RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NischQ80TM9 1593 aa25.49■■□□□ 1.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa25.13■■□□□ 1.61
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcc9P70170 1546 aa24.64■■□□□ 1.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcc8B2RUS7 1588 aa24.31■■□□□ 1.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox8Q6VSS7 320 aa23.37■■□□□ 1.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ScribQ80U72 1612 aa23■■□□□ 1.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kdm5dQ62240 1548 aa22.45■■□□□ 1.18
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcaf1Q80TR8 1506 aa22.37■■□□□ 1.17
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa22.31■■□□□ 1.16
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NacadQ5SWP3 1504 aa22.27■■□□□ 1.16
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rtl1Q7M732 1744 aa22.05■■□□□ 1.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Baz1aO88379 1555 aa21.96■■□□□ 1.11
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sycp2Q9CUU3 1500 aa21.81■■□□□ 1.08
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa21.79■■□□□ 1.08
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc180J3QNE4 1664 aa21.76■■□□□ 1.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crybg2B7ZCC2 1516 aa21.5■■□□□ 1.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BicraF8VPZ9 1578 aa21.46■■□□□ 1.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smarca2Q6DIC0 1577 aa21.4■■□□□ 1.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa21.21■□□□□ 0.99
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim41Q5NCC3 630 aa21.11■□□□□ 0.97
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Synj1Q8CHC4 1574 aa20.86■□□□□ 0.93
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cngb1E1AZ71 1325 aa20.85■□□□□ 0.93
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa20.82■□□□□ 0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CftrP26361 1476 aa20.74■□□□□ 0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HrcG5E8J6 738 aa20.71■□□□□ 0.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa20.61■□□□□ 0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa20.59■□□□□ 0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Golga3P55937 1487 aa20.52■□□□□ 0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chic1Q8CBW7 227 aa20.52■□□□□ 0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa20.4■□□□□ 0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gab3Q8BSM5 595 aa20.38■□□□□ 0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cep164Q5DU05 1446 aa20.32■□□□□ 0.84
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Top2bQ64511 1612 aa20.32■□□□□ 0.84
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa20.3■□□□□ 0.84
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Frmpd1A2AKB4 1549 aa20.27■□□□□ 0.84
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ercc6F8VPZ5 1481 aa20.23■□□□□ 0.83
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr62Q3U3T8 1523 aa20.22■□□□□ 0.83
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Unc13aQ4KUS2 1712 aa20.08■□□□□ 0.8
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcgf6Q99NA9 353 aa20.04■□□□□ 0.8
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fmn1Q05860 1466 aa20.04■□□□□ 0.8
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il27Q8K3I6 234 aa20.02■□□□□ 0.8
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif15Q6P9L6 1387 aa19.97■□□□□ 0.79
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa19.96■□□□□ 0.79
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubl4bQ9CQ84 188 aa19.93■□□□□ 0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TnnQ80Z71 1560 aa19.83■□□□□ 0.77
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lamc3Q9R0B6 1581 aa19.83■□□□□ 0.76
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Npm2Q80W85 207 aa19.81■□□□□ 0.76
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myt1lP97500 1187 aa19.78■□□□□ 0.76
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam135aQ6NS59 1506 aa19.73■□□□□ 0.75
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cux2P70298 1426 aa19.72■□□□□ 0.75
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa19.68■□□□□ 0.74
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Camsap1A2AHC3 1581 aa19.66■□□□□ 0.74
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc18Q640L5 1455 aa19.63■□□□□ 0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtprkP35822 1457 aa19.62■□□□□ 0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cep162Q6ZQ06 1403 aa19.59■□□□□ 0.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zeb1Q64318 1117 aa19.55■□□□□ 0.72
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grin2bQ01097 1482 aa19.49■□□□□ 0.71
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shroom4Q1W617 1475 aa19.43■□□□□ 0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrc2Q64449 1479 aa19.4■□□□□ 0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap35Q91YM2 1499 aa19.4■□□□□ 0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NrkQ9R0G8 1455 aa19.4■□□□□ 0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif21aQ9QXL2 1672 aa19.35■□□□□ 0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Duox2A2AQ99 1517 aa19.34■□□□□ 0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Baz1bQ9Z277 1479 aa19.34■□□□□ 0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa19.33■□□□□ 0.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Neurod1Q60867 357 aa19.29■□□□□ 0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 UbtfP25976 765 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clip1Q922J3 1391 aa19.27■□□□□ 0.68
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa19.26■□□□□ 0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Efcab5A0JP43 1406 aa19.24■□□□□ 0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa19.24■□□□□ 0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Samd9lQ69Z37 1561 aa19.22■□□□□ 0.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rad54l2Q99NG0 1466 aa19.2■□□□□ 0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mier1Q5UAK0 511 aa19.2■□□□□ 0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crocc2F6XLV1 1638 aa19.2■□□□□ 0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Setd5Q5XJV7 1441 aa19.14■□□□□ 0.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map3k1P53349 1493 aa19.13■□□□□ 0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plb1Q3TTY0 1478 aa19.13■□□□□ 0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eea1Q8BL66 1411 aa19.1■□□□□ 0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NefmP08553 848 aa19.09■□□□□ 0.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arap1Q4LDD4 1452 aa19.08■□□□□ 0.64
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SynmQ70IV5 1561 aa19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 88.2 ms