Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
5730596B20RikQ8BQ08 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
5730596B20RikQ8BQ08 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
5730596B20RikQ8BQ08 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
5730596B20RikQ8BQ08 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5730596B20RikQ8BQ08 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
5730596B20RikQ8BQ08 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5730596B20RikQ8BQ08 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5730596B20RikQ8BQ08 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5730596B20RikQ8BQ08 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
5730596B20RikQ8BQ08 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5730596B20RikQ8BQ08 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
5730596B20RikQ8BQ08 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
5730596B20RikQ8BQ08 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
5730596B20RikQ8BQ08 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
5730596B20RikQ8BQ08 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
5730596B20RikQ8BQ08 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
5730596B20RikQ8BQ08 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5730596B20RikQ8BQ08 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
5730596B20RikQ8BQ08 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
5730596B20RikQ8BQ08 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
5730596B20RikQ8BQ08 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
5730596B20RikQ8BQ08 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5730596B20RikQ8BQ08 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5730596B20RikQ8BQ08 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730596B20RikQ8BQ08 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730596B20RikQ8BQ08 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
5730596B20RikQ8BQ08 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730596B20RikQ8BQ08 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
5730596B20RikQ8BQ08 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
5730596B20RikQ8BQ08 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5730596B20RikQ8BQ08 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5730596B20RikQ8BQ08 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
5730596B20RikQ8BQ08 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
5730596B20RikQ8BQ08 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
5730596B20RikQ8BQ08 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
5730596B20RikQ8BQ08 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
5730596B20RikQ8BQ08 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
5730596B20RikQ8BQ08 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
5730596B20RikQ8BQ08 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5730596B20RikQ8BQ08 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
5730596B20RikQ8BQ08 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
5730596B20RikQ8BQ08 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
5730596B20RikQ8BQ08 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
5730596B20RikQ8BQ08 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
5730596B20RikQ8BQ08 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5730596B20RikQ8BQ08 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
5730596B20RikQ8BQ08 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
5730596B20RikQ8BQ08 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5730596B20RikQ8BQ08 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5730596B20RikQ8BQ08 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
5730596B20RikQ8BQ08 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5730596B20RikQ8BQ08 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5730596B20RikQ8BQ08 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
5730596B20RikQ8BQ08 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
5730596B20RikQ8BQ08 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
5730596B20RikQ8BQ08 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
5730596B20RikQ8BQ08 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5730596B20RikQ8BQ08 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
5730596B20RikQ8BQ08 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5730596B20RikQ8BQ08 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
5730596B20RikQ8BQ08 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5730596B20RikQ8BQ08 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5730596B20RikQ8BQ08 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5730596B20RikQ8BQ08 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms