Protein–RNA interactions for Protein: P38137

PCS60, Peroxisomal-coenzyme A synthetase, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PCS60P38137 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.8■■□□□ 1.4
PCS60P38137 NOP1YDL014W 984 nt23.42■■□□□ 1.34
PCS60P38137 NSR1YGR159C 1245 nt23.04■■□□□ 1.28
PCS60P38137 YKL036CYKL036C 393 nt22.24■■□□□ 1.15
PCS60P38137 YJL027CYJL027C 417 nt20.91■□□□□ 0.94
PCS60P38137 Q0297Q0297 156 nt20.69■□□□□ 0.9
PCS60P38137 SCS3YGL126W 1143 nt20.58■□□□□ 0.89
PCS60P38137 SRX1YKL086W 384 nt20.44■□□□□ 0.86
PCS60P38137 MDJ1YFL016C 1536 nt19.81■□□□□ 0.76
PCS60P38137 YCR051WYCR051W 669 nt19.49■□□□□ 0.71
PCS60P38137 YOL085CYOL085C 342 nt19.24■□□□□ 0.67
PCS60P38137 SCJ1YMR214W 1134 nt19.08■□□□□ 0.64
PCS60P38137 PKP1YIL042C 1185 nt18.89■□□□□ 0.61
PCS60P38137 ATS1YAL020C 1002 nt18.61■□□□□ 0.57
PCS60P38137 RPP1BYDL130W 321 nt18.58■□□□□ 0.56
PCS60P38137 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.06■□□□□ 0.48
PCS60P38137 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.06■□□□□ 0.48
PCS60P38137 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.06■□□□□ 0.48
PCS60P38137 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.06■□□□□ 0.48
PCS60P38137 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.06■□□□□ 0.48
PCS60P38137 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.06■□□□□ 0.48
PCS60P38137 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.06■□□□□ 0.48
PCS60P38137 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.06■□□□□ 0.48
PCS60P38137 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.06■□□□□ 0.48
PCS60P38137 CCC1YLR220W 969 nt17.96■□□□□ 0.47
PCS60P38137 DBP2YNL112W 1641 nt17.78■□□□□ 0.44
PCS60P38137 SCR1SCR1 522 nt17.7■□□□□ 0.42
PCS60P38137 PET122YER153C 765 nt17.67■□□□□ 0.42
PCS60P38137 RTC3YHR087W 336 nt17.37■□□□□ 0.37
PCS60P38137 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.34■□□□□ 0.37
PCS60P38137 RRN5YLR141W 1092 nt17.25■□□□□ 0.35
PCS60P38137 PST2YDR032C 597 nt17.11■□□□□ 0.33
PCS60P38137 RSB1YOR049C 1065 nt17.11■□□□□ 0.33 RIP-Chip
PCS60P38137 RVS167YDR388W 1449 nt16.93■□□□□ 0.3
PCS60P38137 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.91■□□□□ 0.3
PCS60P38137 YKL097CYKL097C 411 nt16.81■□□□□ 0.28
PCS60P38137 YDJ1YNL064C 1230 nt16.74■□□□□ 0.27
PCS60P38137 YBR190WYBR190W 312 nt16.7■□□□□ 0.26
PCS60P38137 SHR5YOL110W 714 nt16.47■□□□□ 0.23 RIP-Chip
PCS60P38137 GAR1YHR089C 618 nt16.3■□□□□ 0.2
PCS60P38137 SHU1YHL006C 453 nt16.25■□□□□ 0.19
PCS60P38137 YOR139CYOR139C 393 nt15.99■□□□□ 0.15
PCS60P38137 MOT3YMR070W 1473 nt15.92■□□□□ 0.14 RIP-Chip
PCS60P38137 Q0182Q0182 405 nt15.9■□□□□ 0.14
PCS60P38137 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.82■□□□□ 0.12
PCS60P38137 DEP1YAL013W 1218 nt15.81■□□□□ 0.12
PCS60P38137 NPL3YDR432W 1245 nt15.74■□□□□ 0.11
PCS60P38137 TIR1YER011W 765 nt15.71■□□□□ 0.11 RIP-Chip
