RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ss18Q62280 418 aa9.39□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmb11Q8BG41 302 aa9.39□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AY761184Q9D848 116 aa9.39□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv4-74A0A0B4J1I3 119 aa9.39□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bri3P28662 125 aa9.39□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NrepQ07475 68 aa9.39□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv2-7A0A075B5Q8 116 aa9.38□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa9.38□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccl19O70460 108 aa9.38□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01739 132 aa9.38□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb45Q3V490 66 aa9.38□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dynlrb2Q9DAJ5 96 aa9.38□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf580Q9DB38 172 aa9.38□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav9-2A0A075B647 113 aa9.38□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav9-4A0A0B4J1K2 113 aa9.38□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm28044L7N1X0 119 aa9.38□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnase1P00683 149 aa9.38□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr82Q8BZR0 328 aa9.38□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srsf9Q9D0B0 222 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm45785A0A1B0GT05 94 aa9.37□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01750 117 aa9.37□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm94Q3V2D2 93 aa9.37□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ucn2Q99ML8 113 aa9.37□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8439G3UWA7 96 aa9.37□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Egr2P08152 470 aa9.37□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MdfiP70331 251 aa9.37□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxi1Q922I5 372 aa9.37□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-12A0A0A6YXJ9 117 aa9.36□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SbsponQ3UPR9 264 aa9.36□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv14-1A0A075B5R4 117 aa9.36□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A930009A15RikG3UYI6 118 aa9.36□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxi2Q3I5G5 311 aa9.36□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klk7Q91VE3 249 aa9.36□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stab1Q8R4Y4 2571 aa9.36□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2310009B15RikA0A0A6YWI4 143 aa9.35□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01896 185 aa9.35□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm1553Q66VB7 94 aa9.35□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Notch3Q61982 2318 aa9.35□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cox8cA6H666 72 aa9.35□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HampQ9EQ21 83 aa9.35□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-64A0A075B5X3 117 aa9.34□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm29666A0A087WQ99 126 aa9.34□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv8-12A0A0G2JDE1 119 aa9.34□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm9767G3X930 207 aa9.34□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LhbO09108 141 aa9.34□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P06328 117 aa9.34□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spata45Q9CVW4 97 aa9.34□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tspan13Q9D8C2 204 aa9.34□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Triap1Q9D8Z2 76 aa9.34□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd99Q8VCN6 175 aa9.34□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PmvkQ9D1G2 192 aa9.34□□□□□ -0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm26661M0QWV4 156 aa9.33□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D8Q6 235 aa9.33□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav3-1Q5R1I8 114 aa9.33□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10295Q8CCF3 114 aa9.33□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cryba4Q9JJV0 196 aa9.33□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab37Q9JKM7 223 aa9.33□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Notch2O35516 2470 aa9.33□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm2564F6Z9S8 108 aa9.33□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C1qcQ02105 246 aa9.33□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Runx1Q03347 451 aa9.33□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spag11Q8K4N2 71 aa9.33□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9DAB9 146 aa9.33□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-50A0A075B5W1 117 aa9.32□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv4-69A0A0B4J1I6 116 aa9.32□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf183Q8QZS5 190 aa9.32□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PolqQ8CGS6 2544 aa9.31□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv2-3A0A075B696 115 aa9.31□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nat8b-psE0CYC6 232 aa9.31□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1810032O08RikE9PZV8 113 aa9.31□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lgals6O54891 301 aa9.31□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fhl2O70433 279 aa9.31□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2d1P61080 147 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col6a5A6H584 2640 aa9.31□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7849D3YX03 116 aa9.31□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Reg3gO09049 174 aa9.31□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mllt11P97783 90 aa9.31□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q5BN45 167 aa9.31□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cysltr1Q99JA4 352 aa9.31□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv3-3A0A0A6YWL2 116 aa9.3□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-75A0A075B5Y2 117 aa9.3□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snrpd3P62320 126 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BC048562Q80ZQ7 204 aa9.3□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gemin7Q9CWY4 129 aa9.3□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zc2hc1bQ9D534 172 aa9.3□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm45717A0A1B0GT68 152 aa9.29□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr2kQ63871 58 aa9.29□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ovol2Q8CIV7 274 aa9.29□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crlf1Q9JM58 425 aa9.29□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcrg-C1A0A075B5Z0 172 aa9.29□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C920008G01RikA0A0B4J1N1 112 aa9.29□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm35549A0A0N4SUS7 141 aa9.29□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CckP09240 115 aa9.29□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdip1Q9DB75 208 aa9.29□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 F11rO88792 300 aa9.28□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01811 117 aa9.28□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gphb5Q812B2 130 aa9.28□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl36-ps4A0A140T8U4 117 aa9.28□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cks1bP61025 79 aa9.28□□□□□ -0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec5aQ9R007 190 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 89.7 ms