Protein–RNA interactions for Protein: P38073

EDS1, Transcriptional regulatory protein EDS1, yeastyeast

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EDS1P38073 NSR1YGR159C 1245 nt17.22■□□□□ 0.35
EDS1P38073 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.09■□□□□ 0.33
EDS1P38073 MOT3YMR070W 1473 nt16.58■□□□□ 0.24
EDS1P38073 YGR139WYGR139W 339 nt16.57■□□□□ 0.24
EDS1P38073 NOP1YDL014W 984 nt16.51■□□□□ 0.23
EDS1P38073 Q0182Q0182 405 nt16.46■□□□□ 0.23
EDS1P38073 NME1NME1 340 nt15.6■□□□□ 0.09
EDS1P38073 MDJ1YFL016C 1536 nt15.53■□□□□ 0.08
EDS1P38073 CSM2YIL132C 642 nt15.02■□□□□ -0
EDS1P38073 YKL036CYKL036C 393 nt15.01□□□□□ -0.01
EDS1P38073 PAU21YOR394W 495 nt14.78□□□□□ -0.04
EDS1P38073 PAU22YPL282C 495 nt14.78□□□□□ -0.04
EDS1P38073 ARO7YPR060C 771 nt14.59□□□□□ -0.07
EDS1P38073 SRX1YKL086W 384 nt14.45□□□□□ -0.1
EDS1P38073 Q0297Q0297 156 nt14.41□□□□□ -0.1
EDS1P38073 YJL027CYJL027C 417 nt14.29□□□□□ -0.12
EDS1P38073 PAM17YKR065C 594 nt14.29□□□□□ -0.12
EDS1P38073 REG2YBR050C 1017 nt14.21□□□□□ -0.13
EDS1P38073 YDR509WYDR509W 348 nt13.94□□□□□ -0.18
EDS1P38073 BUR6YER159C 429 nt13.89□□□□□ -0.19
EDS1P38073 SSA3YBL075C 1950 nt13.85□□□□□ -0.19
EDS1P38073 BMT5YIL096C 1011 nt13.82□□□□□ -0.2
EDS1P38073 Q0010Q0010 387 nt13.82□□□□□ -0.2
EDS1P38073 VAR1Q0140 1197 nt13.77□□□□□ -0.21
EDS1P38073 DBP2YNL112W 1641 nt13.68□□□□□ -0.22
EDS1P38073 YCR051WYCR051W 669 nt13.66□□□□□ -0.22
EDS1P38073 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt13.62□□□□□ -0.23
EDS1P38073 ARA2YMR041C 1008 nt13.6□□□□□ -0.23
EDS1P38073 SRN2YLR119W 642 nt13.58□□□□□ -0.24
EDS1P38073 SCS3YGL126W 1143 nt13.55□□□□□ -0.24
EDS1P38073 Q0144Q0144 330 nt13.49□□□□□ -0.25
EDS1P38073 SEM1YDR363W-A 270 nt13.47□□□□□ -0.25
EDS1P38073 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt13.47□□□□□ -0.25
EDS1P38073 YLR122CYLR122C 378 nt13.38□□□□□ -0.27
EDS1P38073 MET8YBR213W 825 nt13.34□□□□□ -0.27
EDS1P38073 YBR190WYBR190W 312 nt13.31□□□□□ -0.28
EDS1P38073 CLB6YGR109C 1143 nt13.3□□□□□ -0.28
EDS1P38073 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.23□□□□□ -0.29
EDS1P38073 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.23□□□□□ -0.29
EDS1P38073 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.23□□□□□ -0.29
EDS1P38073 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.23□□□□□ -0.29
EDS1P38073 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.23□□□□□ -0.29
EDS1P38073 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.23□□□□□ -0.29
EDS1P38073 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.23□□□□□ -0.29
EDS1P38073 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.23□□□□□ -0.29
EDS1P38073 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.23□□□□□ -0.29
