Protein–RNA interactions for Protein: O09049

Reg3g, Regenerating islet-derived protein 3-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg3gO09049 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Reg3gO09049 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Reg3gO09049 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Reg3gO09049 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Reg3gO09049 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Reg3gO09049 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Reg3gO09049 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Reg3gO09049 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Reg3gO09049 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Reg3gO09049 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Reg3gO09049 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Reg3gO09049 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Reg3gO09049 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Reg3gO09049 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Reg3gO09049 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Reg3gO09049 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Reg3gO09049 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Reg3gO09049 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Reg3gO09049 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Reg3gO09049 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Reg3gO09049 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Reg3gO09049 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Reg3gO09049 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Reg3gO09049 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Reg3gO09049 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Reg3gO09049 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Reg3gO09049 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Reg3gO09049 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Reg3gO09049 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Reg3gO09049 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Reg3gO09049 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Reg3gO09049 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reg3gO09049 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Reg3gO09049 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Reg3gO09049 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Reg3gO09049 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Reg3gO09049 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Reg3gO09049 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Reg3gO09049 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Reg3gO09049 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Reg3gO09049 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Reg3gO09049 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reg3gO09049 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Reg3gO09049 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Reg3gO09049 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Reg3gO09049 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Reg3gO09049 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Reg3gO09049 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Reg3gO09049 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Reg3gO09049 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Reg3gO09049 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Reg3gO09049 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Reg3gO09049 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Reg3gO09049 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Reg3gO09049 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Reg3gO09049 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Reg3gO09049 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Reg3gO09049 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Reg3gO09049 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Reg3gO09049 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Reg3gO09049 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Reg3gO09049 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Reg3gO09049 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Reg3gO09049 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Reg3gO09049 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Reg3gO09049 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Reg3gO09049 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Reg3gO09049 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Reg3gO09049 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Reg3gO09049 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Reg3gO09049 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Reg3gO09049 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Reg3gO09049 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Reg3gO09049 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Reg3gO09049 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Reg3gO09049 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Reg3gO09049 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Reg3gO09049 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Reg3gO09049 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Reg3gO09049 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Reg3gO09049 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Reg3gO09049 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Reg3gO09049 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Reg3gO09049 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Reg3gO09049 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Reg3gO09049 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Reg3gO09049 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Reg3gO09049 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Reg3gO09049 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Reg3gO09049 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Reg3gO09049 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Reg3gO09049 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Reg3gO09049 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Reg3gO09049 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Reg3gO09049 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Reg3gO09049 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Reg3gO09049 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Reg3gO09049 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reg3gO09049 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Reg3gO09049 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms