RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS1B	YML063W	FAP1	P53971	965 aa		10.7	□□□□□ -0.7
RPS1B	YML063W	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
RPS1B	YML063W	PRY3	P47033	881 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS1B	YML063W	PRI1	P10363	409 aa		9.91	□□□□□ -0.82
RPS1B	YML063W	AAD16	Q02895	342 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RPS1B	YML063W	ISW2	Q08773	1120 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RPS1B	YML063W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	9.57	□□□□□ -0.88
RPS1B	YML063W	YCK3	P39962	524 aa		9.57	□□□□□ -0.88
RPS1B	YML063W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
RPS1B	YML063W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
RPS1B	YML063W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
RPS1B	YML063W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	9.15	□□□□□ -0.94
RPS1B	YML063W	AVT3	P36062	692 aa		9.07	□□□□□ -0.96
RPS1B	YML063W	MRPL32	P25348	183 aa		8.95	□□□□□ -0.98
RPS1B	YML063W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	8.88	□□□□□ -0.99
RPS1B	YML063W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	8.88	□□□□□ -0.99
RPS1B	YML063W	REB1	P21538	810 aa		8.82	□□□□□ -1
RPS1B	YML063W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	8.78	□□□□□ -1
RPS1B	YML063W	TFA1	P36100	482 aa		8.64	□□□□□ -1.03
RPS1B	YML063W	YGL015C	P33199	130 aa		8.63	□□□□□ -1.03
RPS1B	YML063W	SPT21	P35209	758 aa		8.54	□□□□□ -1.04
RPS1B	YML063W	CDC27	P38042	758 aa		8.53	□□□□□ -1.04
RPS1B	YML063W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	8.47	□□□□□ -1.05
RPS1B	YML063W	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	8.35	□□□□□ -1.07
RPS1B	YML063W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	8.28	□□□□□ -1.08
RPS1B	YML063W	TFC8	Q12308	588 aa		8.28	□□□□□ -1.08
RPS1B	YML063W	HO	P09932	586 aa		8.26	□□□□□ -1.09
RPS1B	YML063W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	8.26	□□□□□ -1.09
RPS1B	YML063W	DCD1	P06773	312 aa		8.24	□□□□□ -1.09
RPS1B	YML063W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	8.23	□□□□□ -1.09
RPS1B	YML063W	RIM101	P33400	625 aa		8.18	□□□□□ -1.1
RPS1B	YML063W	SCY1	P53009	804 aa		8.06	□□□□□ -1.12
RPS1B	YML063W	BCH2	P36122	765 aa		8	□□□□□ -1.13
RPS1B	YML063W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
RPS1B	YML063W	OXP1	P28273	1286 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RPS1B	YML063W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RPS1B	YML063W	TGL3	P40308	642 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RPS1B	YML063W	TAF7	Q05021	590 aa		7.85	□□□□□ -1.15
RPS1B	YML063W	EPS1	P40557	701 aa		7.79	□□□□□ -1.16
RPS1B	YML063W	BDF1	P35817	686 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RPS1B	YML063W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RPS1B	YML063W	PTP3	P40048	928 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RPS1B	YML063W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
RPS1B	YML063W	UBP9	P39967	754 aa		7.67	□□□□□ -1.18
RPS1B	YML063W	RSM7	P47150	247 aa		7.64	□□□□□ -1.19
RPS1B	YML063W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RPS1B	YML063W	AI2	P03876	854 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPS1B	YML063W	MST1	P07236	462 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPS1B	YML063W	BBC1	P47068	1157 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RPS1B	YML063W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.54	□□□□□ -1.2	RIP-Chip
RPS1B	YML063W	YOR238W	Q08634	303 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RPS1B	YML063W	YLR271W	Q06152	274 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RPS1B	YML063W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RPS1B	YML063W	YAP5	P40574	245 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RPS1B	YML063W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RPS1B	YML063W	VNX1	P42839	908 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS1B	YML063W	LEO1	P38439	464 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS1B	YML063W	DMA1	P38823	416 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS1B	YML063W	SSP1	P38871	571 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RPS1B	YML063W	MRM1	P25270	412 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RPS1B	YML063W	WSC3	Q12215	556 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RPS1B	YML063W	SPP1	Q03012	353 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RPS1B	YML063W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.29	□□□□□ -1.24	not detected
RPS1B	YML063W	GTT3	P39996	337 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RPS1B	YML063W	PIB1	Q06651	286 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RPS1B	YML063W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RPS1B	YML063W	CST9	Q06032	482 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPS1B	YML063W	MGA2	P40578	1113 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RPS1B	YML063W	VPS29	P38759	282 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RPS1B	YML063W	FKH1	P40466	484 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RPS1B	YML063W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RPS1B	YML063W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.14	□□□□□ -1.27	RIP-Chip
RPS1B	YML063W	IOC2	Q12072	812 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RPS1B	YML063W	RTG3	P38165	486 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RPS1B	YML063W	ULI1	P43604	169 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RPS1B	YML063W	LDB19	Q12502	818 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RPS1B	YML063W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
RPS1B	YML063W	MSB4	Q12317	492 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RPS1B	YML063W	STS1	P38637	319 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RPS1B	YML063W	YFR006W	P43590	535 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RPS1B	YML063W	RCR1	P38212	213 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RPS1B	YML063W	YOL036W	Q08206	761 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RPS1B	YML063W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
RPS1B	YML063W	SET4	P42948	560 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RPS1B	YML063W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
RPS1B	YML063W	YJL171C	P46992	396 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RPS1B	YML063W	SAM3	Q08986	587 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RPS1B	YML063W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RPS1B	YML063W	RTG1	P32607	177 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPS1B	YML063W	BMT6	Q12291	365 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RPS1B	YML063W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RPS1B	YML063W	LEU3	P08638	886 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RPS1B	YML063W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
RPS1B	YML063W	SEC61	P32915	480 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RPS1B	YML063W	NCR1	Q12200	1170 aa		6.92	□□□□□ -1.3
RPS1B	YML063W	GYP5	Q12344	894 aa		6.9	□□□□□ -1.3
RPS1B	YML063W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	6.89	□□□□□ -1.31
RPS1B	YML063W	DAN4	P47179	1161 aa		6.88	□□□□□ -1.31
RPS1B	YML063W	JIP4	Q03361	876 aa		6.85	□□□□□ -1.31

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.6 ms