Protein–RNA interactions for Protein: P53858

BNI4, Protein BNI4, yeastyeast

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BNI4P53858 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.73■□□□□ 0.75
BNI4P53858 NOP1YDL014W 984 nt19.39■□□□□ 0.69
BNI4P53858 NSR1YGR159C 1245 nt19.33■□□□□ 0.68
BNI4P53858 YKL036CYKL036C 393 nt18.13■□□□□ 0.49
BNI4P53858 MDJ1YFL016C 1536 nt17.32■□□□□ 0.36
BNI4P53858 YJL027CYJL027C 417 nt16.99■□□□□ 0.31
BNI4P53858 Q0297Q0297 156 nt16.98■□□□□ 0.31
BNI4P53858 SRX1YKL086W 384 nt16.86■□□□□ 0.29
BNI4P53858 SCS3YGL126W 1143 nt16.6■□□□□ 0.25
BNI4P53858 YCR051WYCR051W 669 nt16.05■□□□□ 0.16
BNI4P53858 YOL085CYOL085C 342 nt15.64■□□□□ 0.09
BNI4P53858 PKP1YIL042C 1185 nt15.34■□□□□ 0.05
BNI4P53858 RPP1BYDL130W 321 nt15.26■□□□□ 0.03
BNI4P53858 YGR139WYGR139W 339 nt15.26■□□□□ 0.03
BNI4P53858 SCJ1YMR214W 1134 nt15.17■□□□□ 0.02
BNI4P53858 SSA3YBL075C 1950 nt15.1■□□□□ 0.01
BNI4P53858 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.03■□□□□ -0
BNI4P53858 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.03■□□□□ -0
BNI4P53858 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.03■□□□□ -0
BNI4P53858 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.03■□□□□ -0
BNI4P53858 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.03■□□□□ -0
BNI4P53858 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.03■□□□□ -0
BNI4P53858 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.03■□□□□ -0
BNI4P53858 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.03■□□□□ -0
BNI4P53858 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.03■□□□□ -0
BNI4P53858 DBP2YNL112W 1641 nt15.01□□□□□ -0.01
BNI4P53858 ATS1YAL020C 1002 nt14.94□□□□□ -0.02
BNI4P53858 CCC1YLR220W 969 nt14.91□□□□□ -0.02
BNI4P53858 YBR190WYBR190W 312 nt14.89□□□□□ -0.03
BNI4P53858 RTC3YHR087W 336 nt14.63□□□□□ -0.07
BNI4P53858 SCR1SCR1 522 nt14.55□□□□□ -0.08
BNI4P53858 PET122YER153C 765 nt14.49□□□□□ -0.09
BNI4P53858 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.33□□□□□ -0.12
BNI4P53858 RVS167YDR388W 1449 nt14.32□□□□□ -0.12
BNI4P53858 RRN5YLR141W 1092 nt14.12□□□□□ -0.15
BNI4P53858 MOT3YMR070W 1473 nt14.02□□□□□ -0.16
BNI4P53858 RSB1YOR049C 1065 nt13.98□□□□□ -0.17
BNI4P53858 Q0182Q0182 405 nt13.95□□□□□ -0.18
BNI4P53858 YDJ1YNL064C 1230 nt13.88□□□□□ -0.19
BNI4P53858 NME1NME1 340 nt13.87□□□□□ -0.19
BNI4P53858 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.84□□□□□ -0.19
BNI4P53858 PUT4YOR348C 1884 nt13.82□□□□□ -0.2
BNI4P53858 SHR5YOL110W 714 nt13.82□□□□□ -0.2
BNI4P53858 VAR1Q0140 1197 nt13.77□□□□□ -0.21
BNI4P53858 PST2YDR032C 597 nt13.75□□□□□ -0.21
BNI4P53858 CSM2YIL132C 642 nt13.59□□□□□ -0.23