EDS1P38073 ABZ2YMR289W 1125 nt13.21□□□□□ -0.29
EDS1P38073 ARP10YDR106W 855 nt13.16□□□□□ -0.3
EDS1P38073 TOM20YGR082W 552 nt13.13□□□□□ -0.31
EDS1P38073 CCC1YLR220W 969 nt13.05□□□□□ -0.32
EDS1P38073 YCR099CYCR099C 468 nt13.04□□□□□ -0.32
EDS1P38073 YOL085CYOL085C 342 nt13.04□□□□□ -0.32
EDS1P38073 LCP5YER127W 1074 nt12.98□□□□□ -0.33
EDS1P38073 UTP6YDR449C 1323 nt12.97□□□□□ -0.33
EDS1P38073 URH1YDR400W 1023 nt12.96□□□□□ -0.33
EDS1P38073 RTC3YHR087W 336 nt12.96□□□□□ -0.33
EDS1P38073 AI3Q0060 1248 nt12.95□□□□□ -0.34
EDS1P38073 RPP1BYDL130W 321 nt12.92□□□□□ -0.34
EDS1P38073 PET20YPL159C 762 nt12.87□□□□□ -0.35
EDS1P38073 AI5_BETAQ0075 1065 nt12.86□□□□□ -0.35
EDS1P38073 HMT1YBR034C 1047 nt12.86□□□□□ -0.35
EDS1P38073 PKP1YIL042C 1185 nt12.85□□□□□ -0.35
EDS1P38073 SKG1YKR100C 1068 nt12.81□□□□□ -0.36
EDS1P38073 snR78snR78 87 nt12.75□□□□□ -0.37
EDS1P38073 RVS167YDR388W 1449 nt12.72□□□□□ -0.37
EDS1P38073 YPL071CYPL071C 471 nt12.71□□□□□ -0.37
EDS1P38073 Q0142Q0142 177 nt12.68□□□□□ -0.38
EDS1P38073 SCJ1YMR214W 1134 nt12.68□□□□□ -0.38
EDS1P38073 YJL118WYJL118W 660 nt12.59□□□□□ -0.39
EDS1P38073 YNR068CYNR068C 819 nt12.59□□□□□ -0.39
EDS1P38073 YHM2YMR241W 945 nt12.57□□□□□ -0.4
EDS1P38073 YPL168WYPL168W 1293 nt12.56□□□□□ -0.4
EDS1P38073 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt12.54□□□□□ -0.4
EDS1P38073 YMR057CYMR057C 372 nt12.52□□□□□ -0.41
EDS1P38073 Q0255Q0255 1419 nt12.47□□□□□ -0.41
EDS1P38073 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.42□□□□□ -0.42
EDS1P38073 URE2YNL229C 1065 nt12.39□□□□□ -0.43
EDS1P38073 PET122YER153C 765 nt12.38□□□□□ -0.43
EDS1P38073 YOR169CYOR169C 465 nt12.36□□□□□ -0.43
EDS1P38073 YJL107CYJL107C 1164 nt12.35□□□□□ -0.43
EDS1P38073 Q0017Q0017 162 nt12.34□□□□□ -0.43
EDS1P38073 YGL188CYGL188C 174 nt12.32□□□□□ -0.44
EDS1P38073 AIR1YIL079C 1083 nt12.31□□□□□ -0.44
EDS1P38073 PUT4YOR348C 1884 nt12.3□□□□□ -0.44
EDS1P38073 RSM23YGL129C 1353 nt12.29□□□□□ -0.44
EDS1P38073 ATP6Q0085 780 nt12.26□□□□□ -0.45
EDS1P38073 SHR5YOL110W 714 nt12.26□□□□□ -0.45
EDS1P38073 YJR154WYJR154W 1041 nt12.22□□□□□ -0.45
EDS1P38073 THP3YPR045C 1413 nt12.2□□□□□ -0.46
EDS1P38073 YEL074WYEL074W 339 nt12.15□□□□□ -0.46
EDS1P38073 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt12.15□□□□□ -0.46
EDS1P38073 FTR1YER145C 1215 nt12.13□□□□□ -0.47
EDS1P38073 STB1YNL309W 1263 nt12.13□□□□□ -0.47
EDS1P38073 SCR1SCR1 522 nt12.13□□□□□ -0.47
EDS1P38073 KTR3YBR205W 1215 nt12.13□□□□□ -0.47
EDS1P38073 COG1YGL223C 1254 nt12.12□□□□□ -0.47
EDS1P38073 YPL041CYPL041C 624 nt12.12□□□□□ -0.47
EDS1P38073 FTH1YBR207W 1398 nt12.1□□□□□ -0.47
EDS1P38073 PAB1YER165W 1734 nt12.1□□□□□ -0.47
EDS1P38073 LSM12YHR121W 564 nt12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.2 ms