PCS60P38137 YGR139WYGR139W 339 nt15.66■□□□□ 0.1
PCS60P38137 YNL208WYNL208W 600 nt15.62■□□□□ 0.09
PCS60P38137 URN1YPR152C 1398 nt15.6■□□□□ 0.09
PCS60P38137 RPN10YHR200W 807 nt15.53■□□□□ 0.08
PCS60P38137 SSA1YAL005C 1929 nt15.37■□□□□ 0.05
PCS60P38137 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.32■□□□□ 0.04
PCS60P38137 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.32■□□□□ 0.04
PCS60P38137 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.32■□□□□ 0.04
PCS60P38137 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.32■□□□□ 0.04
PCS60P38137 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.32■□□□□ 0.04
PCS60P38137 YOL037CYOL037C 354 nt15.27■□□□□ 0.04
PCS60P38137 MNP1YGL068W 585 nt15.26■□□□□ 0.03
PCS60P38137 YGR021WYGR021W 873 nt15.25■□□□□ 0.03
PCS60P38137 SRB2YHR041C 633 nt15.23■□□□□ 0.03
PCS60P38137 HOM6YJR139C 1080 nt15.23■□□□□ 0.03
PCS60P38137 OPI9YLR338W 858 nt15.21■□□□□ 0.03
PCS60P38137 WWM1YFL010C 636 nt15.14■□□□□ 0.01
PCS60P38137 RKM5YLR137W 1104 nt15.01□□□□□ -0.01
PCS60P38137 BSC6YOL137W 1494 nt15□□□□□ -0.01
PCS60P38137 PUS2YGL063W 1113 nt14.98□□□□□ -0.01
PCS60P38137 SAH1YER043C 1350 nt14.96□□□□□ -0.02
PCS60P38137 YJR018WYJR018W 363 nt14.92□□□□□ -0.02
PCS60P38137 NME1NME1 340 nt14.89□□□□□ -0.03
PCS60P38137 YLR281CYLR281C 468 nt14.88□□□□□ -0.03
PCS60P38137 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.86□□□□□ -0.03
PCS60P38137 RPP2BYDR382W 333 nt14.83□□□□□ -0.04
PCS60P38137 YJR120WYJR120W 351 nt14.79□□□□□ -0.04
PCS60P38137 PUN1YLR414C 792 nt14.78□□□□□ -0.04
PCS60P38137 WHI5YOR083W 888 nt14.74□□□□□ -0.05
PCS60P38137 SSA3YBL075C 1950 nt14.64□□□□□ -0.07
PCS60P38137 MRPL8YJL063C 717 nt14.64□□□□□ -0.07
PCS60P38137 BDH2YAL061W 1254 nt14.62□□□□□ -0.07
PCS60P38137 PUT4YOR348C 1884 nt14.61□□□□□ -0.07 RIP-Chip
PCS60P38137 FMP45YDL222C 930 nt14.6□□□□□ -0.07
PCS60P38137 ARE1YCR048W 1833 nt14.58□□□□□ -0.08
PCS60P38137 LSM3YLR438C-A 270 nt14.57□□□□□ -0.08
PCS60P38137 YPR011CYPR011C 981 nt14.51□□□□□ -0.09
PCS60P38137 PTC2YER089C 1395 nt14.5□□□□□ -0.09
PCS60P38137 DSK2YMR276W 1122 nt14.5□□□□□ -0.09
PCS60P38137 YCH1YGR203W 447 nt14.49□□□□□ -0.09
PCS60P38137 UBX6YJL048C 1191 nt14.42□□□□□ -0.1
PCS60P38137 ADO1YJR105W 1023 nt14.41□□□□□ -0.1
PCS60P38137 YLR236CYLR236C 324 nt14.41□□□□□ -0.1
PCS60P38137 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.4□□□□□ -0.1
PCS60P38137 IMP2'YIL154C 1041 nt14.4□□□□□ -0.1
PCS60P38137 INM2YDR287W 879 nt14.3□□□□□ -0.12
PCS60P38137 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.3□□□□□ -0.12 RIP-Chip
PCS60P38137 YEL076CYEL076C 651 nt14.3□□□□□ -0.12
PCS60P38137 YLR464WYLR464W 651 nt14.3□□□□□ -0.12
PCS60P38137 YBL100CYBL100C 315 nt14.28□□□□□ -0.12
PCS60P38137 TRM9YML014W 840 nt14.26□□□□□ -0.13
PCS60P38137 POA1YBR022W 534 nt14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 92.3 ms