BNI4P53858 GAR1YHR089C 618 nt13.52□□□□□ -0.25
BNI4P53858 YKL097CYKL097C 411 nt13.46□□□□□ -0.25
BNI4P53858 URN1YPR152C 1398 nt13.45□□□□□ -0.26
BNI4P53858 ARE1YCR048W 1833 nt13.43□□□□□ -0.26
BNI4P53858 POA1YBR022W 534 nt13.42□□□□□ -0.26
BNI4P53858 PAU21YOR394W 495 nt13.41□□□□□ -0.26
BNI4P53858 PAU22YPL282C 495 nt13.41□□□□□ -0.26
BNI4P53858 SAH1YER043C 1350 nt13.37□□□□□ -0.27
BNI4P53858 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.36□□□□□ -0.27
BNI4P53858 PAM17YKR065C 594 nt13.33□□□□□ -0.28
BNI4P53858 DEP1YAL013W 1218 nt13.32□□□□□ -0.28
BNI4P53858 OPI9YLR338W 858 nt13.32□□□□□ -0.28
BNI4P53858 YDR509WYDR509W 348 nt13.31□□□□□ -0.28
BNI4P53858 ARO7YPR060C 771 nt13.3□□□□□ -0.28
BNI4P53858 RPN10YHR200W 807 nt13.22□□□□□ -0.29
BNI4P53858 BSC6YOL137W 1494 nt13.22□□□□□ -0.29
BNI4P53858 YNL208WYNL208W 600 nt13.16□□□□□ -0.3
BNI4P53858 SSA1YAL005C 1929 nt13.14□□□□□ -0.31
BNI4P53858 SHU1YHL006C 453 nt13.11□□□□□ -0.31
BNI4P53858 BUD23YCR047C 828 nt13.06□□□□□ -0.32
BNI4P53858 FPS1YLL043W 2010 nt13.06□□□□□ -0.32
BNI4P53858 TIR1YER011W 765 nt13.05□□□□□ -0.32
BNI4P53858 REG2YBR050C 1017 nt13.01□□□□□ -0.33
BNI4P53858 PUN1YLR414C 792 nt12.99□□□□□ -0.33
BNI4P53858 SPT5YML010W 3192 nt12.97□□□□□ -0.33
BNI4P53858 BUR6YER159C 429 nt12.91□□□□□ -0.34
BNI4P53858 Q0144Q0144 330 nt12.91□□□□□ -0.34
BNI4P53858 PAC11YDR488C 1602 nt12.89□□□□□ -0.35
BNI4P53858 PTC2YER089C 1395 nt12.89□□□□□ -0.35
BNI4P53858 BMT5YIL096C 1011 nt12.87□□□□□ -0.35
BNI4P53858 NVJ2YPR091C 2313 nt12.85□□□□□ -0.35
BNI4P53858 YJR018WYJR018W 363 nt12.8□□□□□ -0.36
BNI4P53858 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.8□□□□□ -0.36
BNI4P53858 SSA4YER103W 1929 nt12.78□□□□□ -0.36
BNI4P53858 NAB2YGL122C 1578 nt12.78□□□□□ -0.36
BNI4P53858 YOR139CYOR139C 393 nt12.74□□□□□ -0.37
BNI4P53858 NPL3YDR432W 1245 nt12.71□□□□□ -0.37
BNI4P53858 SEM1YDR363W-A 270 nt12.7□□□□□ -0.38
BNI4P53858 Q0010Q0010 387 nt12.67□□□□□ -0.38
BNI4P53858 YGR021WYGR021W 873 nt12.62□□□□□ -0.39
BNI4P53858 Q0142Q0142 177 nt12.59□□□□□ -0.39
BNI4P53858 FPR4YLR449W 1179 nt12.58□□□□□ -0.4
BNI4P53858 RPP2BYDR382W 333 nt12.56□□□□□ -0.4
BNI4P53858 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt12.54□□□□□ -0.4
BNI4P53858 DAL1YIR027C 1383 nt12.53□□□□□ -0.4
BNI4P53858 FIS1YIL065C 468 nt12.52□□□□□ -0.41
BNI4P53858 SRN2YLR119W 642 nt12.52□□□□□ -0.41
BNI4P53858 Q0017Q0017 162 nt12.51□□□□□ -0.41
BNI4P53858 SRB2YHR041C 633 nt12.5□□□□□ -0.41
BNI4P53858 WWM1YFL010C 636 nt12.49□□□□□ -0.41
BNI4P53858 HOM6YJR139C 1080 nt12.49□□□□□ -0.41
BNI4P53858 YOL037CYOL037C 354 nt12.48□□□□□ -0.41
BNI4P53858 MNP1YGL068W 585 nt12.46□□□□□ -0.41
BNI4P53858 MEP2YNL142W 1500 nt12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms