Protein–RNA interactions for Protein: Q05567

DPL1, Sphingosine-1-phosphate lyase, yeastyeast

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPL1Q05567 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.71■■□□□ 1.55
DPL1Q05567 NOP1YDL014W 984 nt24.23■■□□□ 1.47
DPL1Q05567 NSR1YGR159C 1245 nt24.04■■□□□ 1.44
DPL1Q05567 YKL036CYKL036C 393 nt22.92■■□□□ 1.26
DPL1Q05567 YJL027CYJL027C 417 nt21.52■■□□□ 1.04
DPL1Q05567 Q0297Q0297 156 nt21.4■■□□□ 1.02
DPL1Q05567 SRX1YKL086W 384 nt21.18■□□□□ 0.98
DPL1Q05567 SCS3YGL126W 1143 nt21.15■□□□□ 0.98
DPL1Q05567 MDJ1YFL016C 1536 nt20.83■□□□□ 0.92
DPL1Q05567 YCR051WYCR051W 669 nt20.18■□□□□ 0.82
DPL1Q05567 YOL085CYOL085C 342 nt19.85■□□□□ 0.77
DPL1Q05567 PKP1YIL042C 1185 nt19.52■□□□□ 0.72
DPL1Q05567 SCJ1YMR214W 1134 nt19.42■□□□□ 0.7
DPL1Q05567 RPP1BYDL130W 321 nt19.21■□□□□ 0.67
DPL1Q05567 ATS1YAL020C 1002 nt19.09■□□□□ 0.65
DPL1Q05567 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.8■□□□□ 0.6
DPL1Q05567 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.8■□□□□ 0.6
DPL1Q05567 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.8■□□□□ 0.6
DPL1Q05567 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.8■□□□□ 0.6
DPL1Q05567 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.8■□□□□ 0.6
DPL1Q05567 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.8■□□□□ 0.6
DPL1Q05567 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.8■□□□□ 0.6
DPL1Q05567 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.8■□□□□ 0.6
DPL1Q05567 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.8■□□□□ 0.6
DPL1Q05567 CCC1YLR220W 969 nt18.7■□□□□ 0.58
DPL1Q05567 DBP2YNL112W 1641 nt18.64■□□□□ 0.57
DPL1Q05567 PET122YER153C 765 nt18.31■□□□□ 0.52
DPL1Q05567 SCR1SCR1 522 nt18.25■□□□□ 0.51
DPL1Q05567 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18■□□□□ 0.47
DPL1Q05567 RRN5YLR141W 1092 nt17.87■□□□□ 0.45
DPL1Q05567 RTC3YHR087W 336 nt17.72■□□□□ 0.43
DPL1Q05567 RSB1YOR049C 1065 nt17.66■□□□□ 0.42
DPL1Q05567 RVS167YDR388W 1449 nt17.64■□□□□ 0.42
DPL1Q05567 PST2YDR032C 597 nt17.58■□□□□ 0.4
DPL1Q05567 YBR190WYBR190W 312 nt17.57■□□□□ 0.4
DPL1Q05567 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.5■□□□□ 0.39
DPL1Q05567 YDJ1YNL064C 1230 nt17.38■□□□□ 0.37
DPL1Q05567 YKL097CYKL097C 411 nt17.18■□□□□ 0.34
DPL1Q05567 SHR5YOL110W 714 nt17.17■□□□□ 0.34
DPL1Q05567 GAR1YHR089C 618 nt16.96■□□□□ 0.31
DPL1Q05567 SHU1YHL006C 453 nt16.74■□□□□ 0.27
DPL1Q05567 DEP1YAL013W 1218 nt16.56■□□□□ 0.24
DPL1Q05567 YOR139CYOR139C 393 nt16.4■□□□□ 0.22
DPL1Q05567 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.36■□□□□ 0.21
DPL1Q05567 URN1YPR152C 1398 nt16.36■□□□□ 0.21
DPL1Q05567 TIR1YER011W 765 nt16.34■□□□□ 0.21
DPL1Q05567 YNL208WYNL208W 600 nt16.3■□□□□ 0.2
