Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ss18Q62280 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ss18Q62280 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ss18Q62280 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ss18Q62280 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ss18Q62280 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ss18Q62280 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ss18Q62280 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ss18Q62280 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ss18Q62280 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ss18Q62280 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ss18Q62280 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ss18Q62280 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ss18Q62280 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ss18Q62280 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ss18Q62280 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ss18Q62280 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ss18Q62280 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ss18Q62280 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ss18Q62280 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ss18Q62280 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ss18Q62280 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ss18Q62280 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ss18Q62280 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ss18Q62280 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ss18Q62280 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ss18Q62280 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ss18Q62280 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ss18Q62280 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ss18Q62280 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ss18Q62280 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ss18Q62280 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ss18Q62280 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ss18Q62280 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ss18Q62280 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ss18Q62280 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ss18Q62280 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ss18Q62280 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ss18Q62280 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ss18Q62280 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ss18Q62280 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ss18Q62280 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ss18Q62280 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ss18Q62280 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ss18Q62280 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ss18Q62280 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ss18Q62280 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ss18Q62280 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ss18Q62280 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ss18Q62280 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ss18Q62280 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ss18Q62280 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ss18Q62280 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ss18Q62280 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ss18Q62280 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ss18Q62280 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ss18Q62280 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ss18Q62280 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ss18Q62280 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ss18Q62280 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ss18Q62280 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ss18Q62280 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ss18Q62280 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ss18Q62280 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ss18Q62280 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ss18Q62280 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ss18Q62280 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ss18Q62280 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ss18Q62280 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ss18Q62280 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ss18Q62280 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ss18Q62280 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ss18Q62280 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ss18Q62280 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ss18Q62280 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ss18Q62280 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ss18Q62280 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ss18Q62280 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ss18Q62280 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ss18Q62280 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ss18Q62280 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ss18Q62280 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ss18Q62280 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ss18Q62280 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ss18Q62280 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ss18Q62280 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ss18Q62280 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ss18Q62280 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ss18Q62280 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ss18Q62280 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ss18Q62280 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ss18Q62280 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ss18Q62280 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ss18Q62280 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ss18Q62280 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ss18Q62280 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ss18Q62280 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ss18Q62280 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ss18Q62280 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ss18Q62280 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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