14

Tac4, Tachykinin-4, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac4Q99N14 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tac4Q99N14 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tac4Q99N14 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tac4Q99N14 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tac4Q99N14 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tac4Q99N14 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tac4Q99N14 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tac4Q99N14 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tac4Q99N14 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tac4Q99N14 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tac4Q99N14 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tac4Q99N14 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tac4Q99N14 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tac4Q99N14 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tac4Q99N14 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tac4Q99N14 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tac4Q99N14 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tac4Q99N14 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tac4Q99N14 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tac4Q99N14 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tac4Q99N14 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tac4Q99N14 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tac4Q99N14 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tac4Q99N14 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tac4Q99N14 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tac4Q99N14 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tac4Q99N14 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tac4Q99N14 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tac4Q99N14 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tac4Q99N14 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tac4Q99N14 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac4Q99N14 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tac4Q99N14 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tac4Q99N14 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tac4Q99N14 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tac4Q99N14 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tac4Q99N14 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tac4Q99N14 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tac4Q99N14 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tac4Q99N14 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tac4Q99N14 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tac4Q99N14 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tac4Q99N14 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tac4Q99N14 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tac4Q99N14 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tac4Q99N14 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tac4Q99N14 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tac4Q99N14 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tac4Q99N14 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tac4Q99N14 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tac4Q99N14 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tac4Q99N14 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tac4Q99N14 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tac4Q99N14 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tac4Q99N14 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tac4Q99N14 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tac4Q99N14 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tac4Q99N14 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tac4Q99N14 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tac4Q99N14 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tac4Q99N14 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tac4Q99N14 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tac4Q99N14 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tac4Q99N14 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tac4Q99N14 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tac4Q99N14 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tac4Q99N14 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tac4Q99N14 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tac4Q99N14 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tac4Q99N14 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tac4Q99N14 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tac4Q99N14 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tac4Q99N14 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tac4Q99N14 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tac4Q99N14 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tac4Q99N14 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tac4Q99N14 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tac4Q99N14 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tac4Q99N14 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tac4Q99N14 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tac4Q99N14 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tac4Q99N14 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tac4Q99N14 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tac4Q99N14 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tac4Q99N14 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tac4Q99N14 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tac4Q99N14 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tac4Q99N14 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac4Q99N14 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tac4Q99N14 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tac4Q99N14 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tac4Q99N14 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tac4Q99N14 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tac4Q99N14 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tac4Q99N14 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tac4Q99N14 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tac4Q99N14 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tac4Q99N14 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac4Q99N14 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tac4Q99N14 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms