RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
RPS1B	YML063W	HTA2	P04912	132 aa		6.84	□□□□□ -1.31
RPS1B	YML063W	RAM2	P29703	316 aa		6.84	□□□□□ -1.31
RPS1B	YML063W	DCW1	P36091	449 aa		6.84	□□□□□ -1.31
RPS1B	YML063W	INO80	P53115	1489 aa		6.83	□□□□□ -1.32
RPS1B	YML063W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	6.82	□□□□□ -1.32
RPS1B	YML063W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	6.81	□□□□□ -1.32
RPS1B	YML063W	YEL023C	P39992	682 aa		6.8	□□□□□ -1.32
RPS1B	YML063W	EDS1	P38073	919 aa		6.79	□□□□□ -1.32
RPS1B	YML063W	PTC4	P38089	393 aa		6.79	□□□□□ -1.32
RPS1B	YML063W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	6.79	□□□□□ -1.32
RPS1B	YML063W	SAP30	P38429	201 aa		6.78	□□□□□ -1.32
RPS1B	YML063W	YDL129W	Q07555	291 aa		6.78	□□□□□ -1.32
RPS1B	YML063W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	6.77	□□□□□ -1.33
RPS1B	YML063W	MIF2	P35201	549 aa		6.76	□□□□□ -1.33
RPS1B	YML063W	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	6.75	□□□□□ -1.33
RPS1B	YML063W	COQ8	P27697	501 aa		6.72	□□□□□ -1.33
RPS1B	YML063W	GUT1	P32190	709 aa		6.71	□□□□□ -1.34
RPS1B	YML063W	ATH1	P48016	1211 aa		6.71	□□□□□ -1.34
RPS1B	YML063W	NST1	P53935	1240 aa		6.71	□□□□□ -1.34
RPS1B	YML063W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RPS1B	YML063W	PRE3	P38624	215 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RPS1B	YML063W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RPS1B	YML063W	YDR344C	Q05510	147 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RPS1B	YML063W	SOL3	P38858	249 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RPS1B	YML063W	PML39	Q03760	334 aa		6.66	□□□□□ -1.34
RPS1B	YML063W	BCK2	P33306	851 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RPS1B	YML063W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RPS1B	YML063W	DMA2	P53924	522 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPS1B	YML063W	SWR1	Q05471	1514 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPS1B	YML063W	RLF2	Q12495	606 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPS1B	YML063W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RPS1B	YML063W	MPH3	P0CE00	602 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPS1B	YML063W	MID1	P41821	548 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPS1B	YML063W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RPS1B	YML063W	AI4	P03878	556 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPS1B	YML063W	DNA2	P38859	1522 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPS1B	YML063W	ARH1	P48360	493 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPS1B	YML063W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RPS1B	YML063W	YGR273C	P53329	174 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPS1B	YML063W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RPS1B	YML063W	AIM44	Q99299	758 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPS1B	YML063W	VRP1	P37370	817 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPS1B	YML063W	CKB1	P43639	278 aa		6.51	□□□□□ -1.37
RPS1B	YML063W	PEX29	Q03370	554 aa		6.5	□□□□□ -1.37
RPS1B	YML063W	XDJ1	P39102	459 aa		6.49	□□□□□ -1.37
RPS1B	YML063W	KOG1	P38873	1557 aa		6.48	□□□□□ -1.37
RPS1B	YML063W	SPT23	P35210	1082 aa		6.47	□□□□□ -1.37
RPS1B	YML063W	HAP5	Q02516	242 aa		6.47	□□□□□ -1.37
RPS1B	YML063W	MPC54	Q08550	464 aa		6.47	□□□□□ -1.37
RPS1B	YML063W	IFH1	P39520	1085 aa		6.46	□□□□□ -1.38
RPS1B	YML063W	SLI15	P38283	698 aa		6.45	□□□□□ -1.38
RPS1B	YML063W	BNI4	P53858	892 aa		6.44	□□□□□ -1.38
RPS1B	YML063W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
RPS1B	YML063W	SGS1	P35187	1447 aa		6.42	□□□□□ -1.38
RPS1B	YML063W	KEX1	P09620	729 aa		6.42	□□□□□ -1.38
RPS1B	YML063W	NMA111	P53920	997 aa		6.4	□□□□□ -1.38
RPS1B	YML063W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
RPS1B	YML063W	DPL1	Q05567	589 aa		6.39	□□□□□ -1.39
RPS1B	YML063W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
RPS1B	YML063W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
RPS1B	YML063W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
RPS1B	YML063W	HSL1	P34244	1518 aa		6.38	□□□□□ -1.39
RPS1B	YML063W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39
RPS1B	YML063W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	6.37	□□□□□ -1.39
RPS1B	YML063W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39
RPS1B	YML063W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
RPS1B	YML063W	VHR2	P40041	505 aa		6.34	□□□□□ -1.39
RPS1B	YML063W	CDC73	Q06697	393 aa		6.34	□□□□□ -1.39
RPS1B	YML063W	YPR015C	Q12531	247 aa		6.34	□□□□□ -1.39
RPS1B	YML063W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
RPS1B	YML063W	RAM1	P22007	431 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RPS1B	YML063W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.32	□□□□□ -1.4	not detected
RPS1B	YML063W	YPR148C	Q06523	435 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RPS1B	YML063W	ISU2	Q12056	156 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RPS1B	YML063W	RAD54	P32863	898 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPS1B	YML063W	YDR090C	Q03193	310 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPS1B	YML063W	SRC1	Q03707	834 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPS1B	YML063W	DSF2	P38213	736 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPS1B	YML063W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RPS1B	YML063W	PDR1	P12383	1068 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPS1B	YML063W	KIN1	P13185	1064 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPS1B	YML063W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RPS1B	YML063W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RPS1B	YML063W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RPS1B	YML063W	VPS70	P47161	811 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPS1B	YML063W	HIR3	P47171	1648 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPS1B	YML063W	YML020W	Q03722	664 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPS1B	YML063W	AIM7	Q12156	149 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPS1B	YML063W	RAS1	P01119	309 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RPS1B	YML063W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
RPS1B	YML063W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
RPS1B	YML063W	SDH2	P21801	266 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RPS1B	YML063W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
RPS1B	YML063W	GYP1	Q08484	637 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RPS1B	YML063W	KIC1	P38692	1080 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RPS1B	YML063W	RGA2	Q06407	1009 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RPS1B	YML063W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
RPS1B	YML063W	IOC4	Q04213	475 aa		6.16	□□□□□ -1.42
RPS1B	YML063W	PBS2	P08018	668 aa		6.15	□□□□□ -1.42

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.1 ms