DPL1Q05567 RPN10YHR200W 807 nt16.21■□□□□ 0.19
DPL1Q05567 NPL3YDR432W 1245 nt16.13■□□□□ 0.17
DPL1Q05567 SSA1YAL005C 1929 nt16.03■□□□□ 0.16
DPL1Q05567 OPI9YLR338W 858 nt15.98■□□□□ 0.15
DPL1Q05567 SRB2YHR041C 633 nt15.9■□□□□ 0.14
DPL1Q05567 MNP1YGL068W 585 nt15.8■□□□□ 0.12
DPL1Q05567 SSA3YBL075C 1950 nt15.77■□□□□ 0.12
DPL1Q05567 HOM6YJR139C 1080 nt15.77■□□□□ 0.12
DPL1Q05567 SAH1YER043C 1350 nt15.76■□□□□ 0.11
DPL1Q05567 YGR021WYGR021W 873 nt15.76■□□□□ 0.11
DPL1Q05567 WWM1YFL010C 636 nt15.74■□□□□ 0.11
DPL1Q05567 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.73■□□□□ 0.11
DPL1Q05567 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.73■□□□□ 0.11
DPL1Q05567 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.73■□□□□ 0.11
DPL1Q05567 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.73■□□□□ 0.11
DPL1Q05567 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.73■□□□□ 0.11
DPL1Q05567 YOL037CYOL037C 354 nt15.71■□□□□ 0.11
DPL1Q05567 YJR018WYJR018W 363 nt15.64■□□□□ 0.09
DPL1Q05567 RKM5YLR137W 1104 nt15.54■□□□□ 0.08
DPL1Q05567 YJR120WYJR120W 351 nt15.51■□□□□ 0.07
DPL1Q05567 PUN1YLR414C 792 nt15.51■□□□□ 0.07
DPL1Q05567 PUT4YOR348C 1884 nt15.5■□□□□ 0.07
DPL1Q05567 YGR139WYGR139W 339 nt15.47■□□□□ 0.07
DPL1Q05567 RPP2BYDR382W 333 nt15.46■□□□□ 0.07
DPL1Q05567 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.43■□□□□ 0.06
DPL1Q05567 PUS2YGL063W 1113 nt15.42■□□□□ 0.06
DPL1Q05567 ARE1YCR048W 1833 nt15.42■□□□□ 0.06
DPL1Q05567 YLR281CYLR281C 468 nt15.34■□□□□ 0.05
DPL1Q05567 MOT3YMR070W 1473 nt15.33■□□□□ 0.04
DPL1Q05567 PTC2YER089C 1395 nt15.26■□□□□ 0.03
DPL1Q05567 BDH2YAL061W 1254 nt15.26■□□□□ 0.03
DPL1Q05567 WHI5YOR083W 888 nt15.23■□□□□ 0.03
DPL1Q05567 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.22■□□□□ 0.03
DPL1Q05567 BSC6YOL137W 1494 nt15.17■□□□□ 0.02
DPL1Q05567 LSM3YLR438C-A 270 nt15.16■□□□□ 0.02
DPL1Q05567 POA1YBR022W 534 nt15.12■□□□□ 0.01
DPL1Q05567 FMP45YDL222C 930 nt15.02■□□□□ -0
DPL1Q05567 YPR011CYPR011C 981 nt15.02■□□□□ -0
DPL1Q05567 INM2YDR287W 879 nt15□□□□□ -0.01
DPL1Q05567 BUD23YCR047C 828 nt14.96□□□□□ -0.01
DPL1Q05567 NAB2YGL122C 1578 nt14.94□□□□□ -0.02
DPL1Q05567 DSK2YMR276W 1122 nt14.94□□□□□ -0.02
DPL1Q05567 YBL100CYBL100C 315 nt14.94□□□□□ -0.02
DPL1Q05567 FPR4YLR449W 1179 nt14.9□□□□□ -0.02
DPL1Q05567 TRM9YML014W 840 nt14.9□□□□□ -0.02
DPL1Q05567 YCH1YGR203W 447 nt14.89□□□□□ -0.03
DPL1Q05567 MRPL8YJL063C 717 nt14.89□□□□□ -0.03
DPL1Q05567 YLR236CYLR236C 324 nt14.89□□□□□ -0.03
DPL1Q05567 DAL1YIR027C 1383 nt14.86□□□□□ -0.03
DPL1Q05567 IMP2'YIL154C 1041 nt14.83□□□□□ -0.04
DPL1Q05567 Q0182Q0182 405 nt14.82□□□□□ -0.04
DPL1Q05567 FUN26YAL022C 1554 nt14.81□□□□□ -0.04
DPL1Q05567 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms