Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W1

Ighv1-50, Immunoglobulin heavy variable 1-50 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ighv1-50A0A075B5W1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ighv1-50A0A075B5W1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ighv1-50A0A075B5W1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighv1-50A0A075B5W1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ighv1-50A0A075B5W1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ighv1-50A0A075B5W1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ighv1-50A0A075B5W1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ighv1-50A0A075B5W1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighv1-50A0A075B5W1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ighv1-50A0A075B5W1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ighv1-50A0A075B5W1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ighv1-50A0A075B5W1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ighv1-50A0A075B5W1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ighv1-50A0A075B5W1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighv1-50A0A075B5W1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ighv1-50A0A075B5W1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighv1-50A0A075B5W1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighv1-50A0A075B5W1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighv1-50A0A075B5W1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-50A0A075B5W1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighv1-50A0A075B5W1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighv1-50A0A075B5W1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighv1-50A0A075B5W1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighv1-50A0A075B5W1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighv1-50A0A075B5W1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighv1-50A0A075B5W1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv1-50A0A075B5W1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighv1-50A0A075B5W1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighv1-50A0A075B5W1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighv1-50A0A075B5W1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighv1-50A0A075B5W1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ighv1-50A0A075B5W1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ighv1-50A0A075B5W1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ighv1-50A0A075B5W1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ighv1-50A0A075B5W1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv1-50A0A075B5W1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighv1-50A0A075B5W1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighv1-50A0A075B5W1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv1-50A0A075B5W1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ighv1-50A0A075B5W1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ighv1-50A0A075B5W1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ighv1-50A0A075B5W1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ighv1-50A0A075B5W1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv1-50A0A075B5W1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv1-50A0A075B5W1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighv1-50A0A075B5W1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ighv1-50A0A075B5W1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv1-50A0A075B5W1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighv1-50A0A075B5W1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ighv1-50A0A075B5W1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ighv1-50A0A075B5W1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ighv1-50A0A075B5W1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ighv1-50A0A075B5W1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ighv1-50A0A075B5W1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ighv1-50A0A075B5W1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ighv1-50A0A075B5W1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ighv1-50A0A075B5W1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ighv1-50A0A075B5W1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ighv1-50A0A075B5W1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ighv1-50A0A075B5W1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ighv1-50A0A075B5W1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ighv1-50A0A075B5W1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ighv1-50A0A075B5W1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ighv1-50A0A075B5W1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ighv1-50A0A075B5W1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ighv1-50A0A075B5W1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ighv1-50A0A075B5W1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ighv1-50A0A075B5W1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ighv1-50A0A075B5W1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ighv1-50A0A075B5W1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ighv1-50A0A075B5W1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ighv1-50A0A075B5W1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ighv1-50A0A075B5W1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ighv1-50A0A075B5W1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ighv1-50A0A075B5W1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ighv1-50A0A075B5W1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ighv1-50A0A075B5W1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ighv1-50A0A075B5W1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ighv1-50A0A075B5W1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ighv1-50A0A075B5W1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ighv1-50A0A075B5W1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ighv1-50A0A075B5W1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ighv1-50A0A075B5W1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ighv1-50A0A075B5W1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ighv1-50A0A075B5W1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ighv1-50A0A075B5W1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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